correct_abundances - ക്ലൗഡിൽ ഓൺലൈനിൽ

പട്ടിക:

NAME

correct_abundances - ജീനോം സമൃദ്ധിയുടെ സമാനത തിരുത്തൽ ഘട്ടം പ്രവർത്തിപ്പിക്കുക

സിനോപ്സിസ്

ശരിയായ_സമൃദ്ധി പേരുകൾ

വിവരണം

സമാനത തിരുത്തൽ ഘട്ടം പ്രവർത്തിപ്പിക്കുക.

കുറിപ്പ്: റീഡ് മാപ്പറുകൾ കൈകൊണ്ട് പ്രവർത്തിപ്പിക്കാനോ സമാനത സൃഷ്ടിക്കാനോ സാധിക്കുമെങ്കിലും
മാട്രിക്സ് മാനുവലായി, നൽകിയിരിക്കുന്ന പൈത്തൺ സ്ക്രിപ്റ്റുകൾ 'run_mappers.py' ഉപയോഗിക്കാൻ ഞങ്ങൾ ശക്തമായി ശുപാർശ ചെയ്യുന്നു
കൂടാതെ 'create_similarity_matrix.py'.

ഓപ്ഷനുകൾ

പേരുകൾ: പേരുകൾ ഫയലിന്റെ ഫയൽനാമം; പ്ലെയിൻ ടെക്സ്റ്റ് നെയിംസ് ഫയലിൽ ഓരോന്നിനും ഒരു പേര് ഉണ്ടായിരിക്കണം
ലൈൻ. മുഴുവൻ അൽഗോരിതത്തിലും പേര് ഐഡന്റിഫയറായി ഉപയോഗിക്കുന്നു.

-h, --സഹായിക്കൂ
ഈ സഹായ സന്ദേശം കാണിച്ച് പുറത്തുകടക്കുക

-m SMAT, --സാമ്യം-മാട്രിക്സ്=SMAT
സാമ്യത മാട്രിക്സ് ഫയലിലേക്കുള്ള പാത. സമാനത മാട്രിക്സ് അതേ രീതിയിൽ സൃഷ്ടിക്കണം
NAMES ഫയൽ. [സ്ഥിരസ്ഥിതി: ./similarity_matrix.npy]

-s SAM, --samfiles=SAM
മാപ്പർ സൃഷ്‌ടിച്ച SAM ഫയലുകളിലേക്ക് ചൂണ്ടിക്കാണിക്കുന്ന പാറ്റേൺ. പേരിനുള്ള പ്ലെയ്‌സ്‌ഹോൾഡർ
"%s" ആണ്. [സ്ഥിരസ്ഥിതി: ./SAM/%s.sam]

-b ബൂട്ട്, --ബൂട്ട്സ്ട്രാപ്പ്-സാമ്പിളുകൾ=ബൂട്ട്
ബൂട്ട്സ്ട്രാപ്പ് സാമ്പിളുകളുടെ എണ്ണം സജ്ജമാക്കുക. ബൂട്ട്‌സ്‌ട്രാപ്പിംഗ് പ്രവർത്തനരഹിതമാക്കാൻ 1 ഉപയോഗിക്കുക [സ്ഥിരസ്ഥിതി: 100]

-o പുറത്ത്, --ഔട്ട്പുട്ട്=ഔട്ട്
ഫലങ്ങൾ അടങ്ങുന്ന പ്ലെയിൻ ടെക്സ്റ്റ് ഔട്ട്പുട്ട് ഫയൽ. [സ്ഥിരസ്ഥിതി: ./results.txt]

onworks.net സേവനങ്ങൾ ഉപയോഗിച്ച് ഓൺലൈനിൽ correct_abundances ഉപയോഗിക്കുക