Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator അല്ലെങ്കിൽ MAC OS ഓൺലൈൻ എമുലേറ്റർ എന്നിങ്ങനെയുള്ള ഞങ്ങളുടെ ഒന്നിലധികം സൗജന്യ ഓൺലൈൻ വർക്ക്സ്റ്റേഷനുകളിലൊന്ന് ഉപയോഗിച്ച് OnWorks സൗജന്യ ഹോസ്റ്റിംഗ് ദാതാവിൽ പ്രവർത്തിപ്പിക്കാവുന്ന കമാൻഡ് create_matrix ആണിത്.
പട്ടിക:
NAME
create_matrix - ജനിതക സമൃദ്ധിയുടെ സാമ്യം കണക്കാക്കുക
സിനോപ്സിസ്
create_matrix [ഓപ്ഷനുകൾ] പേരുകൾ
വിവരണം
സാമ്യത മാട്രിക്സ് കണക്കാക്കുക.
ആദ്യം, ഒരു റീഡ് സിമുലേറ്റർ ഉപയോഗിച്ച് ഓരോ റഫറൻസ് ജീനോമിനും ഒരു കൂട്ടം റീഡുകൾ അനുകരിക്കുന്നു.
core/tools.py വഴി വ്യക്തമാക്കിയിട്ടുണ്ട് -s. രണ്ടാമതായി, ഓരോ സ്പീഷീസിന്റെയും സിമുലേറ്റഡ് റീഡുകൾ മാപ്പ് ചെയ്യുന്നു
വ്യക്തമാക്കിയ മാപ്പർ ഉപയോഗിക്കുന്ന എല്ലാ റഫറൻസ് ജീനോമുകൾക്കെതിരെയും -m. മൂന്നാമതായി, ഫലം
സാമ്യത മാട്രിക്സ് കണക്കാക്കാൻ SAM- ഫയലുകൾ വിശകലനം ചെയ്യുന്നു. സാമ്യത മാട്രിക്സ് സംഭരിച്ചിരിക്കുന്നു
ഒരു നമ്പ് ഫയലായി (-o).
ഓപ്ഷനുകൾ
പേരുകൾ പേരുകൾ ഫയലിന്റെ ഫയലിന്റെ പേര്; പ്ലെയിൻ ടെക്സ്റ്റ് നെയിംസ് ഫയലിൽ ഓരോന്നിനും ഒരു പേര് ഉണ്ടായിരിക്കണം
ലൈൻ. മുഴുവൻ അൽഗോരിതത്തിലും പേര് ഐഡന്റിഫയറായി ഉപയോഗിക്കുന്നു.
-h, --സഹായിക്കൂ
ഈ സഹായ സന്ദേശം കാണിച്ച് പുറത്തുകടക്കുക
-s സിമുലേറ്റർ, --സിമുലേറ്റർ=സിമുലേറ്റർ
core/tools.py ൽ നിർവചിച്ചിരിക്കുന്ന റീഡ് സിമുലേറ്ററിന്റെ ഐഡന്റിഫയർ [സ്ഥിരസ്ഥിതി: ഒന്നുമില്ല]
-r REF, --റഫറൻസ്=അവലംബത്തിന്റെ
റീഡ് സിമുലേറ്ററിനായുള്ള റഫറൻസ് സീക്വൻസ് ഫയൽ പാറ്റേൺ. പേരിന്റെ പ്ലെയ്‌സ്‌ഹോൾഡർ ആണ്
"%s". [സ്ഥിരസ്ഥിതി: ./ref/%s.fasta]
-m മാപ്പർ, --മാപ്പർ=മാപ്പർ
core/tools.py എന്നതിൽ നിർവചിച്ചിരിക്കുന്ന മാപ്പറിന്റെ ഐഡന്റിഫയർ [സ്ഥിരസ്ഥിതി: ഒന്നുമില്ല]
-i സൂചിക, --സൂചിക=INDEX
റീഡ് മാപ്പർക്കുള്ള റഫറൻസ് സൂചിക ഫയലുകൾ. പേരിന്റെ പ്ലെയ്‌സ്‌ഹോൾഡർ "%s" ആണ്.
[സ്ഥിരസ്ഥിതി: ./ref/%s.fasta]
-t TEMP, --താപനില=TEMP
താൽക്കാലിക സിമുലേറ്റഡ് ഡാറ്റാസെറ്റുകളും SAM ഫയലുകളും സംഭരിക്കുന്നതിനുള്ള ഡയറക്ടറി. [സ്ഥിരസ്ഥിതി: ./temp]
-o പുറത്ത്, --ഔട്ട്പുട്ട്=ഔട്ട്
ഔട്ട്പുട്ട് സമാനത മാട്രിക്സ് ഫയൽ. [സ്ഥിരസ്ഥിതി: ./similarity_matrix.npy]
onworks.net സേവനങ്ങൾ ഉപയോഗിച്ച് create_matrix ഓൺലൈനായി ഉപയോഗിക്കുക
