fuzznuce - ക്ലൗഡിൽ ഓൺലൈനിൽ

പട്ടിക:

NAME

fuzznuc - ന്യൂക്ലിയോടൈഡ് സീക്വൻസുകളിലെ പാറ്റേണുകൾക്കായി തിരയുക

സിനോപ്സിസ്

ഫസ്നുക് - ക്രമം തുടർച്ചയായി -മാതൃക പാറ്റേൺ - പൂരകമായി ബൂളിയൻ - outfile റിപ്പോർട്ട്

ഫസ്നുക് -ഹെൽപ്പ്

വിവരണം

ഫസ്നുക് EMBOSS-ൽ നിന്നുള്ള ഒരു കമാൻഡ് ലൈൻ പ്രോഗ്രാമാണ് ("യൂറോപ്യൻ മോളിക്യുലാർ ബയോളജി ഓപ്പൺ
സോഫ്റ്റ്‌വെയർ സ്യൂട്ട്"). ഇത് "Nucleic:Motifs" കമാൻഡ് ഗ്രൂപ്പിന്റെ(കളുടെ) ഭാഗമാണ്.

ഓപ്ഷനുകൾ

ഇൻപുട്ട് വിഭാഗം
- ക്രമം തുടർച്ചയായി

-മാതൃക പാറ്റേൺ
ന്യൂക്ലിയോടൈഡുകൾക്കായുള്ള സാധാരണ IUPAC ഒറ്റ-അക്ഷര കോഡുകൾ ഉപയോഗിക്കുന്നു. ചിഹ്നം 'n' ആണ്
ഏതെങ്കിലും ന്യൂക്ലിയോടൈഡ് സ്വീകരിക്കുന്ന ഒരു സ്ഥാനത്തിന് ഉപയോഗിക്കുന്നു. അവ്യക്തതകൾ സൂചിപ്പിക്കുന്നത്
ഒരു നിശ്ചിത സ്ഥാനത്തിനായി സ്വീകാര്യമായ ന്യൂക്ലിയോടൈഡുകൾ പട്ടികപ്പെടുത്തുന്നു, ചതുര പരന്തീസിസുകൾക്കിടയിൽ '[
]'. ഉദാഹരണത്തിന്: [ACG] എന്നത് A അല്ലെങ്കിൽ C അല്ലെങ്കിൽ G എന്നതിന്റെ ചുരുക്കെഴുത്താണ്. അവ്യക്തതകളും സൂചിപ്പിക്കുന്നത്
ഒരു ജോടി ചുരുണ്ട ബ്രാക്കറ്റുകൾക്കിടയിൽ '{ }' അംഗീകൃതമല്ലാത്ത ന്യൂക്ലിയോടൈഡുകൾ പട്ടികപ്പെടുത്തുന്നു
ഒരു നിശ്ചിത സ്ഥാനത്ത്. ഉദാഹരണത്തിന്: {AG} എന്നത് A, G എന്നിവ ഒഴികെയുള്ള എല്ലാ ന്യൂക്ലിയോടൈഡുകളേയും സൂചിപ്പിക്കുന്നു
ഒരു പാറ്റേണിലെ മൂലകത്തെ അതിന്റെ അയൽക്കാരിൽ നിന്ന് '-' കൊണ്ട് വേർതിരിച്ചിരിക്കുന്നു. (fuznuc-ൽ ഓപ്ഷണൽ).
പാറ്റേണിന്റെ ഒരു ഘടകത്തിന്റെ ആവർത്തനം ആ ഘടകം പിന്തുടരുന്നതിലൂടെ സൂചിപ്പിക്കാം
ഒരു സംഖ്യാ മൂല്യം അല്ലെങ്കിൽ പരാന്തീസിസ് തമ്മിലുള്ള ഒരു സംഖ്യാ ശ്രേണി. ഉദാഹരണങ്ങൾ: N(3)
NNN, N(2,4) NN അല്ലെങ്കിൽ NNN അല്ലെങ്കിൽ NNNN എന്നിവയുമായി യോജിക്കുന്നു. ഒരു പാറ്റേൺ ആയിരിക്കുമ്പോൾ
ഒരു ശ്രേണിയുടെ 5' അല്ലെങ്കിൽ 3' അവസാനം വരെ പരിമിതപ്പെടുത്തിയിരിക്കുന്നു, ആ പാറ്റേൺ ഒന്നുകിൽ a യിൽ ആരംഭിക്കുന്നു
'<' ചിഹ്നം അല്ലെങ്കിൽ യഥാക്രമം ഒരു '>' ചിഹ്നത്തിൽ അവസാനിക്കുന്നു. ഒരു കാലഘട്ടം പാറ്റേൺ അവസാനിപ്പിക്കുന്നു.
(fuznuc-ൽ ഓപ്ഷണൽ). ഉദാഹരണത്തിന്, [CG](5)TG{A}N(1,5)C

വിപുലമായ വിഭാഗം
- പൂരകമായി ബൂളിയൻ
സ്ഥിര മൂല്യം: എൻ

ഔട്ട്പുട്ട് വിഭാഗം
- outfile റിപ്പോർട്ട്

onworks.net സേവനങ്ങൾ ഉപയോഗിച്ച് ഓൺലൈനിൽ fuzznuce ഉപയോഗിക്കുക