fuzzproe - ക്ലൗഡിൽ ഓൺലൈനിൽ

പട്ടിക:

NAME

fuzzpro - പ്രോട്ടീൻ സീക്വൻസുകളിലെ പാറ്റേണുകൾക്കായി തിരയുക

സിനോപ്സിസ്

fuzzpro - ക്രമം തുടർച്ചയായി -മാതൃക പാറ്റേൺ - outfile റിപ്പോർട്ട്

fuzzpro -ഹെൽപ്പ്

വിവരണം

fuzzpro EMBOSS-ൽ നിന്നുള്ള ഒരു കമാൻഡ് ലൈൻ പ്രോഗ്രാമാണ് ("യൂറോപ്യൻ മോളിക്യുലാർ ബയോളജി ഓപ്പൺ
സോഫ്റ്റ്‌വെയർ സ്യൂട്ട്"). ഇത് "പ്രോട്ടീൻ:മോട്ടിഫ്സ്" കമാൻഡ് ഗ്രൂപ്പിന്റെ(കളുടെ) ഭാഗമാണ്.

ഓപ്ഷനുകൾ

ഇൻപുട്ട് വിഭാഗം
- ക്രമം തുടർച്ചയായി

-മാതൃക പാറ്റേൺ
അമിനോ ആസിഡുകൾക്കായുള്ള സാധാരണ IUPAC ഒറ്റ-അക്ഷര കോഡുകൾ ഉപയോഗിക്കുന്നു. ചിഹ്നം 'x' ആണ്
ഏതെങ്കിലും അമിനോ ആസിഡ് സ്വീകരിക്കുന്ന ഒരു സ്ഥാനത്തിന് ഉപയോഗിക്കുന്നു. അവ്യക്തതകൾ സൂചിപ്പിക്കുന്നത്
സ്ക്വയർ പരാൻതീസിസുകൾക്കിടയിൽ ഒരു നിശ്ചിത സ്ഥാനത്തിനായി സ്വീകാര്യമായ അമിനോ ആസിഡുകൾ പട്ടികപ്പെടുത്തുന്നു.
]'. ഉദാഹരണത്തിന്: [ALT] എന്നാൽ Ala അല്ലെങ്കിൽ Leu അല്ലെങ്കിൽ Thr. വഴി അവ്യക്തതകളും സൂചിപ്പിക്കുന്നു
ഒരു ജോടി ചുരുണ്ട ബ്രാക്കറ്റുകൾക്കിടയിൽ '{ }' സ്വീകരിക്കാത്ത അമിനോ ആസിഡുകൾ പട്ടികപ്പെടുത്തുന്നു
ഒരു നിശ്ചിത സ്ഥാനത്ത്. ഉദാഹരണത്തിന്: {AM} എന്നത് അലയും മെറ്റും ഒഴികെയുള്ള ഏതൊരു അമിനോ ആസിഡിനെയും സൂചിപ്പിക്കുന്നു.
ഒരു പാറ്റേണിലെ ഓരോ മൂലകവും അതിന്റെ അയൽക്കാരിൽ നിന്ന് '-' കൊണ്ട് വേർതിരിച്ചിരിക്കുന്നു. (ഓപ്ഷണൽ ഇൻ
fuzzpro). പാറ്റേണിന്റെ ഒരു ഘടകത്തിന്റെ ആവർത്തനം അത് പിന്തുടരുന്നതിലൂടെ സൂചിപ്പിക്കാം
ഒരു സംഖ്യാ മൂല്യമുള്ള മൂലകം അല്ലെങ്കിൽ പരാൻതീസിസ് തമ്മിലുള്ള സംഖ്യാ ശ്രേണി. ഉദാഹരണങ്ങൾ:
x(3) xxx, x(2,4) xx അല്ലെങ്കിൽ xxx അല്ലെങ്കിൽ xxxx എന്നിവയുമായി യോജിക്കുന്നു. എപ്പോൾ എ
പാറ്റേൺ ഒരു ശ്രേണിയുടെ N- അല്ലെങ്കിൽ C-ടെർമിനലിലേക്ക് പരിമിതപ്പെടുത്തിയിരിക്കുന്നു, ആ പാറ്റേൺ
ഒന്നുകിൽ ഒരു '<' ചിഹ്നത്തിൽ ആരംഭിക്കുന്നു അല്ലെങ്കിൽ യഥാക്രമം ഒരു '>' ചിഹ്നത്തിൽ അവസാനിക്കുന്നു. ഒരു കാലഘട്ടം അവസാനിക്കുന്നു
മാതൃക. (ഫസ്പ്രോയിൽ ഓപ്ഷണൽ). ഉദാഹരണത്തിന്, [DE](2)HS{P}X(2)PX(2,4)C

ഔട്ട്പുട്ട് വിഭാഗം
- outfile റിപ്പോർട്ട്

onworks.net സേവനങ്ങൾ ഉപയോഗിച്ച് fuzzproe ഓൺലൈനിൽ ഉപയോഗിക്കുക