Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator അല്ലെങ്കിൽ MAC OS ഓൺലൈൻ എമുലേറ്റർ എന്നിങ്ങനെയുള്ള ഞങ്ങളുടെ ഒന്നിലധികം സൗജന്യ ഓൺലൈൻ വർക്ക്സ്റ്റേഷനുകളിലൊന്ന് ഉപയോഗിച്ച് OnWorks സൗജന്യ ഹോസ്റ്റിംഗ് ദാതാവിൽ പ്രവർത്തിപ്പിക്കാവുന്ന gt-chseqids എന്ന കമാൻഡാണിത്.
പട്ടിക:
NAME
gt-chseqids - ഒരു മാപ്പിംഗ് ഫയലിൽ നൽകിയിരിക്കുന്ന മാപ്പിംഗ് വഴി സീക്വൻസ് ഐഡികൾ മാറ്റുക.
സിനോപ്സിസ്
gt ചെസെക്വിഡുകൾ [ഓപ്ഷൻ ...] mapping_file [GFF3_file]
വിവരണം
- അടുക്കുക [അതെ|ഇല്ല]
സീക്വൻസ് ഐഡികൾ മാറ്റിയതിന് ശേഷം GFF3 സവിശേഷതകൾ അടുക്കുക (മെമ്മറി ഉപഭോഗം
ഇൻപുട്ട് ഫയൽ വലുപ്പത്തിന് ആനുപാതികമായി) (സ്ഥിരസ്ഥിതി: ഇല്ല)
-v [അതെ|ഇല്ല]
വാചാലനായിരിക്കുക (സ്ഥിരസ്ഥിതി: ഇല്ല)
-o [ഫയലിന്റെ പേര്]
നിർദ്ദിഷ്ട ഫയലിലേക്ക് ഔട്ട്പുട്ട് റീഡയറക്ട് ചെയ്യുക (സ്ഥിരസ്ഥിതി: നിർവചിക്കാത്തത്)
-ജിസിപ്പ് [അതെ|ഇല്ല]
gzip കംപ്രസ് ചെയ്ത ഔട്ട്പുട്ട് ഫയൽ എഴുതുക (സ്ഥിരസ്ഥിതി: ഇല്ല)
-bzip2 [അതെ|ഇല്ല]
bzip2 കംപ്രസ് ചെയ്ത ഔട്ട്പുട്ട് ഫയൽ എഴുതുക (സ്ഥിരസ്ഥിതി: ഇല്ല)
-ശക്തിയാണ് [അതെ|ഇല്ല]
ഔട്ട്പുട്ട് ഫയലിലേക്ക് എഴുതാൻ നിർബന്ധിക്കുക (സ്ഥിരസ്ഥിതി: ഇല്ല)
-ഹെൽപ്പ്
സഹായം പ്രദർശിപ്പിക്കുകയും പുറത്തുകടക്കുകയും ചെയ്യുക
-പതിപ്പ്
പതിപ്പ് വിവരങ്ങൾ പ്രദർശിപ്പിക്കുകയും പുറത്തുകടക്കുകയും ചെയ്യുക
mapping_file-നുള്ള ഫയൽ ഫോർമാറ്റ്:
വിതരണം ചെയ്ത മാപ്പിംഗ് ഫയൽ "chseqids" എന്ന് പേരുള്ള ഒരു മാപ്പിംഗ് ടേബിളിനെ നിർവചിക്കുന്നു. ഇത് മാപ്പ് ചെയ്യുന്നു
മറ്റ് പേരുകളിലേക്ക് GFF3_file-ൽ നൽകിയിരിക്കുന്ന sequence-region എൻട്രികൾ. എന്ന് നിർവചിക്കാം
താഴെ:
സെക്വിഡ്സ് = {
chr1 = "seq1",
chr2 = "seq2"
}
ഈ ഉദാഹരണം ഉപയോഗിക്കുമ്പോൾ, "chr1" എന്ന എല്ലാ സീക്വൻസ് ഐഡികളും "seq1" ആയും എല്ലാം മാറും
സീക്വൻസ് ഐഡികൾ “chr2” മുതൽ “seq2” വരെ.
റിപ്പോർട്ടുചെയ്യുന്നു ബഗുകൾ
ബഗുകൾ റിപ്പോർട്ട് ചെയ്യുക[ഇമെയിൽ പരിരക്ഷിച്ചിരിക്കുന്നു]>.
onworks.net സേവനങ്ങൾ ഉപയോഗിച്ച് gt-chseqids ഓൺലൈനായി ഉപയോഗിക്കുക
