മായാത്തത് - ക്ലൗഡിൽ ഓൺലൈനിൽ

പട്ടിക:

NAME

മായാത്ത - ജൈവ പരിണാമത്തിന്റെ ശക്തവും വഴക്കമുള്ളതുമായ സിമുലേറ്റർ

സിനോപ്സിസ്

മായാത്ത

കമാൻഡ് ലൈൻ വഴി ഓപ്ഷനുകളൊന്നും കൈമാറാൻ കഴിയില്ല.

വിവരണം

മായാത്ത മൾട്ടി-പാർട്ടീഷൻ ചെയ്ത ന്യൂക്ലിയോടൈഡ്, അമിനോ ആസിഡ് അല്ലെങ്കിൽ കോഡോണിന്റെ പരിണാമം അനുകരിക്കാൻ കഴിയും
തുടർച്ചയായി ചേർക്കൽ, ഇല്ലാതാക്കൽ, പകരം വയ്ക്കൽ എന്നീ പ്രക്രിയകളിലൂടെ ഡാറ്റ സെറ്റ് ചെയ്യുന്നു
സമയം. എല്ലാ പൊതുവായ പരിണാമ മാതൃകകളും പിന്തുണയ്ക്കുന്നു.

എന്നതിനായുള്ള മുഴുവൻ ഡോക്യുമെന്റേഷൻ മായാത്ത എന്നതിന് കീഴിൽ ലഭ്യമാണ്
/usr/share/doc/indelible/help/index.html.

കോൺഫിഗറേഷൻ

മായാത്ത എന്ന പേരിലുള്ള ഒരു ഫയലിൽ നിന്ന് ഒരു സിമുലേഷൻ റൺ ചെയ്യുന്നതിനുള്ള ക്രമീകരണങ്ങൾ വായിക്കുന്നു control.txt ലെ
നിലവിലെ ഡയറക്ടറി. ഫയൽ ബ്ലോക്കുകളായി വിഭജിക്കപ്പെട്ടിരിക്കുന്നു, ഓരോ ബ്ലോക്കും ഒന്ന് നിയന്ത്രിക്കുന്നു
സിമുലേഷന്റെ പ്രത്യേക വശം. ബ്ലോക്കുകളിൽ കൂടുതൽ ഉപ ബ്ലോക്കുകൾ അടങ്ങിയിരിക്കാം. അഭിപ്രായങ്ങൾ കഴിയും
C അല്ലെങ്കിൽ C++ ശൈലിയിൽ നൽകണം. എങ്കിൽ മായാത്ത ഒരു കൺട്രോൾ ഫയൽ ഇല്ലാതെ എക്സിക്യൂട്ട് ചെയ്യുന്നു, an
ഉദാഹരണ ഫയൽ സൃഷ്ടിക്കപ്പെടുന്നു.

[TYPE] ടൈപ്പ് ചെയ്യുക
എല്ലാ നിയന്ത്രണ ഫയലുകളും a-യിൽ തുടങ്ങണം തരം തടയുക. സാധ്യമായ തരങ്ങളാണ് ന്യൂക്ലിയോടൈഡ്,
അമിനോ അമ്ലം, ഒപ്പം കോഡൺ.

[ക്രമീകരണങ്ങൾ]
ഈ ബ്ലോക്ക് ഔട്ട്‌പുട്ട് ഫയൽ തരങ്ങൾ പോലെയുള്ള അനിവാര്യമല്ലാത്ത ഉപയോക്തൃ മുൻഗണനകൾ വ്യക്തമാക്കുന്നു
ഫോർമാറ്റുകൾ, റാൻഡം നമ്പർ ജനറേറ്ററിനുള്ള വിത്തുകൾ, ഔട്ട്പുട്ട് ചെയ്യേണ്ടതുണ്ടോ എന്ന് വിശദമായി
റിപ്പോർട്ടുകൾ.

[മോഡൽ] മാതൃകനാമം
ഈ ബ്ലോക്ക് സിമുലേഷനായി ഉപയോഗിക്കുന്നതിന് ഒരു പുതിയ പരിണാമ മാതൃക ആരംഭിക്കുന്നു. ദി
സബ്സ്റ്റിറ്റ്യൂഷൻ മോഡലുകൾ, ഇൻഡെൽ-റേറ്റുകൾ, കോഡൺ-സൈറ്റ് എന്നിവ ഉൾപ്പെടെയുള്ള പ്രത്യേക പാരാമീറ്ററുകൾ
ഉപമോഡലുകൾ വഴിയാണ് മോഡലുകൾ നിയന്ത്രിക്കുന്നത്. മാതൃകനാമം നിങ്ങൾ തിരഞ്ഞെടുക്കുന്ന ഏത് പേരുമാകാം.

[വൃക്ഷം] വൃക്ഷത്തിന്റെ പേര് ന്യൂക്ക്
നൽകിയിരിക്കുന്ന പേരിനൊപ്പം ഒരു ഗൈഡ്-ട്രീ വ്യക്തമാക്കാൻ ഈ ബ്ലോക്ക് ഉപയോഗിക്കുന്നു വൃക്ഷത്തിന്റെ പേര്.
പരിണാമ ദൂരങ്ങളെ വൃക്ഷത്തിന്റെ ശാഖകളുടെ നീളമായി പ്രതിനിധീകരിക്കുന്നു NEWICK
ഫോർമാറ്റ്.

[ശാഖകൾ]
ഈ ബ്ലോക്കുകൾ നോൺ-സ്റ്റേഷണറി, നോൺ-ഹോമോജെനസ് പ്രക്രിയകൾ അനുകരിക്കാൻ ഉപയോഗിക്കുന്നു.
ഗൈഡ്-ട്രീ അനുവദിക്കുന്ന വിവിധ ശാഖകളിൽ വ്യത്യസ്ത മോഡലുകൾ വ്യക്തമാക്കാൻ കഴിയും
ശാഖകൾക്ക് പകരത്തിന്റെ വിവിധ മോഡലുകൾ ഉണ്ടായിരിക്കണം, ഇൻഡൽ നീളം വിതരണം, നിരക്ക്
വൈവിധ്യം, അടിസ്ഥാന ഘടന തുടങ്ങിയവ.

[പാർട്ടിഷനുകൾ] വിഭജനനാമം
ഓരോ റണ്ണിലും ഒന്നിലധികം സീക്വൻസ് പാർട്ടീഷനുകൾ അനുകരിക്കാൻ കഴിയും. ഓരോ വിഭജനത്തിനും
ഗൈഡ്-ട്രീ, പരിണാമ മാതൃക, സീക്വൻസ് ദൈർഘ്യം എന്നിവ വ്യക്തമാക്കേണ്ടതുണ്ട്.

[പരിണാമം]
ഈ ബ്ലോക്കിനുള്ളിൽ ഒരു പാർട്ടീഷന്റെ ഒന്നിലധികം പകർപ്പുകൾ സൃഷ്ടിക്കപ്പെട്ടേക്കാം.

പകർപ്പവകാശ

പകർപ്പവകാശം © 2010 വില്യം ഫ്ലെച്ചർ ലൈസൻസ് GPLv3+: GNU GPL പതിപ്പ് 3 അല്ലെങ്കിൽ അതിനുശേഷമുള്ളത്.
ഇതൊരു സ്വതന്ത്ര സോഫ്‌റ്റ്‌വെയർ ആണ്: നിങ്ങൾക്ക് ഇത് മാറ്റാനും പുനർവിതരണം ചെയ്യാനും സ്വാതന്ത്ര്യമുണ്ട്. വാറന്റി ഇല്ല,
നിയമം അനുവദിക്കുന്ന പരിധി വരെ. മുഴുവൻ ലൈസൻസ് വാചകവും ഇവിടെ ലഭ്യമാണ്
<http://gnu.org/licenses/gpl.html>.

എക്സലൻസ്

വില്യം ഫ്ലെച്ചറും സിഹെങ് യാങ്ങും (2009). മായാത്തത്: ബയോളജിക്കൽ എ ഫ്ലെക്സിബിൾ സിമുലേറ്റർ
അനുക്രമ പരിണാമം, മോളികുലർ ജീവശാസ്ത്രം ഒപ്പം പരിണാമം, 26(8): 1879- XXX.

onworks.net സേവനങ്ങൾ ഉപയോഗിച്ച് മായാത്ത ഓൺലൈൻ ഉപയോഗിക്കുക