ടിഎംസ്കോർ - ക്ലൗഡിൽ ഓൺലൈനിൽ

പട്ടിക:

NAME

TM-സ്കോർ - രണ്ട് പ്രോട്ടീനുകളുടെ ടോപ്പോളജികളുടെ സമാനത കണക്കാക്കുന്നതിനുള്ള ഒരു അൽഗോരിതം
ഘടനകളെ

പതിപ്പ്

ഈ ഡോക്യുമെന്റേഷൻ 2011/01/30-ന് പുറത്തിറക്കിയ TM-സ്കോർ പതിപ്പിനെ സൂചിപ്പിക്കുന്നു

സിനോപ്സിസ്

1. 'മോഡൽ', 'നേറ്റീവ്' എന്നിവ താരതമ്യം ചെയ്യാൻ TM-സ്കോർ പ്രവർത്തിപ്പിക്കുക:

ടിഎംസ്കോർ മോഡൽ സ്വദേശി

2. നിയുക്ത d0 ഉപയോഗിച്ച് TM-സ്കോർ പ്രവർത്തിപ്പിക്കുക, ഉദാ 5 Angstroms:

ടിഎംസ്കോർ മോഡൽ നേറ്റീവ് -d 5

3. സൂപ്പർപോസിഷൻ ഔട്ട്പുട്ട് ഉപയോഗിച്ച് TM-സ്കോർ പ്രവർത്തിപ്പിക്കുക, ഉദാ 'TM.sup', റാസ്മോളിൽ കാണുക:

ടിഎംസ്കോർ മോഡൽ നേറ്റീവ് -o TM.sup
rasmol -സ്ക്രിപ്റ്റ് TM.sup

വിവരണം

ഈ പ്രോഗ്രാം രണ്ട് പ്രോട്ടീൻ ഘടനകളെ താരതമ്യം ചെയ്യുകയും മികച്ച സൂപ്പർപോസിഷൻ തിരിച്ചറിയുകയും ചെയ്യുന്നു
ഏറ്റവും ഉയർന്ന TM-സ്കോർ ഉണ്ട്. ഇൻപുട്ട് ഘടനകൾ PDB ഫോർമാറ്റിലായിരിക്കണം. സ്ഥിരസ്ഥിതിയായി, TM-സ്കോർ
രണ്ടാമത്തെ പ്രോട്ടീൻ നോർമലൈസ് ചെയ്യുന്നു. ഉപയോക്താക്കൾക്ക് ലളിതമായി ഒരു ഹ്രസ്വ നിർദ്ദേശം ലഭിക്കും
ആർഗ്യുമെന്റുകളില്ലാതെ പ്രോഗ്രാം പ്രവർത്തിപ്പിക്കുന്നു.

ഓപ്ഷനുകൾ

-o filename.sup നിർദ്ദിഷ്ട ഫയലിലേക്കുള്ള സൂപ്പർപോസിഷൻ ഔട്ട്പുട്ട് ചെയ്യുന്നു,
റാസ്മോളിൽ ഉപയോഗിക്കാൻ അനുയോജ്യം.

-d മൂല്യം നിശ്ചിത ആംഗ്‌സ്‌ട്രോമുകളുടെ സംഖ്യയിലേക്ക് d0 സജ്ജീകരിക്കുന്നു.

onworks.net സേവനങ്ങൾ ഉപയോഗിച്ച് TMscore ഓൺലൈനായി ഉപയോഗിക്കുക