codonPhyML എന്ന് പേരിട്ടിരിക്കുന്ന Linux ആപ്പാണിത്, ഇതിന്റെ ഏറ്റവും പുതിയ റിലീസ് codonPhyML_dev_1.00_201407.24.zip ആയി ഡൗൺലോഡ് ചെയ്യാം. വർക്ക് സ്റ്റേഷനുകൾക്കായുള്ള സൗജന്യ ഹോസ്റ്റിംഗ് ദാതാവായ OnWorks-ൽ ഇത് ഓൺലൈനായി പ്രവർത്തിപ്പിക്കാം.
CodonPhyML എന്ന് പേരിട്ടിരിക്കുന്ന ഈ ആപ്പ് OnWorks-നൊപ്പം സൗജന്യമായി ഓൺലൈനായി ഡൗൺലോഡ് ചെയ്ത് പ്രവർത്തിപ്പിക്കുക.
ഈ ആപ്പ് പ്രവർത്തിപ്പിക്കുന്നതിന് ഈ നിർദ്ദേശങ്ങൾ പാലിക്കുക:
- 1. നിങ്ങളുടെ പിസിയിൽ ഈ ആപ്ലിക്കേഷൻ ഡൗൺലോഡ് ചെയ്തു.
- 2. ഞങ്ങളുടെ ഫയൽ മാനേജറിൽ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX എന്നതിൽ നിങ്ങൾക്ക് ആവശ്യമുള്ള ഉപയോക്തൃനാമം നൽകുക.
- 3. അത്തരം ഫയൽമാനേജറിൽ ഈ ആപ്ലിക്കേഷൻ അപ്‌ലോഡ് ചെയ്യുക.
- 4. ഈ വെബ്സൈറ്റിൽ നിന്ന് OnWorks Linux ഓൺലൈനോ Windows ഓൺലൈൻ എമുലേറ്ററോ MACOS ഓൺലൈൻ എമുലേറ്ററോ ആരംഭിക്കുക.
- 5. നിങ്ങൾ ഇപ്പോൾ ആരംഭിച്ച OnWorks Linux OS-ൽ നിന്ന്, നിങ്ങൾക്ക് ആവശ്യമുള്ള ഉപയോക്തൃനാമത്തോടുകൂടിയ ഞങ്ങളുടെ ഫയൽ മാനേജർ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX എന്നതിലേക്ക് പോകുക.
- 6. ആപ്ലിക്കേഷൻ ഡൌൺലോഡ് ചെയ്യുക, അത് ഇൻസ്റ്റാൾ ചെയ്ത് പ്രവർത്തിപ്പിക്കുക.
സ്ക്രീൻഷോട്ടുകൾ
Ad
codonPhyML
വിവരണം
codonPhyML ഫൈലോജെനി പുനർനിർമ്മാണത്തിൽ പരിണാമത്തിന്റെ മാർക്കോവിയൻ കോഡൺ മാതൃകകൾ ഉപയോഗിക്കുന്നു. ഇൻപുട്ടായി ഡിഎൻഎ സീക്വൻസുകളാൽ വിശേഷിപ്പിക്കപ്പെടുന്ന ഒരു കൂട്ടം സ്പീഷീസുകൾ നൽകിയാൽ, കോഡോൺഫിഎംഎൽ അവയുടെ പരിണാമ ബന്ധത്തെ നന്നായി വിവരിക്കുന്ന ഫൈലോജെനെറ്റിക് ട്രീയെ തിരികെ നൽകും. codonPhyML വിവരിക്കുന്ന ഞങ്ങളുടെ പേപ്പർ "മോളിക്യുലർ ബയോളജി ആൻഡ് എവല്യൂഷൻ" (MBE) ജേണലിൽ പ്രസിദ്ധീകരിച്ചു. കൂടുതൽ വിവരങ്ങൾക്ക്, ലിങ്ക് പിന്തുടരുക: http://mbe.oxfordjournals.org/content/30/6/1270. codonPhyML MBE യുടെ കവറിൽ ഉണ്ട്! ഇത് പരിശോധിക്കുക (ഓഗസ്റ്റ് 2013): http://mbe.oxfordjournals.org/content/30/8.toc.CodonPhyML-ന്റെ മൾട്ടിമോഡൽ പതിപ്പിന്, ദയവായി 'codonphyml_multi.tgz' ടാർബോൾ ഉപയോഗിക്കുക.
സവിശേഷതകൾ
- പരിണാമത്തിന്റെ മാർക്കോവിയൻ കോഡൺ മോഡലുകൾ: ഗോൾഡ്മാൻ & യാങ് 1994, മ്യൂസ് & ഗൗട്ട് 1994, കോസിയോൾ et al 2007, ഷ്നൈഡർ et al 2005, യാപ്പ് et al 2010
- NNI, SPR ട്രീ ടോപ്പോളജി തിരയൽ ഹ്യൂറിസ്റ്റിക്
- പരമാവധി സാധ്യത കണക്കാക്കിയ സബ്സ്റ്റിറ്റ്യൂഷൻ റേറ്റ് പാരാമീറ്ററുകൾ
- OpenMP വഴി മൾട്ടികോർ പിന്തുണ
- വ്യത്യസ്ത മോഡലുകളിലുടനീളം (അതായത് AA, NT, CODON) താരതമ്യപ്പെടുത്താവുന്ന സാധ്യത
പ്രേക്ഷകർ
ശാസ്ത്രം/ഗവേഷണം, വിദ്യാഭ്യാസം
ഉപയോക്തൃ ഇന്റർഫേസ്
കൺസോൾ/ടെർമിനൽ, കമാൻഡ്-ലൈൻ
പ്രോഗ്രാമിംഗ് ഭാഷ
C
https://sourceforge.net/projects/codonphyml/ എന്നതിൽ നിന്നും ലഭിക്കാവുന്ന ഒരു ആപ്ലിക്കേഷനാണിത്. ഞങ്ങളുടെ സൗജന്യ ഓപ്പറേറ്റീവ് സിസ്റ്റങ്ങളിലൊന്നിൽ നിന്ന് ഏറ്റവും എളുപ്പമുള്ള രീതിയിൽ ഓൺലൈനിൽ പ്രവർത്തിപ്പിക്കുന്നതിനായി ഇത് OnWorks-ൽ ഹോസ്റ്റ് ചെയ്‌തിരിക്കുന്നു.
