ഇതാണ് VarScan എന്ന് പേരിട്ടിരിക്കുന്ന Linux ആപ്പ്, ഇതിന്റെ ഏറ്റവും പുതിയ പതിപ്പ് VarScan.v2.3.9.jar ആയി ഡൗൺലോഡ് ചെയ്യാം. വർക്ക്സ്റ്റേഷനുകൾക്കായുള്ള സൗജന്യ ഹോസ്റ്റിംഗ് ദാതാവായ OnWorks-ൽ ഇത് ഓൺലൈനായി പ്രവർത്തിപ്പിക്കാം.
വാർസ്കാൻ എന്ന് പേരിട്ടിരിക്കുന്ന ഈ ആപ്പ് ഓൺ‌വർക്കിനൊപ്പം സൗജന്യമായി ഓൺലൈനായി ഡൗൺലോഡ് ചെയ്ത് പ്രവർത്തിപ്പിക്കുക.
ഈ ആപ്പ് പ്രവർത്തിപ്പിക്കുന്നതിന് ഈ നിർദ്ദേശങ്ങൾ പാലിക്കുക:
- 1. നിങ്ങളുടെ പിസിയിൽ ഈ ആപ്ലിക്കേഷൻ ഡൗൺലോഡ് ചെയ്തു.
- 2. ഞങ്ങളുടെ ഫയൽ മാനേജറിൽ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX എന്നതിൽ നിങ്ങൾക്ക് ആവശ്യമുള്ള ഉപയോക്തൃനാമം നൽകുക.
- 3. അത്തരം ഫയൽമാനേജറിൽ ഈ ആപ്ലിക്കേഷൻ അപ്‌ലോഡ് ചെയ്യുക.
- 4. ഈ വെബ്സൈറ്റിൽ നിന്ന് OnWorks Linux ഓൺലൈനോ Windows ഓൺലൈൻ എമുലേറ്ററോ MACOS ഓൺലൈൻ എമുലേറ്ററോ ആരംഭിക്കുക.
- 5. നിങ്ങൾ ഇപ്പോൾ ആരംഭിച്ച OnWorks Linux OS-ൽ നിന്ന്, നിങ്ങൾക്ക് ആവശ്യമുള്ള ഉപയോക്തൃനാമത്തോടുകൂടിയ ഞങ്ങളുടെ ഫയൽ മാനേജർ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX എന്നതിലേക്ക് പോകുക.
- 6. ആപ്ലിക്കേഷൻ ഡൌൺലോഡ് ചെയ്യുക, അത് ഇൻസ്റ്റാൾ ചെയ്ത് പ്രവർത്തിപ്പിക്കുക.
സ്ക്രീൻഷോട്ടുകൾ
Ad
വാർസ്കാൻ
വിവരണം
വൻതോതിലുള്ള പാരലൽ സീക്വൻസിംഗിൽ വേരിയന്റ് കണ്ടെത്തൽ. ഒരു സാമ്പിളിനായി, SNP-കൾ, ഇൻഡലുകൾ, സമവായ ജനിതകരൂപങ്ങൾ എന്നിവ വിളിക്കുന്നു. ട്യൂമർ-സാധാരണ ജോഡികൾക്കായി, ഓരോ വേരിയന്റിനെയും ജെർംലൈൻ, സോമാറ്റിക് അല്ലെങ്കിൽ LOH എന്നിങ്ങനെ തരംതിരിക്കുകയും സോമാറ്റിക് കോപ്പി നമ്പർ മാറ്റങ്ങളും കണ്ടെത്തുകയും ചെയ്യുന്നു. ഏറ്റവും പുതിയ പതിപ്പ് GITHUB-ൽ ലഭ്യമാണ്
സവിശേഷതകൾ
- SAMtools പൈലപ്പ് ഫയലുകളിൽ നിന്ന് SNP-കളേയും ഇൻഡലുകളേയും വിളിക്കുന്നു
- കവറേജ്, റീഡ് ഡെപ്ത്, വേരിയന്റ് ഫ്രീക്വൻസി, അടിസ്ഥാന നിലവാരം എന്നിവ പ്രകാരം വേരിയന്റുകൾ ഫിൽട്ടർ ചെയ്യുന്നു
- ട്യൂമർ-നോർമൽ ജോഡികൾക്കായി സോമാറ്റിക് സ്റ്റാറ്റസ് (സോമാറ്റിക്, ജെർംലൈൻ, LOH) നിർണ്ണയിക്കുന്നു
- വേരിയന്റുകളുടെ രണ്ട് ലിസ്റ്റുകൾ താരതമ്യം ചെയ്യുന്നു, ലയിപ്പിക്കുന്നു, വിഭജിക്കുന്നു
- ഒരു കൂട്ടം ടാർഗെറ്റ് സ്ഥാനങ്ങളിലേക്കോ ടാർഗെറ്റ് പ്രദേശങ്ങളിലേക്കോ വേരിയന്റ് കോളുകൾ പരിമിതപ്പെടുത്തുന്നു
- വാണിജ്യേതര ഉപയോഗത്തിന് സൗജന്യം.
പ്രേക്ഷകർ
ശാസ്ത്രം/ഗവേഷണം
ഉപയോക്തൃ ഇന്റർഫേസ്
കമാൻഡ്-ലൈൻ
പ്രോഗ്രാമിംഗ് ഭാഷ
ജാവ
Categories
ഇത് https://sourceforge.net/projects/varscan/ എന്നതിൽ നിന്നും ലഭിക്കാവുന്ന ഒരു ആപ്ലിക്കേഷനാണ്. ഞങ്ങളുടെ സൗജന്യ ഓപ്പറേറ്റീവ് സിസ്റ്റങ്ങളിലൊന്നിൽ നിന്ന് ഏറ്റവും എളുപ്പമുള്ള രീതിയിൽ ഓൺലൈനിൽ പ്രവർത്തിപ്പിക്കുന്നതിനായി ഇത് OnWorks-ൽ ഹോസ്റ്റ് ചെയ്‌തിരിക്കുന്നു.
