gsasnp2 എന്ന് പേരിട്ടിരിക്കുന്ന വിൻഡോസ് ആപ്പാണിത്, ഇതിന്റെ ഏറ്റവും പുതിയ പതിപ്പ് gsasnp2-linux-cmd-ubuntu.zip ആയി ഡൗൺലോഡ് ചെയ്യാം. വർക്ക് സ്റ്റേഷനുകൾക്കായുള്ള സൗജന്യ ഹോസ്റ്റിംഗ് ദാതാവായ OnWorks-ൽ ഇത് ഓൺലൈനായി പ്രവർത്തിപ്പിക്കാം.
Gsasnp2 എന്ന് പേരിട്ടിരിക്കുന്ന ഈ ആപ്പ് OnWorks-നൊപ്പം സൗജന്യമായി ഓൺലൈനായി ഡൗൺലോഡ് ചെയ്ത് പ്രവർത്തിപ്പിക്കുക.
ഈ ആപ്പ് പ്രവർത്തിപ്പിക്കുന്നതിന് ഈ നിർദ്ദേശങ്ങൾ പാലിക്കുക:
- 1. നിങ്ങളുടെ പിസിയിൽ ഈ ആപ്ലിക്കേഷൻ ഡൗൺലോഡ് ചെയ്തു.
- 2. ഞങ്ങളുടെ ഫയൽ മാനേജറിൽ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX എന്നതിൽ നിങ്ങൾക്ക് ആവശ്യമുള്ള ഉപയോക്തൃനാമം നൽകുക.
- 3. അത്തരം ഫയൽമാനേജറിൽ ഈ ആപ്ലിക്കേഷൻ അപ്‌ലോഡ് ചെയ്യുക.
- 4. ഈ വെബ്‌സൈറ്റിൽ നിന്ന് ഏതെങ്കിലും OS OnWorks ഓൺലൈൻ എമുലേറ്റർ ആരംഭിക്കുക, എന്നാൽ മികച്ച Windows ഓൺലൈൻ എമുലേറ്റർ.
- 5. നിങ്ങൾ ഇപ്പോൾ ആരംഭിച്ച OnWorks Windows OS-ൽ നിന്ന്, നിങ്ങൾക്ക് ആവശ്യമുള്ള ഉപയോക്തൃനാമത്തോടുകൂടിയ ഞങ്ങളുടെ ഫയൽ മാനേജർ https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX എന്നതിലേക്ക് പോകുക.
- 6. ആപ്ലിക്കേഷൻ ഡൗൺലോഡ് ചെയ്ത് ഇൻസ്റ്റാൾ ചെയ്യുക.
- 7. നിങ്ങളുടെ Linux വിതരണ സോഫ്റ്റ്‌വെയർ ശേഖരണങ്ങളിൽ നിന്ന് വൈൻ ഡൗൺലോഡ് ചെയ്യുക. ഇൻസ്റ്റാൾ ചെയ്‌തുകഴിഞ്ഞാൽ, വൈൻ ഉപയോഗിച്ച് അവ പ്രവർത്തിപ്പിക്കുന്നതിന് നിങ്ങൾക്ക് ആപ്പിൽ ഡബിൾ ക്ലിക്ക് ചെയ്യാം. ജനപ്രിയ വിൻഡോസ് പ്രോഗ്രാമുകളും ഗെയിമുകളും ഇൻസ്റ്റാൾ ചെയ്യാൻ സഹായിക്കുന്ന വൈനിലൂടെയുള്ള ഫാൻസി ഇന്റർഫേസായ PlayOnLinux നിങ്ങൾക്ക് പരീക്ഷിക്കാവുന്നതാണ്.
ലിനക്സിൽ വിൻഡോസ് സോഫ്റ്റ്‌വെയർ പ്രവർത്തിപ്പിക്കാനുള്ള ഒരു മാർഗമാണ് വൈൻ, എന്നാൽ വിൻഡോസ് ആവശ്യമില്ല. ഏത് ലിനക്സ് ഡെസ്ക്ടോപ്പിലും നേരിട്ട് വിൻഡോസ് പ്രോഗ്രാമുകൾ പ്രവർത്തിപ്പിക്കാൻ കഴിയുന്ന ഒരു ഓപ്പൺ സോഴ്സ് വിൻഡോസ് കോംപാറ്റിബിലിറ്റി ലെയറാണ് വൈൻ. അടിസ്ഥാനപരമായി, വൈൻ ആദ്യം മുതൽ ആവശ്യത്തിന് വിൻഡോസ് വീണ്ടും നടപ്പിലാക്കാൻ ശ്രമിക്കുന്നു, അതുവഴി യഥാർത്ഥത്തിൽ വിൻഡോസ് ആവശ്യമില്ലാതെ തന്നെ എല്ലാ വിൻഡോസ് ആപ്ലിക്കേഷനുകളും പ്രവർത്തിപ്പിക്കാൻ കഴിയും.
സ്ക്രീൻഷോട്ടുകൾ
Ad
gsasnp2
വിവരണം
* GSA-SNP2 GSA-SNP യുടെ പിൻഗാമിയാണ് (Nam et al. 2010, NAR വെബ് സെർവർ പ്രശ്നം). GSA-SNP2 മാനുഷിക GWAS സംഗ്രഹ ഡാറ്റ (rs നമ്പറുകൾ, p-മൂല്യങ്ങൾ) അല്ലെങ്കിൽ ജീൻ തിരിച്ചുള്ള p-മൂല്യങ്ങൾ സ്വീകരിക്കുകയും തന്നിരിക്കുന്ന ഫിനോടൈപ്പുമായി ബന്ധപ്പെട്ട ജീനുകളാൽ 'സമ്പുഷ്ടമായ' പാത്ത്‌വേ ജീനുകളെ ഔട്ട്പുട്ട് ചെയ്യുകയും ചെയ്യുന്നു. ബന്ധപ്പെട്ട പാതകളിൽ പ്രാദേശികവും ആഗോളവുമായ പ്രോട്ടീൻ ഇന്ററാക്ഷൻ നെറ്റ്‌വർക്കുകളും ഇത് നൽകുന്നു.
* ലേഖനം: SYoon, HCTNguyen, YJYoo, JKim, BBaik, SKim, JKim, SKim, DNam, "GSA-SNP2 ഉപയോഗിച്ച് GWAS സംഗ്രഹ ഡാറ്റയുടെ കാര്യക്ഷമമായ പാത സമ്പുഷ്ടീകരണവും നെറ്റ്‌വർക്ക് വിശകലനവും", ന്യൂക്ലിക് ആസിഡുകൾ ഗവേഷണം, വാല്യം. 46(10), e60(2018).
* പബ്മെഡ് ഐഡി: 29562348
* DOI: 10.1093/nar/gky175
-> PREDA കണ്ടെത്തുന്നതിന് പ്രോഗ്രാമിനെ അനുവദിക്കുന്നതിന് ദയവായി നിങ്ങളുടെ ഇന്റൻസീവ് ടെസ്റ്റ് ഫോൾഡറിലേക്ക് (അതായത് LINUX, MAC അല്ലെങ്കിൽ Windows നിർദ്ദിഷ്ട ഫോൾഡറിലേക്ക്) 'ഡാറ്റ' ഫോൾഡറിന്റെ ഒരു പകർപ്പ് നീക്കുക അല്ലെങ്കിൽ നിർമ്മിക്കുക.
* അപ്ഡേറ്റ് കുറിപ്പ്:
-> Sep-1-2020: Ubuntu-20.04-ന് ഒരു അപ്ഡേറ്റ് ചേർക്കുക. നിങ്ങൾക്ക് ബൂസ്റ്റ് ലൈബ്രറി ഇൻസ്റ്റാൾ ചെയ്യേണ്ടതുണ്ട് (sudo apt-get install libboost-all-dev)
-> Mar-7-2018: ഔട്ട്പുട്ട് ഫയലിലെ തലക്കെട്ട് നിബന്ധനകൾ പരിഷ്കരിക്കുക
സവിശേഷതകൾ
- 1/ 'ഡീസെന്റ് ടൈപ്പ് I എറർ കൺട്രോൾ' ഇനിപ്പറയുന്ന രണ്ട് പ്രക്രിയകൾ വഴി കൈവരിച്ചു: എ) മോണോടോൺ ക്യൂബിക് സ്‌പ്ലൈൻ ട്രെൻഡ് കർവ് ഉപയോഗിച്ച് ഓരോ ജീനിനും അസൈൻ ചെയ്‌തിരിക്കുന്ന എസ്‌എൻ‌പികളുടെ എണ്ണത്തിലേക്ക് ജീൻ സ്‌കോറുകൾ 'ക്രമീകരിച്ചിരിക്കുന്നു'. ബി) ഓരോ പാത്ത്‌വേയിലും ഉയർന്ന ഇന്റർ-ജീൻ പരസ്പര ബന്ധമുള്ള തൊട്ടടുത്തുള്ള ജീനുകൾ നീക്കം ചെയ്തു
- 2/ റാൻഡം സെറ്റ് മോഡലിനെ അടിസ്ഥാനമാക്കിയുള്ള 'ഹൈ പവറും ഫാസ്റ്റ് കമ്പ്യൂട്ടേഷനും'
- 3/ 'ക്രിട്ടിക്കൽ ഫ്രീ പാരാമീറ്റർ ഇല്ല'
- 4/ അംഗ ജീനുകൾക്കിടയിലെ 'പ്രോട്ടീൻ ഇന്ററാക്ഷൻ നെറ്റ്‌വർക്കുകൾ' സുപ്രധാന പാതകൾക്കായി ദൃശ്യവൽക്കരിച്ചു. പ്രധാനപ്പെട്ട പാതകൾക്കകത്തും ഉടനീളമുള്ള കോർ സബ് നെറ്റ്‌വർക്കുകൾക്ക് മുൻഗണന നൽകാൻ ഈ ഫംഗ്‌ഷൻ ഉപയോക്താവിനെ പ്രാപ്‌തമാക്കുന്നു. STRING, HIPPIE നെറ്റ്‌വർക്കുകൾ നിലവിൽ നൽകിയിരിക്കുന്നു
- 5/ 'ഉപയോഗിക്കാൻ എളുപ്പമാണ്': ഇതിന് GWAS സംഗ്രഹ ഡാറ്റ (അല്ലെങ്കിൽ ജീൻ പി-മൂല്യങ്ങൾ) മാത്രമേ ആവശ്യമുള്ളൂ, ഫലങ്ങൾ ലഭിക്കാൻ ഒന്നോ രണ്ടോ മിനിറ്റ് മാത്രമേ എടുക്കൂ. മറ്റ് ശക്തമായ സ്വയം ഉൾക്കൊള്ളുന്ന പാത്ത്‌വേ ടൂളുകൾക്ക് SNP കോറിലേഷൻ ഇൻപുട്ടും ആവശ്യമുണ്ട് കൂടാതെ കൂടുതൽ സമയമെടുക്കും. ഉപയോക്താവിന് അവരുടെ സ്വന്തം പാത്ത്‌വേ ജീൻ സെറ്റുകളും പ്രോട്ടീൻ ഇന്ററാക്ഷൻ നെറ്റ്‌വർക്കുകളും അപ്‌ലോഡ് ചെയ്യാൻ കഴിയും.
ഉപയോക്തൃ ഇന്റർഫേസ്
Win32 (MS വിൻഡോസ്), കമാൻഡ്-ലൈൻ
പ്രോഗ്രാമിംഗ് ഭാഷ
C++, PHP, JavaScript
Categories
https://sourceforge.net/projects/gsasnp2/ എന്നതിൽ നിന്നും ലഭിക്കാവുന്ന ഒരു ആപ്ലിക്കേഷനാണിത്. ഞങ്ങളുടെ സൗജന്യ ഓപ്പറേറ്റീവ് സിസ്റ്റങ്ങളിലൊന്നിൽ നിന്ന് ഏറ്റവും എളുപ്പമുള്ള രീതിയിൽ ഓൺലൈനിൽ പ്രവർത്തിപ്പിക്കുന്നതിനായി ഇത് OnWorks-ൽ ഹോസ്റ്റ് ചെയ്‌തിരിക്കുന്നു.
