Ini ialah arahan bp_seqretp yang boleh dijalankan dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks menggunakan salah satu daripada berbilang stesen kerja dalam talian percuma kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MAC OS.
JADUAL:
NAMA
bp_seqret - pelaksanaan bioperl pengambilan jujukan dari db tempatan (seperti EMBOSS seqret)
PENGGUNAAN
bp_seqret [-f/--format outputformat] [-o/--out/--outfile outfile] [-d/--db dbname]
[-i/--id/-s/--seqname seqname1]
Contoh penggunaan:
bp_seqret -f fasta -db db.fa -i seq1 -i seq2 > output.fas
bp_seqret db.fa:seq1 output.fas
bp_seqret db.fa:seq1 -o output.fas
bp_seqret -db db.fa -o output.fas seq1 seq2 seq3
bp_seqret -db db.fa seq1 seq2 seq3 output.fas
bp_seqret -db db.fa seq1 seq2 seq3 - > output.fas
DB dijangka menjadi fail jujukan berformat Fasta dengan berbilang jujukan.
Format output ialah Fasta secara lalai.
Jika tiada nama fail output diberikan maka output ditulis kepada STDOUT. Menyediakan '-' sebagai
nama fail output akan mencapai perkara yang sama.
Gunakan bp_seqretp dalam talian menggunakan perkhidmatan onworks.net
