Ini ialah arahan cmtk-unwarp_image_phantom yang boleh dijalankan dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks menggunakan salah satu daripada berbilang stesen kerja dalam talian percuma kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MAC OS.
JADUAL:
NAMA
unwarp_image_phantom - Buat transformasi untuk membongkar imej berdasarkan hantu
Penerangan
SINOPSIS
unwarp_image_phantom InputPhantom InputImage OutputXform
DESCRIPTION
Alat ini mengira sama ada penjelmaan polinomial atau ubah bentuk bentuk bebas B-spline kepada
membongkar imej. Transformasi adalah berdasarkan tanda tempat yang dijangka dan dikesan dalam
imej hantu struktur yang diperoleh pada pengimbas yang sama. Gunakan 'detect_adni_phantom'
alat untuk mengesan tanda tempat ADNI Phantom dalam imej dan menjana hantu
fail penerangan yang sesuai untuk digunakan dengan alat ini.
PILIHAN
Global Toolkit Pilihan (ini adalah dikongsi by semua CMTK alatan)
- membantu
Tulis senarai pilihan baris arahan asas kepada output standard.
--bantu-semua
Tulis senarai lengkap pilihan baris perintah asas dan lanjutan kepada output standard.
--wiki
Tulis senarai pilihan baris arahan kepada output standard dalam penanda MediaWiki.
--lelaki
Tulis sumber halaman manual dalam penanda 'nroff' kepada output standard.
--versi
Tulis versi kit alat kepada output standard.
--gema
Tulis baris arahan semasa kepada output standard.
--peringkat-verbose
Tetapkan tahap verbositi.
--verbose, -v
Naikkan tahap verbositi sebanyak 1 (ditamatkan; disokong untuk keserasian ke belakang).
--benang
Tetapkan bilangan maksimum utas selari (untuk utas POSIX dan OpenMP).
Pemasangan Pilihan
--fit- songsang
Sesuaikan penjelmaan songsang (pemetaan sebenar kepada lokasi mercu tanda yang dijangkakan). Ini adalah
berguna untuk mengira peta pembetulan volum Jacobian (menggunakan 'reformatx') tanpa
perlu menyongsangkan secara berangka penjelmaan unwarping yang dipasang.
--sesuai-ke hadapan
Transformasi ke hadapan sesuai (pemetaan dijangka ke lokasi mercu tanda sebenar). Ini adalah
berguna untuk membetulkan imej melalui relicing (menggunakan 'reformatx'). [Ini is yang
lalai]
Transformasi model
--spline
Fit B-spline ubah bentuk bebas bentuk.
--poli
Sesuaikan transformasi polinomial. [Ini is yang lalai]
Polinomial Pemasangan Pilihan (dengan --poli)
--ijazah
Darjah penjelmaan polinomial yang dipasang. [Lalai: 4]
B-Spline Pemasangan Pilihan (dengan --spline)
--spasi-cp-akhir
Jarak grid titik kawalan akhir transformasi B-spline keluaran. [Lalai: 0]
--cp-akhir malap
Dimensi grid titik kawalan akhir (iaitu, bilangan titik kawalan) output B-
transformasi spline. Untuk disediakan sebagai 'dimX,dimY,dimZ'. [Lalai: TIADA]
--peringkat
Bilangan tahap dalam prosedur penghampiran B-spline berbilang peringkat. [Lalai: 1]
--lelaran-setiap-peringkat
Bilangan maksimum lelaran kemas kini pekali spline setiap tahap dalam pelbagai peringkat
Prosedur penghampiran B-spline. [Lalai: 100]
--rms-ambang
Ambang untuk penambahbaikan relatif baki pemasangan RMS. Lelaran yang sesuai
tamat jika (rmsAfterUpdate-rmsBeforeUpdate)/rmsBeforeUpdate < threshold.
[Lalai: 0]
--tidak-sesuai-affin
Lumpuhkan pemasangan transformasi afin untuk memulakan spline. Sebaliknya, muatkan spline
secara langsung. Ini biasanya memberikan hasil yang lebih teruk dan tidak digalakkan.
PENGARANG
Torsten Rohlfing, dengan sumbangan daripada Michael P. Hasak, Greg Jefferis, Calvin R.
Maurer, Daniel B. Russakoff, dan Yaroslav Halchenko
Gunakan cmtk-unwarp_image_phantom dalam talian menggunakan perkhidmatan onworks.net
