Ini ialah arahan delta2blocks yang boleh dijalankan dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks menggunakan salah satu daripada berbilang stesen kerja dalam talian percuma kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MAC OS.
JADUAL:
NAMA
delta2blocks - alat tambahan untuk mummer daripada tampalan mugsy untuk mengisih penjajaran
delta2maf - alat tambahan untuk mummer daripada tampalan mugsy untuk mengisih penjajaran
SINOPSIS
delta2blocks [pilihan]<refID><qryID>
delta2maf [pilihan]<refID><qryID>
DESCRIPTION
-h Paparkan maklumat bantuan
-q Isih penjajaran mengikut koordinat mula pertanyaan
-r Isih penjajaran mengikut koordinat mula rujukan
-w int Tetapkan lebar skrin - lalai ialah 60
-x int Tetapkan jenis matriks - lalai ialah 2 (BLOSUM 62), pilihan lain termasuk 1 (BLOSUM 45)
dan 3 (BLOSUM 80)
nota: hanya mempunyai kesan pada penjajaran asid amino
Input ialah output .delta sama ada program "nucmer" atau "promer" yang dihantar pada
baris perintah.
Output adalah untuk stdout, dan terdiri daripada semua penjajaran antara pertanyaan dan rujukan
urutan yang dikenal pasti pada baris arahan.
NOTA: Tiada pengisihan dilakukan secara lalai, oleh itu penjajaran akan dipesan seperti yang terdapat dalam
yang input.
Gunakan delta2blocks dalam talian menggunakan perkhidmatan onworks.net
