Ini ialah arahan edialigne yang boleh dijalankan dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks menggunakan salah satu daripada berbilang stesen kerja dalam talian percuma kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MAC OS.
JADUAL:
NAMA
edialign - Penjajaran berbilang tempatan jujukan
SINOPSIS
edialign -urutan seqset -nucmode senarai -revcomp boolean [-tindihw pemilihan]
[-hubungan senarai] [-maxfragl integer] -fragmat boolean -fragsim integer
[- skornya boolean] [-ambang terapung] -topeng boolean -dostar boolean
-starnum integer -fail luar fail luar -outseq seqoutall
edialign -membantu
DESCRIPTION
edialign ialah program baris arahan daripada EMBOSS (“The European Molecular Biology Open
Suite Perisian”). Ia adalah sebahagian daripada kumpulan arahan "Alignment:Multiple".
PILIHAN
Input seksyen
-urutan seqset
Tambahan seksyen
-nucmode senarai
Mod penjajaran jujukan asid nukleik (mudah, diterjemahkan atau bercampur) Nilai lalai: n
-revcomp boolean
Nilai lalai: N
-tindihw pemilihan
Secara lalai pemberat pertindihan digunakan apabila Nseq =<35 tetapi anda boleh menetapkan ini kepada 'ya' atau
'tidak' Nilai lalai: lalai (apabila Nseq =< 35)
-hubungan senarai
Kaedah pengelompokan untuk membina pepohon jujukan (UPGMA, pautan minimum atau maksimum
kaitan) Nilai lalai: UPGMA
-maxfragl integer
Nilai lalai: 40
-fragmat boolean
Nilai lalai: N
-fragsim integer
Nilai lalai: 4
- skornya boolean
Nilai lalai: N
-ambang terapung
Nilai lalai: 0.0
Output seksyen
-topeng boolean
Nilai lalai: N
-dostar boolean
Nilai lalai: N
-starnum integer
Nilai lalai: 4
-fail luar fail luar
-outseq seqoutall
Gunakan edialigne dalam talian menggunakan perkhidmatan onworks.net
