Ini ialah arahan EDTSurf yang boleh dijalankan dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks menggunakan salah satu daripada berbilang stesen kerja dalam talian percuma kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MAC OS.
JADUAL:
NAMA
EDTSurf - pembinaan permukaan makromolekul yang cepat dan tepat
SINOPSIS
EDTSurf -i pdbname...
DESCRIPTION
EDTSurf ialah program sumber terbuka untuk membina permukaan triangulasi untuk makromolekul. Ia
menghasilkan tiga permukaan makromolekul utama: permukaan van der Waals, boleh diakses dengan pelarut
permukaan dan permukaan molekul (permukaan terkecuali pelarut). EDTsurf juga mengenal pasti rongga
yang berada di dalam makromolekul.
PILIHAN
-o nama luar
-t 1-MC 2-VCMC
-s 1-VWS 2-SAS 3-MS 4-SES
-c 1-rantai 2-atom 3 tulen
-p jejari kuar [0,2.0]
-f faktor skala (0,20.0]
-h 1 masuk dan keluar 2 keluar 3 masuk
output1: outname.ply
output2: outname.asa
output3: outname-cav.pdb
Gunakan EDTSurf dalam talian menggunakan perkhidmatan onworks.net