Ini ialah arahan fastq_masker yang boleh dijalankan dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks menggunakan salah satu daripada berbilang stesen kerja dalam talian percuma kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MAC OS.
JADUAL:
NAMA
fastq_masker - Menyamarkan nukleotida dengan 'N' (atau aksara lain) berdasarkan kualiti
DESCRIPTION
penggunaan: fastq_masker [-h] [-v] [-q N] [-r C] [-z] [-i INFILE] [-o OUTFILE] Sebahagian daripada FASTX
Toolkit 0.0.14 oleh A. Gordon ([e-mel dilindungi])
[-h] = Skrin bantuan berguna ini.
[-q N] = Ambang kualiti - nukleotida dengan kualiti yang lebih rendah akan bertopeng
Lalai adalah 10.
[-r C] = Gantikan nukleotida berkualiti rendah dengan aksara C. Lalai ialah 'N'
[-z] = Mampatkan output dengan GZIP.
[-i INFILE]
= Fail input FASTQ. lalai ialah STDIN.
[-o OUTFILE] = Fail keluaran FASTQ. lalai ialah STDOUT. [-v] = Verbose -
laporkan bilangan urutan.
Jika [-o] dinyatakan,
laporan akan dicetak ke STDOUT.
Jika [-o] tidak dinyatakan (dan output pergi ke STDOUT), laporan akan dicetak ke
STDERR.
Gunakan fastq_masker dalam talian menggunakan perkhidmatan onworks.net
