Ini ialah arahan fsl-5.0-core yang boleh dijalankan dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks menggunakan salah satu daripada berbilang stesen kerja dalam talian percuma kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MAC OS.
JADUAL:
NAMA
fsl - alat analisis untuk pengimejan otak FMRI, MRI dan DTI
DESCRIPTION
FSL ialah kit alat yang komprehensif untuk analisis data pengimejan otak perubatan. Ia
menyediakan alatan untuk prapemprosesan data, pengekstrakan otak, pendaftaran imej serta a
spektrum luas analisis statistik. FSL menyediakan GUI yang mudah digunakan.
FSL memerlukan beberapa pembolehubah persekitaran untuk ditetapkan dengan betul. Untuk mencapai ini,
sila dapatkan skrip konfigurasi daripada /etc/fsl/5.0/fsl.sh. Satu cara untuk melakukan ini
secara automatik adalah untuk menambah baris yang mengandungi
. /etc/fsl/5.0/fsl.sh
ke fail .bashrc dalam direktori rumah pengguna (atau fail yang sepadan untuk cangkerang lain
daripada bash). Anda mungkin perlu mencipta fail sedemikian terlebih dahulu.
Sebagai alternatif, pakej Debian memasang symlinks untuk semua alat FSL dalam / usr / bin Bahawa
jaga memuatkan konfigurasi yang sesuai secara automatik. Nama symlink ialah
diawali dengan yang sepadan FSL versi untuk mengelakkan konflik nama fail dan membenarkan
berbilang versi untuk wujud bersama pada sistem yang sama. Sebagai contoh, yang slicer perintah adalah
tersedia sebagai fsl5.0-slicer. Sila ambil perhatian bahawa untuk menggunakan FSL alat melalui symlinks ini adalah
tidak diperlukan untuk melaksanakan prosedur persediaan yang diterangkan di atas. Walau bagaimanapun, kemudahan ini
ciri adalah khusus Debian. Skrip yang menggunakan arahan FSL dan bertujuan untuk dikongsi
dengan yang lain harus bergantung pada nama arahan yang tidak ditetapkan dan pembolehubah persekitaran FSL
persediaan.
. FSL antara muka pengguna kadangkala merujuk kepada an FSLDIR. Pada sistem Debian ini
/usr/share/fsl/5.0 untuk FSL versi 5.0.
FSL dokumentasi dan bantuan dalam talian disediakan oleh fsl-5.0-doc pakej.
Soalan mengenai penggunaan FSL atau teori berkaitan boleh disiarkan di FSL mel
senarai (Lihat http://www.jiscmail.ac.uk/lists/fsl.html).
PENYELARAAN
FSL boleh dikonfigurasikan untuk menyerahkan kerja kepada Sun Gridengine (SGE) yang sedang berjalan. Walaupun tidak semua
kefungsian yang dilaksanakan dalam FSL menyokong penyelarasan jenis ini, yang paling menuntut
alat pemprosesan (cth POSSUM dan FDT) lakukan.
FSL sepatutnya boleh menggunakan SGE walaupun pembolehubah persekitaran SGE_ROOT tidak ditetapkan, seperti dalam
kes pakej Debian SGE. Untuk mendayakan pemprosesan kelompok hanya tetapkan
FSLPARALLEL=1
dalam shell di mana FSL sedang berjalan. Ini boleh didayakan secara kekal dalam
/etc/fsl/5.0/fsl.sh
atau berdasarkan kes demi kes.
Gunakan fsl-5.0-core dalam talian menggunakan perkhidmatan onworks.net
