Ini ialah garniere arahan yang boleh dijalankan dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks menggunakan salah satu daripada berbilang stesen kerja dalam talian percuma kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MAC OS.
JADUAL:
NAMA
garnier - Meramalkan struktur sekunder protein menggunakan kaedah GOR
SINOPSIS
garnier -urutan seqall -idc integer -fail luar melaporkan
garnier -membantu
DESCRIPTION
garnier ialah program baris arahan daripada EMBOSS (“The European Molecular Biology Open
Suite Perisian”). Ia adalah sebahagian daripada kumpulan arahan "Protein:2D Structure".
PILIHAN
Input seksyen
-urutan seqall
Maju seksyen
-idc integer
Dalam kertas kerja mereka, GOR menyebut bahawa jika anda mengetahui sesuatu tentang struktur sekunder
kandungan protein yang anda analisis, anda boleh melakukan lebih baik dalam ramalan. 'idc' ialah sebuah
indeks ke dalam set tatasusunan, dharr[] dan dsarr[], yang menyediakan 'pemalar keputusan'
(dch, dcs), yang merupakan offset yang digunakan pada pemberat untuk heliks dan helaian
(lanjutkan) terma. Jadi, idc=0 mengatakan jangan gunakan offset pemalar keputusan, dan idc=1 hingga 6
menunjukkan bahawa pelbagai kombinasi dch, dcs ofset harus digunakan.
Output seksyen
-fail luar melaporkan
Gunakan garniere dalam talian menggunakan perkhidmatan onworks.net
