Ini ialah arahan gt-chseqids yang boleh dijalankan dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks menggunakan salah satu daripada berbilang stesen kerja dalam talian percuma kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MAC OS.
JADUAL:
NAMA
gt-chseqids - Tukar id jujukan dengan pemetaan yang diberikan dalam fail pemetaan.
SINOPSIS
gt chseqids [pilihan ...] mapping_file [GFF3_file]
DESCRIPTION
-susun [ya|tidak]
susun ciri GFF3 selepas menukar id jujukan (penggunaan memori ialah
berkadar dengan saiz fail input) (lalai: tidak)
-v [ya|tidak]
bertele-tele (lalai: tidak)
-o [nama fail]
ubah hala output ke fail yang ditentukan (lalai: tidak ditentukan)
-gzip [ya|tidak]
tulis fail output termampat gzip (lalai: tidak)
-bzip2 [ya|tidak]
tulis fail output termampat bzip2 (lalai: tidak)
-paksa [ya|tidak]
paksa menulis ke fail output (lalai: tidak)
-membantu
paparan bantuan dan keluar
-turun
memaparkan maklumat versi dan keluar
Format fail untuk mapping_file:
Fail pemetaan yang dibekalkan mentakrifkan jadual pemetaan bernama "chseqids". Ia memetakan
entri sequence-region diberikan dalam GFF3_file kepada nama lain. Ia boleh ditakrifkan sebagai
ikut:
chseqids = {
chr1 = "seq1",
chr2 = "seq2"
}
Apabila contoh ini digunakan, semua id jujukan "chr1" akan ditukar kepada "seq1" dan semua
id jujukan "chr2" kepada "seq2".
PELAPORAN BUANG
Laporkan pepijat kepada[e-mel dilindungi]>.
Gunakan gt-chseqids dalam talian menggunakan perkhidmatan onworks.net
