mia-3ddistance-stats - Dalam Talian di Awan

JADUAL:

NAMA

mia-3ddistance-stats - Nilaikan statistik jarak untuk dua imej berlabel.

SINOPSIS

mia-3ddistance-stats -i -r -o [pilihan]

DESCRIPTION

mia-3ddistance-stats Program ini digunakan untuk menilai jarak antara sama
kawasan berlabel dalam dua imej. Fail output ialah fail csv yang mengandungi jarak untuk
setiap koordinat berlabel dalam imej ujian dalam bentuk berikut:

label, n-sampel, jarak, jarak,...

Program R mudah untuk mendapatkan beberapa statistik setiap label daripada data ini akan kelihatan seperti

args <- commandArgs(TRUE)
data <- read.csv(args[1], header=FALSE)
untuk ( i dalam 1:dim(data)[1] ) {
baris <- data[i,]
label <- as.integer(line[1])
julat_hujung <- 2 + as.numeric(baris[2])
s <- as.numeric(line[3:end_range])
hasil <- sprintf("%d %8.4f %8.4f %8.4f %8.4f0
label, min, sqrt(var(s)), median(s), max(s)
kucing (hasil)
}

PILIHAN

Fail-IO
-i --in-labels=(input, diperlukan); io
imej label input Untuk jenis fail yang disokong lihat PLUGINS:3dimage/io

-r --ref-labels=(input, diperlukan); io
imej label rujukan Untuk jenis fail yang disokong lihat PLUGINS:3dimage/io

-l --label-map=(input); tali
pemetaan pilihan nombor label

-o --out-file=(output, diperlukan); tali
nama fail keluaran untuk menulis jarak ke. Fail output ialah fail csv,
mengandungi jarak yang disenaraikan untuk setiap label.

Bantuan & Info
-V --verbose=amaran
verbositi output, cetak mesej tahap tertentu dan keutamaan yang lebih tinggi.
Keutamaan yang disokong bermula pada tahap terendah ialah:
maklumat ‐ Mesej tahap rendah
mengesan ‐ Surih panggilan fungsi
gagal ‐ Laporkan kegagalan ujian
amaran ‐ Amaran
kesilapan ‐ Laporkan ralat
debug ‐ Keluaran nyahpepijat
mesej ‐ Mesej biasa
maut ‐ Laporkan hanya kesilapan yang membawa maut

--hak cipta
mencetak maklumat hak cipta

-h --bantuan
cetak bantuan ini

-? --penggunaan
mencetak bantuan ringkas

--versi
cetak nombor versi dan keluar

Pemprosesan
--benang=-1
Bilangan maksimum benang untuk digunakan untuk pemprosesan, Nombor ini harus lebih rendah
atau sama dengan bilangan teras pemproses logik dalam mesin. (-1:
anggaran automatik).Bilangan maksimum benang untuk digunakan untuk pemprosesan,Ini
nombor hendaklah lebih rendah atau sama dengan bilangan teras pemproses logik
mesin itu. (-1: anggaran automatik).

PEMAIN: 3dimage/io

menganalisis Menganalisis imej 7.5

Sambungan fail yang diiktiraf: .HDR, .hdr

Jenis elemen yang disokong:
8 bit tidak ditandatangani, ditandatangani 16 bit, ditandatangani 32 bit, titik terapung 32 bit,
titik terapung 64 bit

kumpulan data IO maya ke dan dari kumpulan data dalaman

Sambungan fail yang diiktiraf: .@

dicom Siri imej Dicom sebagai 3D

Sambungan fail yang diiktiraf: .DCM, .dcm

Jenis elemen yang disokong:
ditandatangani 16 bit, tidak ditandatangani 16 bit

hdf5 HDF5 3D imej IO

Sambungan fail yang dikenali: .H5, .h5

Jenis elemen yang disokong:
data binari, ditandatangani 8 bit, tidak ditandatangani 8 bit, ditandatangani 16 bit, tidak ditandatangani 16 bit,
ditandatangani 32 bit, tidak ditandatangani 32 bit, ditandatangani 64 bit, tidak ditandatangani 64 bit, terapung
titik 32 bit, titik terapung 64 bit

inria imej INRIA

Sambungan fail yang diiktiraf: .INR, .inr

Jenis elemen yang disokong:
ditandatangani 8 bit, tidak ditandatangani 8 bit, ditandatangani 16 bit, tidak ditandatangani 16 bit, ditandatangani 32
bit, 32 bit tidak bertanda, titik terapung 32 bit, titik terapung 64 bit

mhd MetaIO imej 3D IO menggunakan pelaksanaan VTK (eksperimen).

Sambungan fail yang diiktiraf: .MHA, .MHD, .mha, .mhd

Jenis elemen yang disokong:
ditandatangani 8 bit, tidak ditandatangani 8 bit, ditandatangani 16 bit, tidak ditandatangani 16 bit, ditandatangani 32
bit, 32 bit tidak bertanda, titik terapung 32 bit, titik terapung 64 bit

nifti Imej 1D NIFTI-3 IO

Sambungan fail yang diiktiraf: .NII, .nii

Jenis elemen yang disokong:
ditandatangani 8 bit, tidak ditandatangani 8 bit, ditandatangani 16 bit, tidak ditandatangani 16 bit, ditandatangani 32
bit, 32 bit tidak ditandatangani, ditandatangani 64 bit, 64 bit tidak ditandatangani, titik terapung 32
bit, titik terapung 64 bit

vff Format raster Matahari VFF

Sambungan fail yang diiktiraf: .VFF, .vff

Jenis elemen yang disokong:
8 bit tidak ditandatangani, ditandatangani 16 bit

vista Paparan 3D

Sambungan fail yang diiktiraf: .V, .VISTA, .v, .vista

Jenis elemen yang disokong:
data binari, ditandatangani 8 bit, tidak ditandatangani 8 bit, ditandatangani 16 bit, tidak ditandatangani 16 bit,
ditandatangani 32 bit, tidak ditandatangani 32 bit, titik terapung 32 bit, titik terapung 64
sedikit

vti Imej 3D VTK-XML dalam dan keluaran (percubaan).

Sambungan fail yang diiktiraf: .VTI, .vti

Jenis elemen yang disokong:
ditandatangani 8 bit, tidak ditandatangani 8 bit, ditandatangani 16 bit, tidak ditandatangani 16 bit, ditandatangani 32
bit, 32 bit tidak bertanda, titik terapung 32 bit, titik terapung 64 bit

vtk Legasi imej 3D VTK dalam dan keluaran (percubaan).

Sambungan fail yang dikenali: .VTK, .VTKIMAGE, .vtk, .vtkimage

Jenis elemen yang disokong:
data binari, ditandatangani 8 bit, tidak ditandatangani 8 bit, ditandatangani 16 bit, tidak ditandatangani 16 bit,
ditandatangani 32 bit, tidak ditandatangani 32 bit, titik terapung 32 bit, titik terapung 64
sedikit

CONTOH

Nilaikan jarak untuk setiap label yang tersedia dalam imej.v ke label yang sepadan dalam
rujukan imej.v dan menyimpan hasilnya senarai nilai yang dipisahkan koma, iaitu
jarak.csv.

mia-3ddistance-stats -i image.v -r rujukan.v -o distances.csv

AUTHOR(s)

Gert Wollny

HAKCIPTA

Perisian ini adalah Hak Cipta (c) 1999‐2015 Leipzig, Jerman dan Madrid, Sepanyol. Ia datang
dengan BENAR-BENAR TIADA WARANTI dan anda boleh mengagihkannya semula di bawah syarat-syarat GNU
LESEN AWAM AM Versi 3 (atau lebih baru). Untuk maklumat lanjut jalankan program dengan
pilihan '--hak cipta'.

Gunakan mia-3ddistance-stats dalam talian menggunakan perkhidmatan onworks.net