EnglishFrenchSpanyol

Jalankan pelayan | Ubuntu > | Fedora > |


Favicon OnWorks

mia-3dmotioncompica-nonrigid - Dalam Talian di Awan

Jalankan mia-3dmotioncompica-nonrigid dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks melalui Ubuntu Online, Fedora Online, emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MAC OS

Ini ialah arahan mia-3dmotioncompica-nonrigid yang boleh dijalankan dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks menggunakan salah satu daripada berbilang stesen kerja dalam talian percuma kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MAC OS.

JADUAL:

NAMA


mia-3dmotioncompica-nonrigid - Pendaftaran bukan linear bagi siri imej 3D.

SINOPSIS


mia-3dmotioncompica-nonrigid -i -o [pilihan]

DESCRIPTION


mia-3dmotioncompica-nonrigid Program ini melaksanakan versi 3D gerakan
algoritma pampasan yang diterangkan dalam Wollny G, Kellman P, Santos A, Ledesma-Carbayo MJ,
"Pampasan Pergerakan Automatik Pernafasan Percuma memperoleh Data Perfusi Miokardium oleh
menggunakan Analisis Komponen Bebas", Analisis Imej Perubatan, 2012,
DOI:10.1016/j.media.2012.02.004.

PILIHAN


Fail-IO
-i --in-file=(input, diperlukan); io
input imej fail bernombor berturut-turut (namaXXXX.ext) Untuk disokong
jenis fail lihat PLUGINS:3dimage/io

-o --out-file=(output, diperlukan); io
nama imej keluaran (sebagai rentetan format C termasuk %04d untuk menentukan
penomboran fail) Untuk jenis fail yang disokong lihat PLUGINS:3dimage/io

--save-refs=
simpan imej rujukan, rentetan yang diberikan digunakan sebagai pangkalan nama fail, the
corak nombor mengikut imej input, dan format output sentiasa
'vista'

--save-regs=
simpan imej berdaftar perantaraan, rentetan yang diberikan digunakan sebagai nama fail
asas, corak nombor mengikut imej input, dan format output ialah
sentiasa 'vista'

--save-coeffs=
simpan matriks pencampuran ke fail teks

--save-features=
simpan imej ciri sebagai PNG

Bantuan & Maklumat
-V --verbose=amaran
verbositi output, cetak mesej tahap tertentu dan keutamaan yang lebih tinggi.
Keutamaan yang disokong bermula pada tahap terendah ialah:
maklumat ‐ Mesej tahap rendah
mengesan ‐ Surih panggilan fungsi
gagal ‐ Laporkan kegagalan ujian
amaran ‐ Amaran
kesilapan ‐ Laporkan ralat
debug ‐ Keluaran nyahpepijat
mesej ‐ Mesej biasa
maut ‐ Laporkan hanya kesilapan yang membawa maut

--hak cipta
mencetak maklumat hak cipta

-h --bantuan
cetak bantuan ini

-? --penggunaan
mencetak bantuan ringkas

--versi
cetak nombor versi dan keluar

ICA
-C --komponen=0
Komponen ICA 0 = anggaran automatik Komponen ICA 0 = automatik
anggaran

--tidak-normalkan
jangan menormalkan IC

--tidak-menyampah
jangan menanggalkan min daripada lengkung pencampuran

-k --langkau=0
langkau imej pada permulaan siri cth kerana kerana imej lain
modalitiesskip imej pada permulaan siri cth kerana kerana mereka
adalah daripada modaliti lain

-m --maks-ica-iter=400
bilangan lelaran maksimum dalam ICA bilangan lelaran maksimum dalam ICA

Pemprosesan
--benang=-1
Bilangan maksimum benang untuk digunakan untuk pemprosesan, Nombor ini harus lebih rendah
atau sama dengan bilangan teras pemproses logik dalam mesin. (-1:
anggaran automatik).Bilangan maksimum benang untuk digunakan untuk pemprosesan,Ini
nombor hendaklah lebih rendah atau sama dengan bilangan teras pemproses logik
mesin itu. (-1: anggaran automatik).

Pendaftaran
-O --optimizer=gsl:opt=gd,step=0.1
Pengoptimum digunakan untuk meminimumkan

-a --start-c-rate=32
mulakan kadar pekali dalam duri, dibahagikan dengan --c-rate-divider dengan
setiap kadar pekali permulaan laluan dalam duri, dibahagikan dengan --c-rate-divider
dengan setiap pas

--c-rate-divider=4
pembahagi kadar pekali bagi setiap pembahagi kadar pekali bagi setiap pas

-d --start-divcurl=20
mulakan berat divcurl, dibahagikan dengan --divcurl-divider dengan setiap permulaan laluan
berat divcurl, dibahagikan dengan --divcurl-divider dengan setiap pas

--divcurl-divider=4
penskalaan berat divcurl dengan setiap penskalaan berat passdivcurl baharu dengan setiap penskalaan berat badan
pas baru

-w --imagecost=image:weight=1,cost=ssd,
kos imej

-l --mg-levels=3
peringkat berbilang resolusi peringkat berbilang resolusi

-P --lulus=3
pas pendaftaran pas pendaftaran

PEMAIN: 3dimage/io


menganalisis Menganalisis imej 7.5

Sambungan fail yang diiktiraf: .HDR, .hdr

Jenis elemen yang disokong:
8 bit tidak ditandatangani, ditandatangani 16 bit, ditandatangani 32 bit, titik terapung 32 bit,
titik terapung 64 bit

kumpulan data IO maya ke dan dari kumpulan data dalaman

Sambungan fail yang diiktiraf: .@

dicom Siri imej Dicom sebagai 3D

Sambungan fail yang diiktiraf: .DCM, .dcm

Jenis elemen yang disokong:
ditandatangani 16 bit, tidak ditandatangani 16 bit

hdf5 HDF5 3D imej IO

Sambungan fail yang dikenali: .H5, .h5

Jenis elemen yang disokong:
data binari, ditandatangani 8 bit, tidak ditandatangani 8 bit, ditandatangani 16 bit, tidak ditandatangani 16 bit,
ditandatangani 32 bit, tidak ditandatangani 32 bit, ditandatangani 64 bit, tidak ditandatangani 64 bit, terapung
titik 32 bit, titik terapung 64 bit

inria imej INRIA

Sambungan fail yang diiktiraf: .INR, .inr

Jenis elemen yang disokong:
ditandatangani 8 bit, tidak ditandatangani 8 bit, ditandatangani 16 bit, tidak ditandatangani 16 bit, ditandatangani 32
bit, 32 bit tidak bertanda, titik terapung 32 bit, titik terapung 64 bit

mhd MetaIO imej 3D IO menggunakan pelaksanaan VTK (eksperimen).

Sambungan fail yang diiktiraf: .MHA, .MHD, .mha, .mhd

Jenis elemen yang disokong:
ditandatangani 8 bit, tidak ditandatangani 8 bit, ditandatangani 16 bit, tidak ditandatangani 16 bit, ditandatangani 32
bit, 32 bit tidak bertanda, titik terapung 32 bit, titik terapung 64 bit

nifti Imej 1D NIFTI-3 IO

Sambungan fail yang diiktiraf: .NII, .nii

Jenis elemen yang disokong:
ditandatangani 8 bit, tidak ditandatangani 8 bit, ditandatangani 16 bit, tidak ditandatangani 16 bit, ditandatangani 32
bit, 32 bit tidak ditandatangani, ditandatangani 64 bit, 64 bit tidak ditandatangani, titik terapung 32
bit, titik terapung 64 bit

vff Format raster Matahari VFF

Sambungan fail yang diiktiraf: .VFF, .vff

Jenis elemen yang disokong:
8 bit tidak ditandatangani, ditandatangani 16 bit

vista Paparan 3D

Sambungan fail yang diiktiraf: .V, .VISTA, .v, .vista

Jenis elemen yang disokong:
data binari, ditandatangani 8 bit, tidak ditandatangani 8 bit, ditandatangani 16 bit, tidak ditandatangani 16 bit,
ditandatangani 32 bit, tidak ditandatangani 32 bit, titik terapung 32 bit, titik terapung 64
sedikit

vti Imej 3D VTK-XML dalam dan keluaran (percubaan).

Sambungan fail yang diiktiraf: .VTI, .vti

Jenis elemen yang disokong:
ditandatangani 8 bit, tidak ditandatangani 8 bit, ditandatangani 16 bit, tidak ditandatangani 16 bit, ditandatangani 32
bit, 32 bit tidak bertanda, titik terapung 32 bit, titik terapung 64 bit

vtk Legasi imej 3D VTK dalam dan keluaran (percubaan).

Sambungan fail yang dikenali: .VTK, .VTKIMAGE, .vtk, .vtkimage

Jenis elemen yang disokong:
data binari, ditandatangani 8 bit, tidak ditandatangani 8 bit, ditandatangani 16 bit, tidak ditandatangani 16 bit,
ditandatangani 32 bit, tidak ditandatangani 32 bit, titik terapung 32 bit, titik terapung 64
sedikit

CONTOH


Daftarkan siri perfusi yang diberikan dalam imej imagesXXXX.v dengan menggunakan ICA 4 kelas
anggaran. Langkau dua imej pada permulaan, gunakan paling banyak 4 utas pendaftaran, satu nlopt
pengoptimum berasaskan dan sebaliknya menggunakan parameter lalai. Simpan hasilnya dalam
berdaftarXXXX.v

mia-3dmotioncompica-nonrigid -i images0000.v -o registered%04d.v -k 2 -C 4 -t 4 -O
nlopt:opt=ld-var1,xtola=0.001,ftolr=0.001,maxiter=300

AUTHOR(s)


Gert Wollny

HAKCIPTA


Perisian ini adalah Hak Cipta (c) 1999‐2015 Leipzig, Jerman dan Madrid, Sepanyol. Ia datang
dengan BENAR-BENAR TIADA WARANTI dan anda boleh mengagihkannya semula di bawah syarat-syarat GNU
LESEN AWAM AM Versi 3 (atau lebih baru). Untuk maklumat lanjut jalankan program dengan
pilihan '--hak cipta'.

Gunakan mia-3dmotioncompica-nonrigid dalam talian menggunakan perkhidmatan onworks.net


Ad


Ad