Ini ialah arahan mia-3dnonrigidreg-alt yang boleh dijalankan dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks menggunakan salah satu daripada berbilang stesen kerja dalam talian percuma kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MAC OS.
JADUAL:
NAMA
mia-3dnonrigidreg-alt - Pendaftaran bukan linear imej 3D.
SINOPSIS
mia-3dnonrigidreg-alt -o [pilihan]
DESCRIPTION
mia-3dnonrigidreg-alt Program ini menjalankan pendaftaran tidak tegar berdasarkan kos yang diberikan
kriteria dan model transformasi yang diberikan. Selain mia-3dnonrigidreg ia tidak menyokong
parameter baris arahan khusus untuk menyediakan imej. Sebaliknya imej ditentukan
secara langsung apabila mentakrifkan fungsi kos. Oleh itu, pendaftaran imej boleh dilaksanakan itu
mengoptimumkan penjajaran lebih daripada satu pasangan imej pada masa yang sama. Perhatikan, bagaimanapun, bahawa
semua imej input mestilah daripada dimensi yang sama (dalam piksel)
PILIHAN
-o --out-transform=(output, diperlukan); io
transformasi output Untuk jenis fail yang disokong lihat PLUGINS:3dtransform/io
-l --levels=3
peringkat berbilang resolusi peringkat berbilang resolusi
-O --optimizer=gsl:opt=gd,step=0.1
Pengoptimum digunakan untuk peminimumkanOptimizer digunakan untuk peminimuman Untuk
pemalam yang disokong lihat PLUGINS:minimizer/singlecost
-f --transForm=spline:rate=10
jenis transformasi jenis transformasi Untuk pemalam yang disokong lihat
Plugin: 3dimage / mengubah
Bantuan & Info
-V --verbose=amaran
verbositi output, cetak mesej tahap tertentu dan keutamaan yang lebih tinggi.
Keutamaan yang disokong bermula pada tahap terendah ialah:
maklumat ‐ Mesej tahap rendah
mengesan ‐ Surih panggilan fungsi
gagal ‐ Laporkan kegagalan ujian
amaran ‐ Amaran
kesilapan ‐ Laporkan ralat
debug ‐ Keluaran nyahpepijat
mesej ‐ Mesej biasa
maut ‐ Laporkan hanya kesilapan yang membawa maut
--hak cipta
mencetak maklumat hak cipta
-h --bantuan
cetak bantuan ini
-? --penggunaan
mencetak bantuan ringkas
--versi
cetak nombor versi dan keluar
Pemprosesan
--benang=-1
Bilangan maksimum benang untuk digunakan untuk pemprosesan, Nombor ini harus lebih rendah
atau sama dengan bilangan teras pemproses logik dalam mesin. (-1:
anggaran automatik).Bilangan maksimum benang untuk digunakan untuk pemprosesan,Ini
nombor hendaklah lebih rendah atau sama dengan bilangan teras pemproses logik
mesin itu. (-1: anggaran automatik).
PEMAIN: 1d/spacialkernel
cdiff Kernel penapis perbezaan pusat, keadaan sempadan cermin digunakan.
(tiada parameter)
gaussian kernel penapis Gauss luas, parameter yang disokong ialah:
w = 1; uint dalam [0, inf)
separuh lebar penapis.
PEMAIN: 1d/splinebc
cermin Keadaan sempadan interpolasi spline yang mencerminkan sempadan
(tiada parameter)
mengulangi Keadaan sempadan interpolasi spline yang mengulangi nilai pada sempadan
(tiada parameter)
sifar Keadaan sempadan interpolasi spline yang menganggap sifar untuk nilai di luar
(tiada parameter)
PEMAIN: 1d/splinekernel
bspline Penciptaan kernel B-spline , parameter yang disokong ialah:
d = 3; int dalam [0, 5]
Ijazah spline.
omoms Penciptaan kernel OMoms-spline, parameter yang disokong ialah:
d = 3; int dalam [3, 3]
Ijazah spline.
PEMAIN: 3dimage/combiner
absdiff Penggabung imej 'absdiff'
(tiada parameter)
menambah Penggabung imej 'tambah'
(tiada parameter)
div 'div' penggabung imej
(tiada parameter)
mul Penggabung imej 'mul'
(tiada parameter)
sub 'sub' penggabung imej
(tiada parameter)
PEMAIN: 3gambar/kos
lncc korelasi silang ternormal setempat dengan sokongan penyamaran., parameter yang disokong
ialah:
w = 5; masuk dalam [1, 256]
separuh lebar tingkap yang digunakan untuk menilai salib setempat
korelasi.
mi Maklumat bersama berasaskan spline parzen., Parameter yang disokong ialah:
memotong = 0; terapung dalam [0, 40]
Peratusan piksel untuk dipotong pada intensiti tinggi dan rendah untuk dialih keluar
terpencil.
mbins = 64; masuk dalam [1, 256]
Bilangan tong histogram yang digunakan untuk imej bergerak.
mkernel = [bspline:d=3]; kilang
Spline kernel untuk menggerakkan imej parzen hinstogram. Untuk pemalam yang disokong
lihat PLUGINS:1d/splinekernel
rbins = 64; masuk dalam [1, 256]
Bilangan tong histogram yang digunakan untuk imej rujukan.
rkernel = [bspline:d=0]; kilang
Spline kernel untuk rujukan imej parzen hinstogram. Untuk palam yang disokong-
ins lihat PLUGINS:1d/splinekernel
ncc korelasi silang yang normal.
(tiada parameter)
ngf Fungsi ini menilai persamaan imej berdasarkan kecerunan ternormal
padang. Diberi medan kecerunan ternormal $ _S$ imej src dan $ _R$ daripada
ref imej pelbagai penilai dilaksanakan., parameter yang disokong ialah:
menipu = ds; dict
subjenis pemalam (sq, ds, dot, cross). Nilai yang disokong ialah:
ds ‐ kuasa dua perbezaan berskala
dot ‐ isirung produk skalar
menyeberang ‐ isirong produk silang
SSD Kos imej 3D: jumlah perbezaan kuasa dua, parameter yang disokong ialah:
autothresh = 0; terapung dalam [0, 1000]
Gunakan penyamaran automatik imej bergerak dengan hanya mengambil nilai keamatan
ke dalam akaun yang lebih besar daripada ambang yang diberikan.
norma = 0; bool
Tetapkan sama ada metrik harus dinormalkan mengikut bilangan piksel imej.
ssd-automask
Kos imej 3D: jumlah perbezaan kuasa dua, dengan automasking berdasarkan yang diberikan
ambang, parameter yang disokong ialah:
rthresh = 0; berganda
Nilai keamatan ambang untuk imej rujukan.
menyampah = 0; berganda
Nilai keamatan ambang untuk imej sumber.
PEMAIN: 3dimage/penapis
jalur lebar penapis laluan jalur intensiti, parameter yang disokong ialah:
maks = 3.40282e+38; terapung
maksimum band.
minit = 0; terapung
minimum kumpulan itu.
binarize penapis binarize imej, parameter yang disokong ialah:
maks = 3.40282e+38; terapung
julat maksimum yang diterima.
minit = 0; terapung
julat minimum yang diterima.
rapat dekat morfologi, parameter yang disokong ialah:
petunjuk = hitam; tali
pembayang pada kandungan imej utama (hitam|putih).
bentuk = [sfera:r=2]; kilang
elemen penstrukturan. Untuk pemalam yang disokong lihat PLUGINS:3dimage/shape
menggabungkan Gabungkan dua imej dengan operator penggabung yang diberikan. jika 'terbalik' ditetapkan kepada
palsu, pengendali pertama ialah imej yang dilalui melalui saluran paip penapis, dan
imej kedua dimuatkan daripada fail yang diberikan dengan parameter 'imej'
saat penapis dijalankan., parameter yang disokong ialah:
gambar =(input, diperlukan, rentetan)
imej kedua yang diperlukan dalam penggabung.
op =(diperlukan, kilang)
Penggabung imej untuk digunakan pada imej. Untuk pemalam yang disokong lihat
PLUGINS:3dimage/combiner
berbalik = 0; bool
terbalikkan susunan imej yang dihantar kepada penggabung.
menukar penapis penukaran format piksel imej, parameter yang disokong ialah:
a = 1; terapung
parameter penukaran linear a.
b = 0; terapung
parameter penukaran linear b.
peta = memilih; dict
pemetaan penukaran. Nilai yang disokong ialah:
pilih ‐ gunakan transformasi linear yang memetakan julat input sebenar kepada
julat keluaran penuh
pelbagai ‐ gunakan transformasi linear yang memetakan jenis data input
julat kepada julat jenis data output
salinan ‐ salin data semasa menukar
linear ‐ gunakan penjelmaan linear x -> a*x+b
optstat ‐ gunakan penjelmaan linear yang memetakan berdasarkan min input dan
variasi kepada julat keluaran penuh
repn = ubyte; dict
jenis piksel keluaran. Nilai yang disokong ialah:
tiada ‐ tiada jenis piksel ditentukan
terapung ‐ titik terapung 32 bit
sbyte ‐ ditandatangani 8 bit
ulong ‐ tidak ditandatangani 64 bit
dua kali ganda ‐ titik terapung 64 bit
Sint ‐ ditandatangani 32 bit
ushort ‐ tidak ditandatangani 16 bit
pendek ‐ ditandatangani 16 bit
uint ‐ tidak ditandatangani 32 bit
selamba ‐ ditandatangani 64 bit
sedikit ‐ data binari
ubyte ‐ tidak ditandatangani 8 bit
tanaman Pangkas kawasan imej, kawasan itu sentiasa diapit pada imej asal
saiz dalam erti kata julat yang diberikan disimpan., parameter yang disokong ialah:
akhir = [[4294967295,4294967295,4294967295]]; boleh distrim
hujung julat tanaman, maksimum = (-1,-1,-1).
permulaan = [[0,0,0]]; boleh distrim
permulaan julat tanaman.
melebarkan Penapis dilate timbunan imej 3d, parameter yang disokong ialah:
petunjuk = hitam; tali
pembayang pada kandungan imej utama (hitam|putih).
bentuk = [sfera:r=2]; kilang
elemen penstrukturan. Untuk pemalam yang disokong lihat PLUGINS:3dimage/shape
jarak Nilaikan penjelmaan jarak 3D bagi imej. Jika imej adalah topeng binari,
maka hasil perubahan jarak dalam setiap titik sepadan dengan Euclidian
jarak ke topeng. Jika imej input adalah daripada nilai piksel skalar, maka
skalar ini ditafsirkan sebagai medan tinggi dan nilai setiap piksel menambah kepada
jarak.
(tiada parameter)
skala rendah Kurangkan skala imej input dengan menggunakan saiz blok yang diberikan untuk menentukan skala bawah
faktor. Sebelum menskala imej ditapis oleh penapis melicinkan ke
menghapuskan data frekuensi tinggi dan mengelakkan artifak alias., disokong
parameter ialah:
b = [[1,1,1]]; 3dbounds
saiz blok.
bx = 1; uint dalam [1, inf)
saiz blok dalam arah x.
by = 1; uint dalam [1, inf)
saiz blok dalam arah y.
bz = 1; uint dalam [1, inf)
saiz blok dalam arah z.
kernel = gauss; tali
melicinkan inti penapis untuk digunakan, saiz penapis dianggarkan
berdasarkan saiz blok..
erode Penapis menghakis tindanan imej 3d, parameter yang disokong ialah:
petunjuk = hitam; tali
pembayang pada kandungan imej utama (hitam|putih).
bentuk = [sfera:r=2]; kilang
elemen penstrukturan. Untuk pemalam yang disokong lihat PLUGINS:3dimage/shape
gaussian Penapis gauss 3D isotropik, parameter yang disokong ialah:
w = 1; int dalam [0, inf)
parameter lebar penapis.
gradnorm Imej 3D kepada penapis norma kecerunan
(tiada parameter)
growmask Gunakan topeng binari input dan imej skala kelabu rujukan untuk melakukan pertumbuhan wilayah
dengan menambah piksel kejiranan bagi piksel yang telah ditambah jika piksel mempunyai lebih rendah
keamatan yang melebihi ambang yang diberikan., parameter yang disokong ialah:
minit = 1; terapung
ambang yang lebih rendah untuk pertumbuhan topeng.
ref =(input, diperlukan, rentetan)
imej rujukan untuk kawasan topeng tumbuh.
bentuk = 6n; kilang
topeng kejiranan. Untuk pemalam yang disokong lihat PLUGINS:3dimage/shape
terbalik penapis terbalik keamatan
(tiada parameter)
isovoxel Penapis ini menskalakan imej untuk menjadikan saiz voxel isometrik dan saiznya kepada
sepadan dengan nilai yang diberikan, parameter yang disokong ialah:
interp = [bspline:d=3]; kilang
isirong interpolasi yang akan digunakan . Untuk pemalam yang disokong lihat
PLUGIN:1d/splinekernel
saiz = 1; terapung dalam (0, inf)
saiz voxel sasaran isometrik.
kmeans Penapis k-means imej 3D. Dalam imej output nilai piksel mewakili
keahlian kelas dan pusat kelas disimpan sebagai atribut dalam imej.,
parameter yang disokong ialah:
c = 3; int dalam [2, inf)
bilangan kelas.
label Penapis untuk melabelkan komponen yang disambungkan bagi imej binari., disokong
parameter ialah:
n = 6n; kilang
topeng kejiranan. Untuk pemalam yang disokong lihat PLUGINS:3dimage/shape
peta label Penapis imej untuk memetakan semula id label. Hanya terpakai pada imej dengan nilai integer
intensiti/label., parameter yang disokong ialah:
peta =(input, diperlukan, rentetan)
Fail pemetaan label.
skala label
Penapis yang hanya mencipta voxel output yang telah dibuat dalam input
imej. Penskalaan dilakukan dengan menggunakan algoritma pengundian yang memilih sasaran
nilai piksel berdasarkan kiraan piksel tertinggi bagi label tertentu dalam
wilayah sumber yang sepadan. Jika rantau ini mengandungi dua label dengan yang sama
kira, yang mempunyai nombor yang lebih rendah menang., parameter yang disokong ialah:
luar saiz =(diperlukan, 3dbounds)
saiz sasaran diberikan sebagai dua nilai dipisahkan koma.
memuatkan Muatkan imej input daripada fail dan gunakannya untuk menggantikan imej semasa dalam fail
saluran paip., parameter yang disokong ialah:
fail =(input, diperlukan, rentetan)
nama fail input untuk dimuatkan dari..
lvdownscale
Ini ialah penapis skala bawah undian label. Ia menurunkan skala imej 3D mengikut blok.
Untuk setiap blok label (bukan sifar) yang paling kerap muncul dalam blok ialah
dikeluarkan sebagai piksel output dalam imej sasaran. Jika dua label muncul nombor yang sama
sering kali, yang mempunyai nilai mutlak yang lebih rendah menang., parameter yang disokong ialah:
b = [[1,1,1]]; 3dbounds
saiz blok untuk penskalaan bawah. Setiap blok akan diwakili oleh satu piksel
dalam gambar sasaran..
topeng Topeng imej, satu imej diambil daripada senarai parameter dan satu lagi daripada
input penapis biasa. Kedua-dua imej mestilah daripada dimensi yang sama dan satu mesti
menjadi binari. Atribut imej yang datang melalui saluran paip penapis ialah
terpelihara. Jenis piksel output sepadan dengan imej input yang tidak
binary., parameter yang disokong ialah:
input =(input, diperlukan, rentetan)
nama fail imej input kedua.
bermakna Penapis min imej 3D, parameter yang disokong ialah:
w = 1; int dalam [1, inf)
separuh lebar penapis.
median penapis 3d median, parameter yang disokong ialah:
w = 1; int dalam [1, inf)
parameter lebar penapis.
mlv Purata Penapis imej 3D Varian Terkecil, parameter yang disokong ialah:
w = 1; int dalam [1, inf)
parameter lebar penapis.
msnormalizer
Penapis normalisasi min-sigma imej 3D, parameter yang disokong ialah:
w = 1; int dalam [1, inf)
separuh lebar penapis.
membuka morfologi terbuka, parameter yang disokong ialah:
petunjuk = hitam; tali
pembayang pada kandungan imej utama (hitam|putih).
bentuk = [sfera:r=2]; kilang
elemen penstrukturan. Untuk pemalam yang disokong lihat PLUGINS:3dimage/shape
mengorientasikan semula Penapis orientasi semula imej 3D, parameter yang disokong ialah:
peta = xyz; dict
pemetaan oriantasi yang akan digunakan. Nilai yang disokong ialah:
p-zxy ‐ pilih ubah x->y->z->x
r-x180 ‐ berputar mengelilingi paksi-x mengikut arah jam 180 darjah
xyz ‐ kekalkan orientasi
p-yzx ‐ pilih ubah x->z->y->x
r-z180 ‐ putar mengelilingi paksi z mengikut arah jam 180 darjah
r-y270 ‐ berputar mengelilingi paksi-y mengikut arah jam 270 darjah
f-xz ‐ flip xz
f-yz ‐ flip yz
r-x90 ‐ berputar mengelilingi paksi-x mengikut arah jam 90 darjah
r-y90 ‐ berputar mengelilingi paksi-y mengikut arah jam 90 darjah
r-x270 ‐ berputar mengelilingi paksi-x mengikut arah jam 270 darjah
r-z270 ‐ putar mengelilingi paksi z mengikut arah jam 270 darjah
r-z90 ‐ putar mengelilingi paksi z mengikut arah jam 90 darjah
f-xy ‐ flip xy
r-y180 ‐ berputar mengelilingi paksi-y mengikut arah jam 180 darjah
mengubah saiz Ubah saiz imej. Data asal dipusatkan dalam imej bersaiz baharu.,
parameter yang disokong ialah:
saiz = [[0,0,0]]; boleh distrim
saiz baru imej saiz 0 menunjukkan untuk mengekalkan saiz untuk
dimensi yang sepadan..
sandp penapis 3d garam dan lada, parameter yang disokong ialah:
ambang = 100; terapung dalam [0, inf)
nilai thresh.
w = 1; int dalam [1, inf)
parameter lebar penapis.
skala Penapis imej 3D yang berskala kepada saiz sasaran tertentu , parameter yang disokong ialah:
interp = [bspline:d=3]; kilang
isirong interpolasi yang akan digunakan . Untuk pemalam yang disokong lihat
PLUGIN:1d/splinekernel
s = [[0,0,0]]; 3dbounds
saiz sasaran untuk menetapkan semua komponen sekaligus (komponen 0: gunakan imej input
ukuran).
sx = 0; uint dalam [0, inf)
saiz sasaran dalam arah x (0:gunakan saiz imej input).
sy = 0; uint dalam [0, inf)
saiz sasaran dalam arah y (0:gunakan saiz imej input).
sz = 0; uint dalam [0, inf)
saiz sasaran dalam arah y (0:gunakan saiz imej input).
pilih besar Penapis yang mencipta topeng binari yang mewakili keamatan dengan yang tertinggi
kiraan piksel. Nilai piksel 0 akan diabaikan, dan jika dua keamatan mempunyai
kiraan piksel yang sama, maka hasilnya tidak ditentukan. Piksel input mesti mempunyai
jenis piksel integral.
(tiada parameter)
sepconv Penapis lilitan separaple intensiti imej 3D, parameter yang disokong ialah:
kx = [gauss:w=1]; kilang
penapis kernel dalam arah x. Untuk pemalam yang disokong lihat
PLUGINS:1d/spacialkernel
ky = [gauss:w=1]; kilang
penapis kernel dalam arah y. Untuk pemalam yang disokong lihat
PLUGINS:1d/spacialkernel
kz = [gauss:w=1]; kilang
penapis kernel dalam arah z. Untuk pemalam yang disokong lihat
PLUGINS:1d/spacialkernel
bw kepala air berbiji. Algoritma mengekstrak betul-betul banyak kawasan sebagai permulaan
label diberikan dalam imej benih., parameter yang disokong ialah:
grad = 0; bool
Tafsirkan imej input sebagai kecerunan. .
tanda = 0; bool
Tandakan kawasan tadahan air bersegmen dengan nilai skala kelabu khas.
n = [sfera:r=1]; kilang
Kejiranan untuk kawasan hulu air yang berkembang. Untuk pemalam yang disokong lihat
PLUGINS:3gambar/bentuk
benih =(input, diperlukan, rentetan)
imej input benih yang mengandungi label untuk kawasan awal.
tee Simpan imej input ke fail dan juga hantarkannya ke penapis seterusnya,
parameter yang disokong ialah:
fail =(output, diperlukan, rentetan)
nama fail output untuk menyimpan imej juga..
penipisan Penipisan morfologi 3D, berdasarkan: Lee dan Kashyap, 'Membina Model Rangka
melalui Algoritma Penipisan Permukaan/Paksi Medial 3-D, Model Grafik dan Imej
Memproses, 56(6):462-478, 1994. Pelaksanaan ini hanya menyokong 26
kejiranan.
(tiada parameter)
mengubah Ubah imej input dengan transformasi yang diberikan., parameter yang disokong
ialah:
fail =(input, diperlukan, rentetan)
Nama fail yang mengandungi transformasi..
imgboundary = ; tali
mengatasi keadaan sempadan interpolasi imej.
imgkernel = ; tali
mengatasi kernel interpolator imej.
varians Penapis varians imej 3D, parameter yang disokong ialah:
w = 1; int dalam [1, inf)
separuh lebar penapis.
ws pembahagian dasar air asas., parameter yang disokong ialah:
evalgrad = 0; bool
Tetapkan kepada 1 jika imej input tidak mewakili imej norma kecerunan.
tanda = 0; bool
Tandakan kawasan tadahan air bersegmen dengan nilai skala kelabu khas.
n = [sfera:r=1]; kilang
Kejiranan untuk kawasan hulu air yang berkembang. Untuk pemalam yang disokong lihat
PLUGINS:3gambar/bentuk
ambang = 0; terapung dalam [0, 1)
Ambang norma kecerunan relatif. Nilai ambang nilai sebenar ialah
thresh * (grad_maks - gred_min) + gred_min. Bassin dipisahkan oleh kecerunan
dengan norma yang lebih rendah akan digabungkan.
PEMAIN: 3gambar/kos penuh
gambar Fungsi kos persamaan imej umum yang juga mengendalikan resolusi berbilang
pemprosesan. Ukuran persamaan sebenar diberikan es parameter tambahan.,
parameter yang disokong ialah:
kos = sd; kilang
kernel fungsi kos. Untuk pemalam yang disokong lihat PLUGINS:3dimage/cost
debug = 0; bool
Simpan hasil perantaraan untuk penyahpepijatan.
ref =(input, rentetan)
Imej rujukan.
src =(input, rentetan)
Gambar kajian.
berat = 1; terapung
berat fungsi kos.
labelimage
Fungsi kos persamaan yang memetakan label dua imej dan mengendalikan label-
memelihara pemprosesan berbilang resolusi., parameter yang disokong ialah:
maxlabel = 256; int dalam [2, 32000]
bilangan maksimum label untuk dipertimbangkan.
ref =(input, rentetan)
Imej rujukan.
src =(input, rentetan)
Gambar kajian.
berat = 1; terapung
berat fungsi kos.
gambar bertopeng
Fungsi kos persamaan imej bertopeng umum yang juga mengendalikan pelbagai
pemprosesan resolusi. Topeng yang disediakan haruslah dipenuhi kawasan yang padat
pemprosesan berbilang resolusi kerana jika tidak, maklumat topeng mungkin hilang
apabila menurunkan skala imej. Topeng mungkin pra-tapis - selepas pra-penapisan
topeng mestilah daripada jenis bit.Topeng rujukan dan topeng yang diubah suai
imej kajian digabungkan oleh binari DAN. Ukuran persamaan sebenar diberikan
es parameter tambahan., parameter yang disokong ialah:
kos = sd; kilang
kernel fungsi kos. Untuk pemalam yang disokong lihat
PLUGINS:3dimage/maskedcost
ref =(input, rentetan)
Imej rujukan.
topeng ref =(input, rentetan)
Topeng imej rujukan (perduaan).
ref-topeng-penapis = ; kilang
Penapis untuk menyediakan imej topeng rujukan, output mestilah binari
imej.. Untuk pemalam yang disokong lihat PLUGINS:3dimage/filter
src =(input, rentetan)
Gambar kajian.
src-topeng =(input, rentetan)
Topeng imej kajian (perduaan).
src-mask-filter = ; kilang
Penapis untuk menyediakan imej topeng kajian, output mestilah binari
imej.. Untuk pemalam yang disokong lihat PLUGINS:3dimage/filter
berat = 1; terapung
berat fungsi kos.
taggedssd Menilai Jumlah Perbezaan Kuasa Dua ukuran persamaan dengan menggunakan tiga
pasangan imej yang ditandai. Nilai fungsi kos dinilai berdasarkan semua imej
berpasangan, tetapi kecerunan digubah dengan mengarang komponennya berdasarkan tag
arah., parameter yang disokong ialah:
refx =(input, rentetan)
X-tag imej rujukan.
refy =(input, rentetan)
Teg Y imej rujukan.
refz =(input, rentetan)
Imej rujukan Z-tag.
srcx =(input, rentetan)
Kaji imej X-tag.
srcy =(input, rentetan)
Kaji imej Y-tag.
srcz =(input, rentetan)
Kaji imej Z-tag.
berat = 1; terapung
berat fungsi kos.
PEMAIN: 3dimage/io
menganalisis Menganalisis imej 7.5
Sambungan fail yang diiktiraf: .HDR, .hdr
Jenis elemen yang disokong:
8 bit tidak ditandatangani, ditandatangani 16 bit, ditandatangani 32 bit, titik terapung 32 bit,
titik terapung 64 bit
kumpulan data IO maya ke dan dari kumpulan data dalaman
Sambungan fail yang diiktiraf: .@
dicom Siri imej Dicom sebagai 3D
Sambungan fail yang diiktiraf: .DCM, .dcm
Jenis elemen yang disokong:
ditandatangani 16 bit, tidak ditandatangani 16 bit
hdf5 HDF5 3D imej IO
Sambungan fail yang dikenali: .H5, .h5
Jenis elemen yang disokong:
data binari, ditandatangani 8 bit, tidak ditandatangani 8 bit, ditandatangani 16 bit, tidak ditandatangani 16 bit,
ditandatangani 32 bit, tidak ditandatangani 32 bit, ditandatangani 64 bit, tidak ditandatangani 64 bit, terapung
titik 32 bit, titik terapung 64 bit
inria imej INRIA
Sambungan fail yang diiktiraf: .INR, .inr
Jenis elemen yang disokong:
ditandatangani 8 bit, tidak ditandatangani 8 bit, ditandatangani 16 bit, tidak ditandatangani 16 bit, ditandatangani 32
bit, 32 bit tidak bertanda, titik terapung 32 bit, titik terapung 64 bit
mhd MetaIO imej 3D IO menggunakan pelaksanaan VTK (eksperimen).
Sambungan fail yang diiktiraf: .MHA, .MHD, .mha, .mhd
Jenis elemen yang disokong:
ditandatangani 8 bit, tidak ditandatangani 8 bit, ditandatangani 16 bit, tidak ditandatangani 16 bit, ditandatangani 32
bit, 32 bit tidak bertanda, titik terapung 32 bit, titik terapung 64 bit
nifti Imej 1D NIFTI-3 IO
Sambungan fail yang diiktiraf: .NII, .nii
Jenis elemen yang disokong:
ditandatangani 8 bit, tidak ditandatangani 8 bit, ditandatangani 16 bit, tidak ditandatangani 16 bit, ditandatangani 32
bit, 32 bit tidak ditandatangani, ditandatangani 64 bit, 64 bit tidak ditandatangani, titik terapung 32
bit, titik terapung 64 bit
vff Format raster Matahari VFF
Sambungan fail yang diiktiraf: .VFF, .vff
Jenis elemen yang disokong:
8 bit tidak ditandatangani, ditandatangani 16 bit
vista Paparan 3D
Sambungan fail yang diiktiraf: .V, .VISTA, .v, .vista
Jenis elemen yang disokong:
data binari, ditandatangani 8 bit, tidak ditandatangani 8 bit, ditandatangani 16 bit, tidak ditandatangani 16 bit,
ditandatangani 32 bit, tidak ditandatangani 32 bit, titik terapung 32 bit, titik terapung 64
sedikit
vti Imej 3D VTK-XML dalam dan keluaran (percubaan).
Sambungan fail yang diiktiraf: .VTI, .vti
Jenis elemen yang disokong:
ditandatangani 8 bit, tidak ditandatangani 8 bit, ditandatangani 16 bit, tidak ditandatangani 16 bit, ditandatangani 32
bit, 32 bit tidak bertanda, titik terapung 32 bit, titik terapung 64 bit
vtk Legasi imej 3D VTK dalam dan keluaran (percubaan).
Sambungan fail yang dikenali: .VTK, .VTKIMAGE, .vtk, .vtkimage
Jenis elemen yang disokong:
data binari, ditandatangani 8 bit, tidak ditandatangani 8 bit, ditandatangani 16 bit, tidak ditandatangani 16 bit,
ditandatangani 32 bit, tidak ditandatangani 32 bit, titik terapung 32 bit, titik terapung 64
sedikit
PEMAIN: 3dimage/maskedcost
lncc korelasi silang ternormal setempat dengan sokongan penyamaran., parameter yang disokong
ialah:
w = 5; masuk dalam [1, 256]
separuh lebar tingkap yang digunakan untuk menilai salib setempat
korelasi.
mi Maklumat bersama berasaskan spline parzen dengan masking., parameter yang disokong ialah:
memotong = 0; terapung dalam [0, 40]
Peratusan piksel untuk dipotong pada intensiti tinggi dan rendah untuk dialih keluar
terpencil.
mbins = 64; masuk dalam [1, 256]
Bilangan tong histogram yang digunakan untuk imej bergerak.
mkernel = [bspline:d=3]; kilang
Spline kernel untuk menggerakkan imej parzen hinstogram. Untuk pemalam yang disokong
lihat PLUGINS:1d/splinekernel
rbins = 64; masuk dalam [1, 256]
Bilangan tong histogram yang digunakan untuk imej rujukan.
rkernel = [bspline:d=0]; kilang
Spline kernel untuk rujukan imej parzen hinstogram. Untuk palam yang disokong-
ins lihat PLUGINS:1d/splinekernel
ncc korelasi silang yang dinormalkan dengan sokongan penyamaran.
(tiada parameter)
SSD Jumlah perbezaan kuasa dua dengan penyamaran.
(tiada parameter)
PEMAIN: 3dimej/bentuk
18n Pencipta bentuk 18D kejiranan 3n
(tiada parameter)
26n Pencipta bentuk 26D kejiranan 3n
(tiada parameter)
6n Pencipta bentuk 6D kejiranan 3n
(tiada parameter)
sfera Kejiranan bentuk sfera tertutup termasuk piksel dalam jejari tertentu
r., parameter yang disokong ialah:
r = 2; terapung dalam (0, inf)
jejari sfera.
PEMAIN: 3dimage/transform
diperhalusi Transformasi afine (12 darjah kebebasan), parameter yang disokong ialah:
imgboundary = cermin; kilang
keadaan sempadan interpolasi imej. Untuk pemalam yang disokong lihat
PLUGIN:1d/splinebc
imgkernel = [bspline:d=3]; kilang
kernel interpolator imej. Untuk pemalam yang disokong lihat
PLUGIN:1d/splinekernel
axisrot Transformasi putaran terhad (1 darjah kebebasan). Transformasinya ialah
terhad kepada putaran di sekeliling paksi yang diberikan tentang putaran yang diberikan
tengah, parameter yang disokong ialah:
paksi =(diperlukan, 3dfvector)
paksi putaran.
imgboundary = cermin; kilang
keadaan sempadan interpolasi imej. Untuk pemalam yang disokong lihat
PLUGIN:1d/splinebc
imgkernel = [bspline:d=3]; kilang
kernel interpolator imej. Untuk pemalam yang disokong lihat
PLUGIN:1d/splinekernel
asal =(diperlukan, 3dfvector)
pusat transformasi.
raffine Transformasi afin terhad (3 darjah kebebasan). Transformasinya ialah
terhad kepada putaran di sekeliling paksi yang diberikan dan ricih di sepanjang dua paksi
berserenjang dengan yang diberikan, parameter yang disokong ialah:
paksi =(diperlukan, 3dfvector)
paksi putaran.
imgboundary = cermin; kilang
keadaan sempadan interpolasi imej. Untuk pemalam yang disokong lihat
PLUGIN:1d/splinebc
imgkernel = [bspline:d=3]; kilang
kernel interpolator imej. Untuk pemalam yang disokong lihat
PLUGIN:1d/splinekernel
asal =(diperlukan, 3dfvector)
pusat transformasi.
tegar Transformasi tegar, iaitu putaran dan terjemahan (enam darjah kebebasan).,
parameter yang disokong ialah:
imgboundary = cermin; kilang
keadaan sempadan interpolasi imej. Untuk pemalam yang disokong lihat
PLUGIN:1d/splinebc
imgkernel = [bspline:d=3]; kilang
kernel interpolator imej. Untuk pemalam yang disokong lihat
PLUGIN:1d/splinekernel
asal = [[0,0,0]]; 3dfvector
Pusat putaran relatif, iaitu <0.5,0.5,0.5> sepadan dengan pusat
isipadu.
putaran Transformasi putaran (tiga darjah kebebasan)., parameter yang disokong ialah:
imgboundary = cermin; kilang
keadaan sempadan interpolasi imej. Untuk pemalam yang disokong lihat
PLUGIN:1d/splinebc
imgkernel = [bspline:d=3]; kilang
kernel interpolator imej. Untuk pemalam yang disokong lihat
PLUGIN:1d/splinekernel
asal = [[0,0,0]]; 3dfvector
Pusat putaran relatif, iaitu <0.5,0.5,0.5> sepadan dengan pusat
isipadu.
rotbend Transformasi terhad (4 darjah kebebasan). Transformasinya ialah
terhad kepada putaran di sekeliling paksi x dan y dan lenturan sepanjang x
paksi, bebas dalam setiap arah, dengan lenturan meningkat dengan
jarak kuasa dua dari paksi putaran., parameter yang disokong ialah:
imgboundary = cermin; kilang
keadaan sempadan interpolasi imej. Untuk pemalam yang disokong lihat
PLUGIN:1d/splinebc
imgkernel = [bspline:d=3]; kilang
kernel interpolator imej. Untuk pemalam yang disokong lihat
PLUGIN:1d/splinekernel
norot = 0; bool
Jangan optimumkan putaran.
asal =(diperlukan, 3dfvector)
pusat transformasi.
spline Transformasi bentuk bebas yang boleh diterangkan oleh set pekali B-spline
dan inti B-spline asas., parameter yang disokong ialah:
anisorate = [[0,0,0]]; 3dfvector
kadar pekali anisotropik dalam piksel, nilai bukan positif akan menjadi
ditimpa oleh nilai 'kadar'..
debug = 0; bool
dayakan output penyahpepijatan tambahan.
imgboundary = cermin; kilang
keadaan sempadan interpolasi imej. Untuk pemalam yang disokong lihat
PLUGIN:1d/splinebc
imgkernel = [bspline:d=3]; kilang
kernel interpolator imej. Untuk pemalam yang disokong lihat
PLUGIN:1d/splinekernel
kernel = [bspline:d=3]; kilang
kernel spline transformasi. Untuk pemalam yang disokong lihat
PLUGIN:1d/splinekernel
penalti = ; kilang
tempoh tenaga penalti transformasi. Untuk pemalam yang disokong lihat
PLUGINS:3dtransform/splinepenalty
kadar = 10; terapung dalam [1, inf)
kadar pekali isotropik dalam piksel.
menterjemah Terjemahan (tiga darjah kebebasan), parameter yang disokong ialah:
imgboundary = cermin; kilang
keadaan sempadan interpolasi imej. Untuk pemalam yang disokong lihat
PLUGIN:1d/splinebc
imgkernel = [bspline:d=3]; kilang
kernel interpolator imej. Untuk pemalam yang disokong lihat
PLUGIN:1d/splinekernel
vf Pemalam ini melaksanakan transformasi yang mentakrifkan terjemahan untuk setiap satu
titik grid yang mentakrifkan domain transformasi., disokong
parameter ialah:
imgboundary = cermin; kilang
keadaan sempadan interpolasi imej. Untuk pemalam yang disokong lihat
PLUGIN:1d/splinebc
imgkernel = [bspline:d=3]; kilang
kernel interpolator imej. Untuk pemalam yang disokong lihat
PLUGIN:1d/splinekernel
PEMAIN: 3dtransform/io
bbs IO bersiri binari (bukan mudah alih) bagi transformasi 3D
Sambungan fail yang diiktiraf: .bbs
kumpulan data IO maya ke dan dari kumpulan data dalaman
Sambungan fail yang diiktiraf: .@
vista Penyimpanan Vista bagi transformasi 3D
Sambungan fail yang diiktiraf: .v, .v3dt
xml IO bersiri XML bagi transformasi 3D
Sambungan fail yang dikenali: .x3dt
PEMAIN: 3dtransform/splinepenalty
divcurl penalti divcurl pada transformasi, parameter yang disokong ialah:
curl = 1; terapung dalam [0, inf)
berat penalti pada curl.
div = 1; terapung dalam [0, inf)
berat penalti atas perbezaan.
norma = 0; bool
Tetapkan kepada 1 jika penalti harus dinormalisasi berkenaan dengan imej
saiz.
berat = 1; terapung dalam (0, inf)
berat tenaga penalti.
PEMAIN: minimizer/singlecost
gdas Turun kecerunan dengan pembetulan saiz langkah automatik., Parameter yang disokong ialah:
ftolr = 0; dua kali ganda dalam [0, inf)
Berhenti jika perubahan relatif kriteria di bawah..
max-step = 2; dua kali ganda dalam (0, inf)
Saiz langkah mutlak maksimum.
maksiter = 200; uint dalam [1, inf)
Kriteria berhenti: bilangan maksimum lelaran.
langkah min = 0.1; dua kali ganda dalam (0, inf)
Saiz langkah mutlak minimum.
xtola = 0.01; dua kali ganda dalam [0, inf)
Berhenti jika inf-norma perubahan yang digunakan pada x adalah di bawah nilai ini..
gdsq Turun kecerunan dengan anggaran langkah kuadratik, parameter yang disokong ialah:
ftolr = 0; dua kali ganda dalam [0, inf)
Berhenti jika perubahan relatif kriteria di bawah..
gtola = 0; dua kali ganda dalam [0, inf)
Berhenti jika inf-norma kecerunan adalah di bawah nilai ini..
maksiter = 100; uint dalam [1, inf)
Kriteria berhenti: bilangan maksimum lelaran.
skala = 2; dua kali ganda dalam (1, inf)
Penskalaan saiz langkah tetap mundur.
langkah = 0.1; dua kali ganda dalam (0, inf)
Saiz langkah awal.
xtola = 0; dua kali ganda dalam [0, inf)
Berhenti jika inf-norma x-update berada di bawah nilai ini..
gsl pemalam pengoptimum berdasarkan pengoptimum multimin Perpustakaan Saintifik GNU
(GSL) https://www.gnu.org/software/gsl/, parameter yang disokong ialah:
eps = 0.01; dua kali ganda dalam (0, inf)
pengoptimum berasaskan kecerunan: berhenti apabila |grad| < eps, simplex: berhenti apabila
saiz simplex < eps..
berulang = 100; uint dalam [1, inf)
bilangan maksimum lelaran.
pilih = gd; dict
Pengoptimum khusus untuk digunakan.. Nilai yang disokong ialah:
bfgs ‐ Broyden-Fletcher-Goldfarb-Shann
bfgs2 ‐ Broyden-Fletcher-Goldfarb-Shann (versi paling cekap)
cg-fr ‐ Algoritma kecerunan konjugat Flecher-Reeves
gd ‐ Keturunan kecerunan.
simplex ‐ Algoritma Simplex Nelder dan Mead
cg-pr ‐ Algoritma kecerunan konjugat Polak-Ribiere
langkah = 0.001; dua kali ganda dalam (0, inf)
saiz langkah awal.
push = 0.1; dua kali ganda dalam (0, inf)
beberapa parameter toleransi.
nlopt Algoritma peminimum menggunakan perpustakaan NLOPT, untuk penerangan tentang
pengoptimum sila lihat 'http://ab-
initio.mit.edu/wiki/index.php/NLopt_Algorithms', parameter yang disokong ialah:
ftola = 0; dua kali ganda dalam [0, inf)
Kriteria penghentian: perubahan mutlak nilai objektif adalah di bawah
nilai ini.
ftolr = 0; dua kali ganda dalam [0, inf)
Kriteria berhenti: perubahan relatif bagi nilai objektif adalah di bawah
nilai ini.
yang lebih tinggi = inf; berganda
Sempadan yang lebih tinggi (sama untuk semua parameter).
local-opt = tiada; dict
algoritma pengecilan tempatan yang mungkin diperlukan untuk utama
algoritma pengecilan.. Nilai yang disokong ialah:
gn-orig-direct-l ‐ Membahagi Segiempat (pelaksanaan asal,
berat sebelah tempatan)
gn-direct-l-noscal ‐ Membahagi Segi Empat (tidak berskala, berat sebelah setempat)
gn-isres ‐ Strategi Evolusi Kedudukan Stokastik yang dipertingkatkan
ld-tnewton ‐ Newton terpotong
gn-direct-l-rand ‐ Membahagi Segi empat tepat (pincang tempatan, rawak)
ln-newuoa ‐ Pengoptimuman Tanpa Kekangan Tanpa Derivatif secara Iteratif
Penghampiran Kuadratik Terbina
gn-direct-l-rand-noscale ‐ Membahagi Segi Empat (tidak berskala, setempat
berat sebelah, rawak)
gn-orig-direct ‐ Membahagi Segiempat (pelaksanaan asal)
ld-tnewton-precond ‐ Newton Terpenggal Prasyarat
ld-tnewton-restart ‐ Newton terpotong dengan mulakan semula menurun paling curam
gn-langsung ‐ Membahagi Segiempat
ln-neldermead ‐ Algoritma Nelder-Mead simplex
ln-cobyla ‐ Pengoptimuman Terkekang OLEH Penghampiran Linear
gn-crs2-lm ‐ Carian Rawak Terkawal dengan Mutasi Setempat
ld-var2 ‐ Metrik Pembolehubah Memori Terhad Beralih, Kedudukan 2
ld-var1 ‐ Metrik Pembolehubah Memori Terhad Beralih, Kedudukan 1
ld-mma ‐ Kaedah Menggerakkan Asimtot
ld-lbfgs-nocedal - Tiada
ld-lbfgs ‐ BFGS storan rendah
gn-direct-l ‐ Membahagi Segi empat tepat (pincang tempatan)
tiada ‐ jangan nyatakan algoritma
ln-bobyqa ‐ Pengoptimuman Terhad Terhad bebas terbitan
ln-sbplx ‐ Varian subplex Nelder-Mead
ln-newuoa-terikat ‐ Pengoptimuman terikat terikat bebas terbitan oleh
Penghampiran Kuadratik Dibina Secara Berulang
ln-praksis ‐ Pengoptimuman Tempatan tanpa kecerunan melalui Paksi-Principal
kaedah
gn-direct-noscal ‐ Membahagi Segi Empat (tidak berskala)
ld-tnewton-precond-restart ‐ Newton Terpenggal prasyarat dengan
mulakan semula turunan paling curam
yang lebih rendah = -inf; berganda
Sempadan bawah (sama untuk semua parameter).
maksiter = 100; int dalam [1, inf)
Kriteria berhenti: bilangan maksimum lelaran.
pilih = ld-lbfgs; dict
algoritma pengecilan utama. Nilai yang disokong ialah:
gn-orig-direct-l ‐ Membahagi Segiempat (pelaksanaan asal,
berat sebelah tempatan)
g-mlsl-lds ‐ Pautan Tunggal Berbilang Aras (jujukan percanggahan rendah,
memerlukan pengoptimuman dan sempadan berasaskan kecerunan tempatan)
gn-direct-l-noscal ‐ Membahagi Segi Empat (tidak berskala, berat sebelah setempat)
gn-isres ‐ Strategi Evolusi Kedudukan Stokastik yang dipertingkatkan
ld-tnewton ‐ Newton terpotong
gn-direct-l-rand ‐ Membahagi Segi empat tepat (pincang tempatan, rawak)
ln-newuoa ‐ Pengoptimuman Tanpa Kekangan Tanpa Derivatif secara Iteratif
Penghampiran Kuadratik Terbina
gn-direct-l-rand-noscale ‐ Membahagi Segi Empat (tidak berskala, setempat
berat sebelah, rawak)
gn-orig-direct ‐ Membahagi Segiempat (pelaksanaan asal)
ld-tnewton-precond ‐ Newton Terpenggal Prasyarat
ld-tnewton-restart ‐ Newton terpotong dengan mulakan semula menurun paling curam
gn-langsung ‐ Membahagi Segiempat
auglag-eq ‐ Algoritma Lagrangian ditambah dengan kekangan kesamaan
hanyalah
ln-neldermead ‐ Algoritma Nelder-Mead simplex
ln-cobyla ‐ Pengoptimuman Terkekang OLEH Penghampiran Linear
gn-crs2-lm ‐ Carian Rawak Terkawal dengan Mutasi Setempat
ld-var2 ‐ Metrik Pembolehubah Memori Terhad Beralih, Kedudukan 2
ld-var1 ‐ Metrik Pembolehubah Memori Terhad Beralih, Kedudukan 1
ld-mma ‐ Kaedah Menggerakkan Asimtot
ld-lbfgs-nocedal - Tiada
g-mlsl ‐ Pautan Tunggal Berbilang Peringkat (memerlukan pengoptimuman tempatan dan
sempadan)
ld-lbfgs ‐ BFGS storan rendah
gn-direct-l ‐ Membahagi Segi empat tepat (pincang tempatan)
ln-bobyqa ‐ Pengoptimuman Terhad Terhad bebas terbitan
ln-sbplx ‐ Varian subplex Nelder-Mead
ln-newuoa-terikat ‐ Pengoptimuman terikat terikat bebas terbitan oleh
Penghampiran Kuadratik Dibina Secara Berulang
auglag ‐ Algoritma Lagrangian tambahan
ln-praksis ‐ Pengoptimuman Tempatan tanpa kecerunan melalui Paksi-Principal
kaedah
gn-direct-noscal ‐ Membahagi Segi Empat (tidak berskala)
ld-tnewton-precond-restart ‐ Newton Terpenggal prasyarat dengan
mulakan semula turunan paling curam
ld-slsqp ‐ Pengaturcaraan Kuadratik Kuadrat Terkecil Berjujukan
langkah = 0; dua kali ganda dalam [0, inf)
Saiz langkah awal untuk kaedah bebas kecerunan.
berhenti = -inf; berganda
Kriteria berhenti: nilai fungsi jatuh di bawah nilai ini.
xtola = 0; dua kali ganda dalam [0, inf)
Kriteria penghentian: perubahan mutlak semua nilai-x berada di bawah ini
nilai.
xtolr = 0; dua kali ganda dalam [0, inf)
Kriteria penghentian: perubahan relatif semua nilai-x berada di bawah ini
nilai.
CONTOH
Daftarkan ujian imej.v ke ref.v imej dengan menggunakan penjelmaan spline dengan pekali
kadar 5 dan tulis imej berdaftar ke reg.v. Gunakan dua tahap multiresolusi, ssd sebagai
fungsi kos imej dan divcurl berwajaran 10.0 sebagai penalti kelancaran transformasi. The
transformasi yang terhasil disimpan dalam reg.vf.
mia-3dnonrigidreg-alt -o reg.vf -l 2 -f spline:rate=3 imej:cost=ssd,src=test.v,ref=ref.v
divcurl:berat=10
AUTHOR(s)
Gert Wollny
HAKCIPTA
Perisian ini adalah Hak Cipta (c) 1999‐2015 Leipzig, Jerman dan Madrid, Sepanyol. Ia datang
dengan BENAR-BENAR TIADA WARANTI dan anda boleh mengagihkannya semula di bawah syarat-syarat GNU
LESEN AWAM AM Versi 3 (atau lebih baru). Untuk maklumat lanjut jalankan program dengan
pilihan '--hak cipta'.
Gunakan mia-3dnonrigidreg-alt dalam talian menggunakan perkhidmatan onworks.net
