miview - Dalam talian di Awan

JADUAL:

NAMA

miview - Pemapar untuk fail imej perubatan

SINOPSIS

miview [ pilihan ]

DESCRIPTION

miview: Viewer untuk fail imej perubatan

Format fail dikenal pasti secara automatik oleh sambungan failnya.

Global pilihan yang berikut:
-meletupkan: Besarkan saiz paparan dengan faktor ini (lalai=1)

-terang: Kecerahan relatif paparan (lalai=0.0)

-warna: Gunakan peta warna untuk memaparkan nilai

-kontras: Kontras relatif paparan (lalai=0.0)

-pembuangan: Buang semua imej sebagai fail bitmap(bmp) dan keluar, gunakan awalan nama fail yang diberikan

-legenda: Eksport legenda sebagai peta bit ke fail ini

-rendah: Sempadan tetingkap bawah: Nilai ini akan kelihatan hitam dalam paparan

-peta: Muatkan peta tindanan (voksel berwarna ditindih pada imej) daripada fail ini

-malegend: Eksport legenda peta sebagai peta bit ke fail ini

-maplo: Sempadan tetingkap bawah untuk peta tindanan (lalai=0.0)

-maprect: Saiz relatif segi empat tepat yang mewakili voxel peta tindanan
(lalai=0.60)

-mapupp: Sempadan tetingkap atas untuk peta tindanan (lalai=0.0)

-noscale: Lumpuhkan skala dalam paparan 2D/3D

-rec: Rekod koordinat dan nilai yang diklik ke dalam fail ini

-upp: Sempadan tetingkap atas: Nilai ini akan kelihatan putih dalam paparan

-val: Simpan nilai pilihan ROI/mata ke fail ini

-v atau untuk penyahpepijatan/pengesanan semua komponen atau satu
komponen, masing-masing. Nilai yang mungkin untuk loglevel ialah: 0(noLog), 1(errorLog),
2(warningLog), 3(infoLog).

fMRI pilihan (Beri at kurangnya -Reka bentuk and -fmri kepada aktifkan):
-bonferr: Gunakan pembetulan Bonferroni

-corr: Ambang kebarangkalian ralat untuk korelasi (lalai=0.050)

-davg: Lancarkan fungsi reka bentuk menggunakan penapis purata bergerak lebar N (TR)
(lalai=0)

-Reka bentuk: Muatkan reka bentuk fMRI daripada fail ini (diasingkan koma atau ruang)

-fmask: fail topeng fMRI

-fmri: Muatkan data fMRI daripada fail ini

-hrf: Menggabungkan fungsi reka bentuk dengan fungsi tindak balas hemodinamik sebelum korelasi (lihat
Glover NeuroImage 9, 416-429)

-jiran: Minimum jiran sebelah dengan pengaktifan yang ketara (lalai=1)

- kursus: Buang kursus masa perubahan isyarat fMRI relatif ke fail ini

-smap: Buang peta perubahan isyarat fMRI relatif kepada fail ini

-zmap: Buang peta skor z ke fail ini

-zskor: z-Score ambang untuk korelasi (lalai=0.0)

File membaca pilihan yang berikut:
-Tarikh: Tarikh imbasan [yyyymmdd] (default=20140807yyyymmdd)

-fp: FOV dalam arah fasa [mm] (lalai=220.0mm)

-fr: FOV dalam arah baca [mm] (lalai=220.0mm)

-fs: FOV dalam arah hirisan [mm] (lalai=5.0mm)

-nr: Bilangan ukuran berturut-turut (lalai=1)

-nx: Bilangan mata dalam arah bacaan (lalai=1)

-ny: Bilangan titik dalam arah fasa (lalai=1)

-nz: Bilangan titik dalam arah hirisan (lalai=1)

-kelahiran: Tarikh lahir pesakit [yyyymmdd] (default=00000000yyyymmdd)

-pid: Pengecam pesakit yang unik (lalai=Tidak diketahui)

-pname: Nama penuh pesakit (lalai=Tidak diketahui)

-seks: Jantina pesakit (pilihan=MFO , lalai=O)

-pweight: Berat pesakit [kg] (lalai=50.0kg)

-saintis: Nama Saintis (default=Unknown)

-sd: Jarak antara kepingan (dari tengah ke tengah) [mm] (lalai=10.0mm)

-serd: Perihalan Siri (lalai=Tidak diketahui)

-serno: Nombor Siri (lalai=1)

-st: Ketebalan kepingan [mm] (lalai=5.0mm)

-kancing: Penerangan Kajian (lalai=Tidak diketahui)

-tcname: Nama gegelung hantaran (lalai=Tidak diketahui)

-teh: Masa untuk gema jujukan [ms] (lalai=80.0ms)

-masa: Masa imbasan [hhmmss] (lalai=090951hhmmss)

-tr: Masa antara pengujaan berturut-turut [ms] (lalai=1000.0ms)

-cplx: Anggap data sebagai kompleks dan ekstrak komponen yang diberikan (pilihan=tiada abs pha real
imag , lalai=tiada)

-d: Indeks set data untuk mengekstrak jika berbilang set data dibaca

-penapis: Baca hanya set data yang parameter protokol 'kunci' mengandungi rentetan
'value' (diberikan dalam format 'key=value')

-fmap: Untuk mengurangkan penggunaan memori, teruskan pemetaan filem selepas membaca data (mentah), tetapi menulis
ke dalam tatasusunan akan mengakibatkan ranap sistem

-jdx: Jika berbilang tatasusunan JDX hadir, pilih ini

-dialek: Baca data menggunakan dialek format yang diberikan. (lalai bukan dialek)

-rf: Format baca, gunakannya untuk mengatasi sambungan fail (options=autodetect 3db analysis asc
coi dat dcm double float gz hdr idx ima interfile jdx mag mhd nii ph png pos pro
reg s16bit s32bit s8bit smp u16bit u32bit u8bit , lalai=autodetek)

-langkau: Langkau jumlah bait ini sebelum membaca data mentah (lalai=0)

Penapis:
-selaraskan : Jajarkan data kepada geometri (lokasi voxel) bagi
fail luaran

-automask : Cipta topeng menggunakan ambang berasaskan histogram automatik

-kelompok : Buat kelompok voxel bersebelahan/sebelah bukan sifar, diisih mengikut saiz

-belit <konvolusi kernel (Gauss NoFilter Triangle Hann Hamming CosSq Blackman
BlackmanNuttall Exp ), diameter kernel [mm]> : Konvolusi dalam dimensi spatial

-detrend <Bilangan komponen frekuensi rendah untuk dialih keluar, Sifar min terhasil
timecourse> : Keluarkan drift perlahan dari semasa ke semasa

-edit <Rentetan kedudukan/julat dalam format (jangka masa, slicepos, phasepos, readpos), nilai baharu
of voxel> : Edit nilai voxel tunggal

-genmask : Buat topeng termasuk semua voxel dengan nilai
dalam julat yang diberikan

-isotrop : membuat voxel imej isotrop melalui interpolasi (imej
geometri tidak akan berubah)

-PAS Rendah : Penapisan laluan rendah

-maks : Klip semua nilai melebihi nilai maksimum

-maxip : Lakukan unjuran keamatan maksimum
atas arahan yang diberikan

-bercantum : Gabungkan set data ke dalam set data tunggal dengan mengembangkan dimensi masa

-min : Klip semua nilai di bawah nilai minimum

-minip : Lakukan unjuran keamatan minimum
atas arahan yang diberikan

-tiadaNaN : Menggantikan setiap NaN dengan nilai yang diberikan

-pflip : Balikkan data mengikut arah fasa

-prange : Pilih julat dalam
arah fasa

-proj : Lakukan unjuran min atas yang diberikan
arah

-quantilmask : Buat topeng termasuk semua voxel di atas pecahan yang diberikan
ambang

-sampel semula : Saiz sementara data imej

-menukar saiz : Saiz spatial data imej

-relice : mengimbas semula imej kepada yang diberikan
orientasi

-rflip : Balikkan data ke arah bacaan

-busuk : Putaran dalam satah

-atur : Pilih julat dalam
membaca arahan

-skala : Skala semula nilai imej

-sflip : Balikkan data mengikut arah hirisan

-anjakan <readAnjakan arah [piksel],fasaAnjakan arah [piksel],sliceAnjakan arah
[pixel]> : Alihkan data secara spatial

-masa potong : Betul untuk
titik masa pemerolehan yang berbeza bagi kepingan

-sambatan : splices the
imej mengikut arah yang diberikan

-srange : Pilih julat dalam
arah hirisan

-swapdim <[rps][-],[rps][-],[rps][-]> : menukar/mencerminkan dimensi dengan menentukan arah
tiga kali ganda dengan tanda pantulan pilihan dilampirkan

-jubin : Gabungkan kepingan menjadi imej 2D segi empat sama

-pelik : Pilih julat dalam
arah masa

-pergi : Alihkan data dalam masa

-typemax : Klip semua nilai melebihi maksimum jenis data tertentu

-typemin : Klip semua nilai di bawah minimum jenis data tertentu

-usemask : Buat set data 1D termasuk semua nilai dalam topeng daripada fail

Disokong fail sambungan (format):
3db (data binari Iris3D)

menganalisis
(NIFTI/ANALYZE, dialek: fsl )

asc (ASCII, dialek: tcourse )

coi (set data JCAMP-DX)

dat (matriks data 2D Matlab ascii)

dcm (DICOM, dialek: siemens )

berganda (data mentah berganda)

terapung (mengapungkan data mentah)

gz (bekas GNU-Zip untuk format lain)

hdr (Interfile, dialek: neurostat )

hdr (NIFTI/ANALYZE, dialek: fsl )

idx (indeks 3D bukan sifar dalam ASCII)

ima (DICOM, dialek: siemens )

antara fail
(Interfile, dialek: neurostat )

jdx (format imej JCAMP-DX)

mag (DICOM, dialek: siemens )

mhd (MetaImage)

nii (NIFTI/ANALYZE, dialek: fsl )

ph (DICOM, dialek: siemens )

png (Grafik Rangkaian Mudah Alih)

pos (kedudukan xy bukan sifar dalam ASCII)

pro (protokol pengukuran ODIN)

reg (Ansoft HFSS ASCII)

s16bit (data mentah 16 bit yang ditandatangani)

s32bit (data mentah 32 bit yang ditandatangani)

s8bit (data mentah 8 bit yang ditandatangani)

smp (set data JCAMP-DX)

u16bit (data mentah 16 bit tidak ditandatangani)

u32bit (data mentah 32 bit tidak ditandatangani)

u8bit (data mentah 8 bit tidak ditandatangani)

Gunakan miview dalam talian menggunakan perkhidmatan onworks.net