Ini ialah otot arahan yang boleh dijalankan dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks menggunakan salah satu daripada berbilang stesen kerja dalam talian percuma kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MAC OS.
JADUAL:
NAMA
otot - Penjajaran Urutan Protein Pelbagai
SINOPSIS
otot -in input fail (fasta) [-keluar output fail (lalai puasa)] [-diag] [-log log fail]
[-maxiter n] [-maksimum jam n] [-maksmb m] [-html] [-msf] [-clw] [-clwstrict]
[-log[a] fail log] [-senyap] [-stabil] [-kumpulan] [-turun]
DESCRIPTION
Halaman manual ini mendokumentasikan secara ringkas otot perintah.
otot menyelaraskan urutan protein dan dianggap lebih unggul dan lebih cepat daripada Clustal W.
PILIHAN
-in input fail
Laluan ke fail input berformat FASTA
-keluar output fail
Laluan ke fail output, FASTA diformatkan secara lalai
-diag
Cari pepenjuru (lebih cepat untuk jujukan yang serupa)
-maxiter n
Bilangan maksimum lelaran (integer, lalai 16)
-maksimum jam n
Masa maksimum untuk berulang dalam jam (lalai tiada had)
-maksmb m
Memori maksimum untuk diperuntukkan dalam Mb (lalai 80% daripada RAM)
-html
Tulis output dalam format HTML (lalai FASTA)
-msf
Tulis output dalam format MSF (FASTA lalai)
-clw
Tulis output dalam format Clustal W (FASTA lalai)
-clwstrict
Sebagai -clw, dengan pengepala ´CLUSTAL W (1.81)´
-log[a] fail log
Log ke fail (tambah jika -loga, tulis ganti jika -log)
-senyap
Jangan tulis mesej kemajuan kepada stderr
-stabil
Urutan output dalam susunan input (lalai ialah -kumpulan)
-kumpulan
Kumpulan jujukan mengikut persamaan (ini adalah lalai)
-turun
Paparkan maklumat versi dan keluar
Gunakan otot dalam talian menggunakan perkhidmatan onworks.net
