Ini ialah arahan pregap4 yang boleh dijalankan dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks menggunakan salah satu daripada berbilang stesen kerja dalam talian percuma kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MAC OS.
JADUAL:
NAMA
pregap4 - sediakan data mentah daripada instrumen penjujukan untuk kegunaan dengan gap4 (sebahagian daripada staden
pakej)
DESCRIPTION
Sebelum masuk ke dalam pangkalan data gap4, data mentah daripada instrumen penjujukan perlu
melalui beberapa proses, seperti saringan untuk vektor, penilaian kualiti, dan
penukaran format data. Pregap4 digunakan untuk melepasi kumpulan bacaan melalui ini
langkah secara automatik. Ia menyediakan antara muka untuk menyediakan dan mengkonfigurasi
pemprosesan dan untuk mengawal laluan bacaan melalui setiap peringkat. The
tugasan berasingan dipanggil "modul" dan setiap modul biasanya diuruskan oleh yang berdedikasi
program. Pregap4 membungkus semua modul ini ke dalam satu persekitaran yang mudah digunakan, sementara itu
mengekalkan fleksibiliti untuk memilih dan melanjutkan modul pemprosesan. Ia adalah, sebagai
namun, penggantian program pregap Bonfield, JK dan Staden, R.
Fail percubaan dan aplikasinya semasa projek penjujukan berskala besar. DNA
Urutan 6, 109-117 (1996).
Gunakan pregap4 dalam talian menggunakan perkhidmatan onworks.net
