Ini ialah apl Linux bernama Alphafold yang keluaran terbarunya boleh dimuat turun sebagai Alphafoldv2.3.2.zip. Ia boleh dijalankan dalam talian dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks untuk stesen kerja.
Muat turun dan jalankan dalam talian apl bernama Alphafold ini dengan OnWorks secara percuma.
Ikut arahan ini untuk menjalankan apl ini:
- 1. Memuat turun aplikasi ini dalam PC anda.
- 2. Masukkan dalam pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 3. Muat naik aplikasi ini dalam pengurus filem tersebut.
- 4. Mulakan OnWorks Linux dalam talian atau emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MACOS dari tapak web ini.
- 5. Daripada OS Linux OnWorks yang baru anda mulakan, pergi ke pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 6. Muat turun aplikasi, pasang dan jalankan.
SKRIN
Ad
Alphafold
DESCRIPTION
Pakej ini menyediakan pelaksanaan saluran paip inferens AlphaFold v2.0. Ini adalah model baharu yang telah dimasukkan dalam CASP14 dan diterbitkan dalam Nature. Untuk kesederhanaan, kami merujuk model ini sebagai AlphaFold di seluruh dokumen ini. Mana-mana penerbitan yang mendedahkan penemuan yang timbul daripada menggunakan kod sumber ini atau parameter model hendaklah memetik kertas AlphaFold. Sila rujuk juga kepada Maklumat Tambahan untuk penerangan terperinci tentang kaedah tersebut. Anda boleh menggunakan versi AlphaFold yang dipermudahkan sedikit dengan buku nota Colab ini atau versi yang disokong komuniti. Jumlah saiz muat turun untuk pangkalan data penuh adalah sekitar 415 GB dan jumlah saiz apabila dibuka zip ialah 2.2 TB. Sila pastikan anda mempunyai ruang cakera keras yang cukup besar, lebar jalur dan masa untuk memuat turun. Kami mengesyorkan menggunakan SSD untuk prestasi carian genetik yang lebih baik.
Ciri-ciri
- AlphaFold memerlukan beberapa pangkalan data genetik (jujukan) untuk dijalankan
- Walaupun kod AlphaFold dilesenkan di bawah Lesen Apache 2.0, parameter AlphaFold disediakan untuk kegunaan bukan komersial
- 5 model yang digunakan semasa CASP14, dan telah disahkan secara meluas untuk kualiti ramalan struktur
- 5 model pTM, yang telah diperhalusi untuk menghasilkan pTM
- Cara paling mudah untuk menjalankan AlphaFold ialah menggunakan skrip Docker yang disediakan
- Secara lalai, Alphafold akan cuba menggunakan semua peranti GPU yang boleh dilihat
Bahasa Pengaturcaraan
Python
Kategori
Ini adalah aplikasi yang juga boleh diambil dari https://sourceforge.net/projects/alphafold.mirror/. Ia telah dihoskan dalam OnWorks untuk dijalankan dalam talian dengan cara yang paling mudah daripada salah satu Sistem Operasi percuma kami.
