Ini ialah apl Linux bernama BamBam yang keluaran terbarunya boleh dimuat turun sebagai bambam-1.4.tgz. Ia boleh dijalankan dalam talian dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks untuk stesen kerja.
Muat turun dan jalankan dalam talian apl bernama BamBam ini dengan OnWorks secara percuma.
Ikut arahan ini untuk menjalankan apl ini:
- 1. Memuat turun aplikasi ini dalam PC anda.
- 2. Masukkan dalam pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 3. Muat naik aplikasi ini dalam pengurus filem tersebut.
- 4. Mulakan OnWorks Linux dalam talian atau emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MACOS dari tapak web ini.
- 5. Daripada OS Linux OnWorks yang baru anda mulakan, pergi ke pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 6. Muat turun aplikasi, pasang dan jalankan.
BamBam
Ad
DESCRIPTION
BamBam menyertakan banyak alat untuk menganalisis data penjujukan DNA generasi seterusnya. Alat disediakan untuk memanggil SNP dan indel, mengenal pasti pemadaman skala besar, menjadualkan kiraan bacaan dipetakan, analisis metilasi dan banyak lagi.
Bergantung pada SAMtools (http://samtools.sourceforge.net/) dan BAMtools (https://github.com/pezmaster31/bamtools). Juga menggunakan BioPerl, yang disertakan dalam tarball muat turun.
Ciri-ciri
- panggil SNP dan indel
- mengaitkan genotip
- membina urutan konsensus
- jadualkan kiraan bacaan yang dipetakan (RNA-seq)
- menyimpulkan fasa haplotaip dengan pengelompokan K-means
- menganalisis metilasi DNA (jujukan bisulfit)
Penonton
Sains/Penyelidikan
Bahasa Pengaturcaraan
Perl, C++
Kategori
Ini adalah aplikasi yang juga boleh diambil dari https://sourceforge.net/projects/bambam/. Ia telah dihoskan dalam OnWorks untuk dijalankan dalam talian dengan cara yang paling mudah daripada salah satu Sistem Operasi percuma kami.