Ini ialah apl Linux bernama BLAST Ring Image Generator yang keluaran terbarunya boleh dimuat turun sebagai BRIG-0.95-dist.zip. Ia boleh dijalankan dalam talian dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks untuk stesen kerja.
Muat turun dan jalankan dalam talian aplikasi ini bernama BLAST Ring Image Generator dengan OnWorks secara percuma.
Ikut arahan ini untuk menjalankan apl ini:
- 1. Memuat turun aplikasi ini dalam PC anda.
- 2. Masukkan dalam pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 3. Muat naik aplikasi ini dalam pengurus filem tersebut.
- 4. Mulakan OnWorks Linux dalam talian atau emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MACOS dari tapak web ini.
- 5. Daripada OS Linux OnWorks yang baru anda mulakan, pergi ke pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 6. Muat turun aplikasi, pasang dan jalankan.
SKRIN
Ad
Penjana Imej Cincin BLAST
DESCRIPTION
BRIG ialah aplikasi merentas platform (Windows/Mac/Unix) yang boleh memaparkan perbandingan bulat antara sejumlah besar genom, dengan tumpuan pada pengendalian data pemasangan genom.Sila sebut kertas BRIG jika BRIG digunakan untuk menjana angka untuk penerbitan: NF Alikhan, NK Petty, NL Ben Zakour, SA Beatson (2011) BLAST Ring Image Generator (BRIG): perbandingan genom prokariot ringkas, BMC Genomics, 12:402. PMID: 21824423
Ciri-ciri
- Imej menunjukkan persamaan antara jujukan rujukan pusat dan jujukan lain sebagai cincin sepusat.
- BRIG akan melakukan semua perbandingan BLAST dan penghuraian fail secara automatik melalui GUI mudah.
- Sempadan contig dan liputan baca boleh dipaparkan untuk draf genom; graf dan anotasi tersuai boleh dipaparkan.
- Menggunakan set gen yang ditentukan pengguna sebagai input, BRIG boleh memaparkan kehadiran gen, ketiadaan, pemotongan atau variasi jujukan dalam set genom lengkap, draf genom atau bahkan data jujukan mentah yang belum dipasang.
- BRIG juga menerima fail pemetaan baca berformat SAM yang membolehkan kawasan genomik hadir dalam data jujukan yang belum dipasang daripada berbilang sampel untuk dibandingkan secara serentak
Penonton
Sains/Penyelidikan
Bahasa Pengaturcaraan
Java
Ini adalah aplikasi yang juga boleh diambil dari https://sourceforge.net/projects/brig/. Ia telah dihoskan dalam OnWorks untuk dijalankan dalam talian dengan cara yang paling mudah daripada salah satu Sistem Operasi percuma kami.