Ini ialah apl Linux bernama clusterProfiler yang keluaran terbarunya boleh dimuat turun sebagai clusterProfilersourcecode.tar.gz. Ia boleh dijalankan dalam talian dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks untuk stesen kerja.
Muat turun dan jalankan dalam talian apl bernama clusterProfiler ini dengan OnWorks secara percuma.
Ikut arahan ini untuk menjalankan apl ini:
- 1. Memuat turun aplikasi ini dalam PC anda.
- 2. Masukkan dalam pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 3. Muat naik aplikasi ini dalam pengurus filem tersebut.
- 4. Mulakan OnWorks Linux dalam talian atau emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MACOS dari tapak web ini.
- 5. Daripada OS Linux OnWorks yang baru anda mulakan, pergi ke pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 6. Muat turun aplikasi, pasang dan jalankan.
SKRIN
Ad
clusterProfiler
DESCRIPTION
clusterProfiler ialah pakej R/Bioconductor yang menyediakan aliran kerja bersatu untuk analisis pengayaan berfungsi untuk mentafsir hasil omik pemprosesan tinggi. Ia menyokong kedua-dua analisis perwakilan berlebihan dan analisis pengayaan set gen, membolehkan anda bekerja dengan senarai gen tidak berperingkat atau statistik kedudukan daripada saluran paip pembezaan. Pakej ini disambungkan kepada pelbagai pangkalan pengetahuan—seperti Ontologi Gene, KEGG, Reactome, Ontologi Penyakit, MeSH dan lain-lain—melalui antara muka yang konsisten supaya anda boleh menanyakan kanta biologi yang berbeza tanpa menulis semula kod. Ia direka bentuk untuk keluasan, meliputi ciri pengekodan dan bukan pengekodan dan beribu-ribu organisma dengan memanfaatkan anotasi yang dikemas kini secara berterusan. Keputusan dikembalikan dalam struktur yang kemas, mesra manipulasi dan berpasangan secara semula jadi dengan fungsi visualisasi yang kaya (melalui alat pengiring) untuk meringkaskan laluan, istilah dan perhubungan set gen.
Ciri-ciri
- Aliran kerja ORA dan GSEA bersatu merentas pelbagai sumber anotasi
- Sokongan spesies luas menggunakan anotasi gen terkini
- Output kemas yang disepadukan dengan bersih dengan saluran paip data R hiliran
- Visualisasi hasil pengayaan terbina dalam melalui alat plot pendamping
- Utiliti perbandingan berbilang kumpulan (cth, compareCluster) untuk analisis silang keadaan
- Vignette dan manual terperinci untuk kajian pengayaan hujung ke hujung yang boleh diterbitkan semula
Bahasa Pengaturcaraan
R
Kategori
Ini adalah aplikasi yang juga boleh diambil dari https://sourceforge.net/projects/clusterprofiler.mirror/. Ia telah dihoskan dalam OnWorks untuk dijalankan dalam talian dengan cara yang paling mudah daripada salah satu Sistem Operasi percuma kami.
