Ini ialah apl Linux bernama iMSAT untuk dijalankan di Linux dalam talian yang keluaran terbarunya boleh dimuat turun sebagai SSRs.zip. Ia boleh dijalankan dalam talian dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks untuk stesen kerja.
Muat turun dan jalankan dalam talian apl bernama iMSAT ini untuk dijalankan di Linux dalam talian dengan OnWorks secara percuma.
Ikut arahan ini untuk menjalankan apl ini:
- 1. Memuat turun aplikasi ini dalam PC anda.
- 2. Masukkan dalam pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 3. Muat naik aplikasi ini dalam pengurus filem tersebut.
- 4. Mulakan OnWorks Linux dalam talian atau emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MACOS dari tapak web ini.
- 5. Daripada OS Linux OnWorks yang baru anda mulakan, pergi ke pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 6. Muat turun aplikasi, pasang dan jalankan.
SKRIN
Ad
iMSAT untuk dijalankan di Linux dalam talian
DESCRIPTION
iMSAT mewakili kemas kini penuh program vcf2MSAT. Program python baris arahan ini membolehkan pengguna menggunakan data polimorfisme yang dijana menggunakan alat SAM dan BAM serta fail penjajaran .fasta untuk mencari penanda mikrosatelit polimorfik (MSAT atau STR). Dengan mengenal pasti pembuat polimorfik, dan bukannya kawasan berulang yang mudah seperti yang telah dilakukan oleh program sebelumnya, iMSAT meningkatkan kelajuan MSAT polimorfik yang boleh dikenal pasti -- menjimatkan masa dan wang berharga penyelidik. melawat http://www.biomedcentral.com/1471-2164/15/858/abstract untuk artikel pdf yang menerangkan kegunaan iMSAT dan jika anda menggunakan program ini, sila nyatakan artikel ini sebagai: Andersen dan Mills: iMSAT: pendekatan baru untuk pembangunan lokus mikrosatelit menggunakan perpustakaan Illumina berkod bar. BMC Genomics 2014 15:858.Ciri-ciri
- Pengenalpastian Mikrosatelit Polimorfik
- Penjujukan Illumina
- Analisis Genomik
Penonton
Sains/Penyelidikan
Antaramuka pengguna
Barisan arahan
Bahasa Pengaturcaraan
Python
Ini adalah aplikasi yang juga boleh diambil dari https://sourceforge.net/projects/imsat/. Ia telah dihoskan dalam OnWorks untuk dijalankan dalam talian dengan cara yang paling mudah daripada salah satu Sistem Operasi percuma kami.
