Ini ialah apl Linux bernama MCPerm: pilih atur SNP Monte Carlo yang keluaran terbaharunya boleh dimuat turun sebagai MCPerm_1.1.2.tar.gz. Ia boleh dijalankan dalam talian dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks untuk stesen kerja.
Muat turun dan jalankan dalam talian aplikasi bernama MCPerm: Monte Carlo SNP pilih atur dengan OnWorks secara percuma.
Ikut arahan ini untuk menjalankan apl ini:
- 1. Memuat turun aplikasi ini dalam PC anda.
- 2. Masukkan dalam pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 3. Muat naik aplikasi ini dalam pengurus filem tersebut.
- 4. Mulakan OnWorks Linux dalam talian atau emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MACOS dari tapak web ini.
- 5. Daripada OS Linux OnWorks yang baru anda mulakan, pergi ke pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 6. Muat turun aplikasi, pasang dan jalankan.
MCPerm: Pilih atur SNP Monte Carlo
Ad
DESCRIPTION
MCPerm: Kaedah pilih atur Monte Carlo untuk korelasi ujian berbilang dalam kajian persatuan kawalan kes
Ujian pilih atur tradisional (TradPerm) ialah kaedah analisis bukan parametrik yang penting yang boleh dianggap sebagai standard emas untuk pelbagai pembetulan ujian dalam kajian persatuan kawalan kes. Walau bagaimanapun, ia bergantung pada genotip dan data fenotip tunggal nukleotida polimorfisme (SNP) asal untuk melakukan sejumlah besar shuffle rawak, dan oleh itu ia adalah intensif secara pengiraan, terutamanya untuk kajian persatuan seluruh genom (GWAS). Untuk meningkatkan kelajuan pengiraan tanpa mengubah saiz nilai p TradPerm, kami membangunkan kaedah pilih atur Monte Carlo (MCPerm) sebagai alternatif yang cekap kepada TradPerm.
Kaedah: MCPerm tidak perlu mengocok data genotip dan fenotip asal. Ia menggunakan kaedah Monte Carlo, menggunakan taburan hipergeometri dua langkah untuk menjana nombor rawak genotip (AA, Aa dan aa) dalam kes dan kawalan.
Bahasa Pengaturcaraan
S / r
Kategori
Ini adalah aplikasi yang juga boleh diambil dari https://sourceforge.net/projects/mcperm/. Ia telah dihoskan dalam OnWorks untuk dijalankan dalam talian dengan cara yang paling mudah daripada salah satu Sistem Operasi percuma kami.
