Ini ialah apl Linux bernama MSL yang keluaran terbarunya boleh dimuat turun sebagai mslib-1.1.0.9.tgz. Ia boleh dijalankan dalam talian dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks untuk stesen kerja.
Muat turun dan jalankan dalam talian apl bernama MSL ini dengan OnWorks secara percuma.
Ikut arahan ini untuk menjalankan apl ini:
- 1. Memuat turun aplikasi ini dalam PC anda.
- 2. Masukkan dalam pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 3. Muat naik aplikasi ini dalam pengurus filem tersebut.
- 4. Mulakan OnWorks Linux dalam talian atau emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MACOS dari tapak web ini.
- 5. Daripada OS Linux OnWorks yang baru anda mulakan, pergi ke pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 6. Muat turun aplikasi, pasang dan jalankan.
MSL
Ad
DESCRIPTION
MSL ialah perpustakaan C++ yang membolehkan kajian pengiraan makromolekul.
Perpustakaan MSL bukanlah program (walaupun beberapa aplikasi diedarkan) tetapi alat untuk saintis untuk mengekod kaedah pemodelan molekul mereka sendiri.
Falsafah
Matlamat utama adalah untuk mencipta satu set alat yang membolehkan kajian pengiraan makromolekul dengan relatif mudah di semua peringkat, daripada operasi mudah (contohnya, memuatkan PDB dan mengukur jarak atau mengedit dihedral) kepada aplikasi kompleks (pemodelan protein atau reka bentuk).
MSL dibangunkan di Makmal Senes di Universiti Wisconsin-Madison dan oleh pasukan pembangun/pengguna dari makmal penyelidikan lain.
rujukan:
Kulp DW, Subramaniam S, Donald JE, Hannigan BT, Mueller BK, Grigoryan G, Senes A.
Informatik struktur, pemodelan dan reka bentuk dengan Perpustakaan Perisian Molekul (MSL) sumber terbuka.
J Comput Chem. 2012 jld. 33 muka surat 1645-61
Muat turun artikel di http://dx.doi.org/10.1002/jcc.22968
Ciri-ciri
- Keupayaan menyimpan dan menukar antara berbilang koordinat atom, untuk perubahan konformasi dan perwakilan berputar kebebasan konformasi rantai sisi.
- Keupayaan untuk membina dan menyimpan berbilang identiti sisa (iaitu LEU, ILE, ALA) pada kedudukan dan bertukar antara mereka.
- # Medan daya CHARMM dan fungsi tenaga lain.
- Transformasi seperti terjemahan, putaran dan penjajaran.
- Algoritma carian seperti Monte Carlo, Dead End Elimination dan Self Consistent Mean Field Monte Carlo., pensampelan tulang belakang
- Penjanaan kekisi kristal.
- Sokongan untuk perpustakaan rotamer
- Pengubahsuaian dan penjanaan tulang belakang
- Platform yang disokong: Linux, MacOS
Penonton
Sains/Penyelidikan
Bahasa Pengaturcaraan
C + +
Kategori
Ini adalah aplikasi yang juga boleh diambil dari https://sourceforge.net/projects/mslib/. Ia telah dihoskan dalam OnWorks untuk dijalankan dalam talian dengan cara yang paling mudah daripada salah satu Sistem Operasi percuma kami.
