Ini ialah apl Linux bernama NGSEP yang keluaran terbarunya boleh dimuat turun sebagai NGSEPwindows_4.3.2.zip. Ia boleh dijalankan dalam talian dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks untuk stesen kerja.
Muat turun dan jalankan dalam talian aplikasi bernama NGSEP ini dengan OnWorks secara percuma.
Ikut arahan ini untuk menjalankan apl ini:
- 1. Memuat turun aplikasi ini dalam PC anda.
- 2. Masukkan dalam pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 3. Muat naik aplikasi ini dalam pengurus filem tersebut.
- 4. Mulakan OnWorks Linux dalam talian atau emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MACOS dari tapak web ini.
- 5. Daripada OS Linux OnWorks yang baru anda mulakan, pergi ke pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 6. Muat turun aplikasi, pasang dan jalankan.
SKRIN
Ad
NGSEP
DESCRIPTION
NGSEP ialah rangka kerja bersepadu untuk analisis bacaan penjujukan throughput tinggi DNA pendek dan panjang. Versi semasa menyediakan fungsi untuk kedua-dua de-novo dan analisis berpandukan rujukan data penjujukan, termasuk pemasangan genom, pemetaan baca, pengesanan varian dan genotaip dan analisis de-novo data yang dijana daripada protokol perwakilan yang dikurangkan. NGSEP juga menyediakan modul untuk analisis pangkalan data variasi genomik (fail VCF), termasuk anotasi berfungsi, penapisan, penukaran format, perbandingan, pengelompokan, imputasi, analisis introgresi dan pelbagai jenis statistik. Sejak versi 4, kami menyediakan kefungsian untuk pengurusan genom dan transkriptom, termasuk penjajaran genom dan anotasi unsur boleh alih. Senarai lengkap fungsi tersedia dalam wiki kami (https://sourceforge.net/p/ngsep/wiki/Home/).
SEBELUM MUAT TURUN: Butang hijau menghala ke balang untuk penggunaan baris arahan. Lihat wiki untuk GUI dan pilihan lain
Ciri-ciri
- Perhimpunan genom de-novo
- Penjajaran bacaan mentah kepada genom rujukan
- Pengesanan SNP, CNV dan Varian Struktur
- Manipulasi VCF: anotasi berfungsi, cantum, penapis, bandingkan, penukaran format, imputasi
- Membaca Demultiplexing
- Penjajaran himpunan genom beranotasi
- Statistik dan penapisan pada annptations transkriptom dalam format GFF3
Penonton
Industri Penjagaan Kesihatan, Sains/Penyelidikan, Khalayak Lain, Pertanian
Antaramuka pengguna
Java SWT, Konsol/Terminal, Eclipse
Bahasa Pengaturcaraan
Java
Kategori
Ini adalah aplikasi yang juga boleh diambil dari https://sourceforge.net/projects/ngsep/. Ia telah dihoskan dalam OnWorks untuk dijalankan dalam talian dengan cara yang paling mudah daripada salah satu Sistem Operasi percuma kami.
