Ini ialah apl Linux bernama PASHA: Parallelized Short Read Assembly yang keluaran terbarunya boleh dimuat turun sebagai Pasha-1.0.10.tar.bz2. Ia boleh dijalankan dalam talian dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks untuk stesen kerja.
Muat turun dan jalankan dalam talian apl bernama PASHA ini: Perhimpunan Bacaan Pendek Parallelized dengan OnWorks secara percuma.
Ikut arahan ini untuk menjalankan apl ini:
- 1. Memuat turun aplikasi ini dalam PC anda.
- 2. Masukkan dalam pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 3. Muat naik aplikasi ini dalam pengurus filem tersebut.
- 4. Mulakan OnWorks Linux dalam talian atau emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MACOS dari tapak web ini.
- 5. Daripada OS Linux OnWorks yang baru anda mulakan, pergi ke pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 6. Muat turun aplikasi, pasang dan jalankan.
PASHA: Perhimpunan Bacaan Pendek Paralel
Ad
DESCRIPTION
PASHA ialah penghimpun bacaan pendek selari untuk genom besar menggunakan graf de Bruijn. Mengambil kesempatan daripada kedua-dua CPU berbilang teras memori kongsi dan kelompok pengiraan memori teragih, PASHA telah menunjukkan potensinya untuk melaksanakan pemasangan de-novo berkualiti tinggi bagi genom besar dalam masa yang munasabah dengan sumber pengkomputeran yang sederhana. Penilaian kami menggunakan tiga set data berpasangan sebenar yang kecil menunjukkan bahawa PASHA mampu menghasilkan pemasangan yang lebih baik dengan liputan genom yang setanding dan kadar salah pemasangan berbanding dengan tiga pemasang terkemuka: Velvet, ABySS dan SOAPdenovo. Selain itu, PASHA mencapai kelajuan terpantas untuk ketiga-tiga set data pada satu CPU. Untuk genom manusia, PASHA mencapai kualiti pemasangan yang kompetitif dengan ABySS dan mampu menyelesaikan pemasangan dalam kira-kira 21 jam, iaitu kira-kira 2.38× lebih pantas daripada ABySS pada konfigurasi perkakasan yang sama.
Antaramuka pengguna
Konsol/Terminal
Bahasa Pengaturcaraan
C + +
Kategori
Ini adalah aplikasi yang juga boleh diambil dari https://sourceforge.net/projects/pasha/. Ia telah dihoskan dalam OnWorks untuk dijalankan dalam talian dengan cara yang paling mudah daripada salah satu Sistem Operasi percuma kami.