Ini ialah apl Linux bernama primeScaff yang keluaran terbarunya boleh dimuat turun sebagai primeScaff-v1.6.1_linux_x86_64.tar.gz. Ia boleh dijalankan dalam talian dalam penyedia pengehosan percuma OnWorks untuk stesen kerja.
Muat turun dan jalankan dalam talian aplikasi bernama primeScaff ini dengan OnWorks secara percuma.
Ikut arahan ini untuk menjalankan apl ini:
- 1. Memuat turun aplikasi ini dalam PC anda.
- 2. Masukkan dalam pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 3. Muat naik aplikasi ini dalam pengurus filem tersebut.
- 4. Mulakan OnWorks Linux dalam talian atau emulator dalam talian Windows atau emulator dalam talian MACOS dari tapak web ini.
- 5. Daripada OS Linux OnWorks yang baru anda mulakan, pergi ke pengurus fail kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX dengan nama pengguna yang anda mahukan.
- 6. Muat turun aplikasi, pasang dan jalankan.
SKRIN
Ad
primeScaff
DESCRIPTION
primeScaff bertujuan untuk mengautomasikan proses yang kadangkala membosankan untuk mereka bentuk pasangan primer tertentu secara manual di sekeliling celah perancah genom dan mempercepatkan peringkat penamat genom bagi projek penjujukan genom. Ia menggabungkan penemuan ulangan de-novo menggunakan RECON untuk mengelakkan sebanyak mungkin mereka bentuk primer di kawasan berulang dan menawarkan kemungkinan untuk memperhalusi pilihan reka bentuk primer dengan mudah menggunakan primer3. Ia mengeluarkan anotasi ulangan, jurang dan primer dalam gff2 dan gff3 untuk memuatkan dan memvisualisasikan hasil dengan mudah menggunakan alat seperti UGENE (disyorkan) atau artemis.
Ciri-ciri
- Pelekatan berulang de novo menggunakan RECON secara berulang
- Reka bentuk automatik primer di sekitar ratusan celah dalam perancah dalam beberapa saat
- Boleh digunakan dalam mana-mana saluran paip pemasangan, hanya memerlukan fail FASTA standard
- Penyelesaian untuk projek pemasangan de novo tanpa rujukan rapat
Penonton
Sains/Penyelidikan
Antaramuka pengguna
Barisan arahan
Bahasa Pengaturcaraan
Perl
Kategori
Ini adalah aplikasi yang juga boleh diambil dari https://sourceforge.net/projects/primescaff/. Ia telah dihoskan dalam OnWorks untuk dijalankan dalam talian dengan cara yang paling mudah daripada salah satu Sistem Operasi percuma kami.
