Dit is de opdrachtbarrnap die kan worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider van OnWorks met behulp van een van onze meerdere gratis online werkstations zoals Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator of MAC OS online emulator
PROGRAMMA:
NAAM
Barrnap - snelle voorspelling van ribosomaal RNA
KORTE INHOUD
barnnap [opties]
PRODUCTBESCHRIJVING
Barrnap voorspelt de locatie van ribosomale RNA-genen in genomen. Het ondersteunt bacteriën
(5S,23S,16S), archaea (5S,5.8S,23S,16S), mitochondriën (12S,16S) en eukaryoten
(5S,5.8S,28S,18S).
OPTIES
--help Deze hulp
--versie
Afdrukversie en afsluiten
--citaat
Citaat afdrukken om naar barnnap te verwijzen
--koninkrijk [X]
Koninkrijk: mito bac arc euk (standaard 'bac')
--stil
Geen schermuitvoer (standaard UIT)
--draden [N]
Aantal threads/cores/CPU's om te gebruiken (standaard '8')
--lensafsnijding [nn] Proportionele lengtedrempel om als gedeeltelijk te labelen (standaard '0.8')
--afwijzen [nn]
Proportionele lengtedrempel om voorspelling af te wijzen (standaard '0.5')
--evalueren [nn]
Overeenkomst e-waarde cut-off (standaard '1e-09')
--incl
Voeg FASTA-invoerreeksen toe aan de GFF3-uitvoer (standaard UIT)
Barrnap online gebruiken met onworks.net-services
