bp_chaos_plotp - Online in de cloud

PROGRAMMA:

NAAM

bp_chaos_plot - een chaosplot van DNA- en RNA-sequenties

KORTE INHOUD

bp_chaos_plot.pl -i/--input=INPUTFILE -f/--format=SEQFORMAT
-o/--output=OUTPUTFILE -g/--graphics=GRAFISCH FORMAAT
-w/--breedte=GEWICHT -h/--hoogte=HOOGTE

PRODUCTBESCHRIJVING

Dit script genereert afbeeldingsbestanden met behulp van de GD-afbeeldingsbibliotheek om nucleotide te visualiseren
sequenties met behulp van chaosplot.

OPTIES

Geldige grafische formaten zijn momenteel gd, gd2, png, wbmp, jpeg en gif.

De standaardgrootte van het afbeeldingsbestand is 600x400.

De sequentie-invoer kan worden geleverd met behulp van een van de drie methoden:

naamloos argument
bp_chaos_plot bestandsnaam

genoemd argument
bp_chaos_plot -i bestandsnaam

standaard invoer
bp_chaos_plot < bestandsnaam

FEEDBACK

Mailing lijsten
Gebruikersfeedback is een integraal onderdeel van de evolutie van deze en andere Bioperl-modules. Versturen
uw opmerkingen en suggesties bij voorkeur naar de Bioperl mailinglijst. Uw deelname
wordt zeer op prijs gesteld.

[e-mail beveiligd] - Algemene discussie
http://bioperl.org/wiki/Mailing_lists - Over de mailinglijsten

Rapportage bugs
Rapporteer bugs aan het Bioperl-bugvolgsysteem om ons te helpen de bugs en hun
oplossing. Bugrapporten kunnen via het web worden ingediend:

https://github.com/bioperl/bioperl-live/issues

AUTEUR - Jason Stajicho

E-mail [e-mail beveiligd]

GESCHIEDENIS

Deze code is gebaseerd op EMBOSS C-code voor chaos.c door Ian Longden. Inbegrepen zijn
documentatie van EMBOSS-code:

Chaos produceert een chaosplot. De oorspronkelijke aanvraag maakt deel uit van het ACEDB-genoom
databasepakket, geschreven door ** Richard Durbin (MRC LMB, VK) [e-mail beveiligd] en
Jean Thierry-Mieg (CRBM du CNRS, Frankrijk) [e-mail beveiligd]

Gebruik bp_chaos_plotp online met behulp van onworks.net-services