Dit is de opdracht cassiopee die kan worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider van OnWorks met behulp van een van onze meerdere gratis online werkstations zoals Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator of MAC OS online emulator
PROGRAMMA:
NAAM
cassiopee - handleiding voor Cassiopee Versie 1.0
KORTE INHOUD
Cassiopee [Opties]
PRODUCTBESCHRIJVING
Gebruik:
-l: maximale indexdiepte / maximale patroongrootte
-u: index opslaan voor later gebruik
-s: volgorde om te indexeren
-p: patroon om te zoeken
-f: bestand met patroon om te zoeken
-o: uitvoerbestand
-r: boomreductie toepassen
-m: zoekmodus: 0=DNA, 1=RNA, 2=Eiwit
-a: zoeken op alfabetische ambiguïteit toestaan
-n: max. opeenvolgende N toegestane overeenkomsten in zoeken
-e: maximaal toegestane vervangingsovereenkomsten in zoeken
-i: max indel toegestane overeenkomsten in zoeken
-g: genereert een puntbestand van de grafiek
-d: maximale diepte van de grafiek
-t: uitvoerformaat: 0:tsv (standaard), 1:json
-x: minimale positie in volgorde
-y: maximale positie in volgorde
-v: versie tonen
-h: toon dit bericht
Cassiopee online gebruiken met onworks.net-services
