Dit is de opdracht EDTSurf die kan worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider van OnWorks met behulp van een van onze meerdere gratis online werkstations zoals Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator of MAC OS online emulator
PROGRAMMA:
NAAM
EDTSurf - snelle en nauwkeurige constructie van macromoleculaire oppervlakken
KORTE INHOUD
EDTSurf -i pdbnaam ...
PRODUCTBESCHRIJVING
EDTSurf is een open source programma om driehoekige oppervlakken voor macromoleculen te construeren. Het
genereert drie belangrijke macromoleculaire oppervlakken: van der Waals-oppervlak, toegankelijk voor oplosmiddelen
oppervlak en moleculair oppervlak (oppervlak zonder oplosmiddel). EDTsurf identificeert ook gaatjes
die zich in macromoleculen bevinden.
OPTIES
-o buitennaam
-t 1-MC 2-VCMC
-s 1-VWS 2-SAS 3-MS 4-SES
-c 1-zuivere 2-atoom 3-keten
-p Tastradius [0,2.0]
-f schaalfactor (0,20.0]
-h 1-in en uit 2-uit 3-in
output1: buitennaam.ply
output2: outname.asa
output3: outname-cav.pdb
Gebruik EDTSurf online met behulp van onworks.net-services
