Dit is de opdracht fastaq-trim_contigs die kan worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider van OnWorks met behulp van een van onze meerdere gratis online werkstations zoals Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator of MAC OS online emulator
PROGRAMMA:
NAAM
fastaq_trim_contigs - Knipt een bepaald aantal basen af van het einde van elke contig
PRODUCTBESCHRIJVING
gebruik: fastaq_trim_contigs [opties]
Snijdt een vast aantal basen af van het uiteinde van elke aaneenschakeling, zodat de gaten groter en aaneengesloten worden
uiteinden worden verwijderd. Basen worden vervangen door Ns. Elke reeks die eindigt met alle N's gaat verloren
positie- argumenten:
infile Naam van invoerbestand
uitbestand
Naam van uitvoerbestand
optioneel argumenten:
-h, --help
toon dit helpbericht en sluit af
--trim_nummer TRIM_NUMBER
Aantal basen dat rond elke opening moet worden bijgesneden, en buiten de uiteinden van elke reeks [100]
Gebruik fastaq-trim_contigs online met behulp van onworks.net-services
