Dit is het commando fastq_masker dat kan worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider van OnWorks met behulp van een van onze meerdere gratis online werkstations zoals Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator of MAC OS online emulator
PROGRAMMA:
NAAM
fastq_masker - Maskert nucleotiden met 'N' (of ander teken) op basis van kwaliteit
PRODUCTBESCHRIJVING
gebruik: fastq_masker [-h] [-v] [-q N] [-r C] [-z] [-i INFILE] [-o OUTFILE] Onderdeel van FASTX
Toolkit 0.0.14 door A. Gordon ([e-mail beveiligd])
[-h] = Dit handige helpscherm.
[-q N] = Kwaliteitsdrempel - nucleotiden met een lagere kwaliteit worden gemaskeerd
Standaard is 10.
[-r C] = Vervang nucleotiden van lage kwaliteit door karakter C. Standaard is 'N'
[-z] = Uitvoer comprimeren met GZIP.
[-i INFILE]
= FASTQ invoerbestand. standaard is STDIN.
[-o OUTFILE] = FASTQ-uitvoerbestand. standaard is STDOUT. [-v] = uitgebreid -
rapport aantal reeksen.
Als [-o] is opgegeven,
rapport wordt afgedrukt naar STDOUT.
Als [-o] niet is opgegeven (en de uitvoer gaat naar STDOUT), wordt het rapport afgedrukt naar
STDERR.
Gebruik fastq_masker online met behulp van onworks.net-services
