Dit is de opdracht maq.pl die kan worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider van OnWorks met behulp van een van onze meerdere gratis online werkstations zoals Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator of MAC OS online emulator
PROGRAMMA:
NAAM
maq.pl - helperscript voor maq
KORTE INHOUD
maq.mv [opties] [...]
PRODUCTBESCHRIJVING
helperscript voor maq
Versie: 0.4.7
OPTIES.
gemakkelijk rennen
eenvoudige pijplijn voor kleine dataset
demonstratie demonstratie van maq-functionaliteiten (alleen voor SE)
SNP-filter
filter SNP's
statmap
extraheer statistieken uit de foutoutput van 'maq map'
chrpt2snp
converteer het chr_rpt-bestand van dbSNP naar het .snp-bestand
ucsc2snp
converteer de SNP-dump van UCSC naar .snp-bestand
snelq2bfq
converteer fastq in batch
kat2paar
converteer gepaarde einde leest formaat
sv noem structurele variaties
indelpe
nabewerking van indelpe-uitvoer
Gebruik maq.pl online met onworks.net-services
