EngelsFransDuitsItaliaansPortugeesRussianSpaans

OnWorks-favicon

maskfeate - Online in de cloud

Voer maskfeate uit in de gratis hostingprovider van OnWorks via Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator of MAC OS online emulator

Dit is de opdracht maskfeate die kan worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider van OnWorks met behulp van een van onze meerdere gratis online werkstations zoals Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator of MAC OS online emulator

PROGRAMMA:

NAAM


maskfeat - Schrijf een reeks met gemaskeerde functies

KORTE INHOUD


maskerprestatie -volgorde vervolg [-Type snaar] [-verlagen toggle] -maskerchar snaar -outseq vervolg

maskerprestatie -Help

BESCHRIJVING


maskerprestatie is een commandoregelprogramma van EMBOSS (“the European Molecular Biology Open
softwarepakket"). Het maakt deel uit van de opdrachtgroep(en) "Bewerken, Functietabellen".

OPTIES


Invoer sectie
-volgorde vervolg

Extra sectie
-Type snaar
Standaard wordt elk kenmerk in de kenmerktabel met een type dat begint met 'herhalen' gemaskeerd.
U kunt dit instellen op elk type functie dat u wilt maskeren. Zien
http://www.ebi.ac.uk/embl/WebFeat/ voor een lijst van de EMBL-functietypes en zie
Bijlage A van de Swissprot gebruikershandleiding in http://www.expasy.org/sprot/userman.html
voor een lijst van de Swissprot-functietypen. Het type kan worden voorzien van een jokerteken door '*' te gebruiken. Indien
als u meer dan één type wilt maskeren, scheidt u hun namen met spaties of komma's, bijvoorbeeld:
*UTR herhalen* Standaardwaarde: herhalen*

-verlagen toggle
De regio kan worden 'gemaskeerd' door de reekstekens om te zetten in kleine letters, sommige
niet-EMBOSS-programma's zoals fasta kunnen dit interpreteren als een gemaskeerd gebied. De volgorde is
ongewijzigd, afgezien van de wijziging van de zaak. Misschien wilt u ervoor zorgen dat de hele reeks
is in hoofdletters voordat de gespecificeerde regio's worden gemaskeerd naar kleine letters met behulp van de
vlag '-avondmaal'. Standaardwaarde: N

-maskerchar snaar
Karakter dat moet worden gebruikt bij het maskeren. Standaard is 'X' voor eiwitsequenties, 'N' voor nucleïnezuur
sequenties. Als het maskerteken is ingesteld als SPACE-teken of een null-teken,
dan wordt de reeks 'gemaskeerd' door deze te veranderen in kleine letters, net als bij de
vlag '-kleine letters'. Standaardwaarde: @($(acdproteïne)?X:N)

uitgang sectie
-outseq vervolg

Maskfeate online gebruiken met onworks.net-services


Ad


Ad

Nieuwste Linux & Windows online programma's