mia-2dmyocard-icaseries - Online in de cloud

PROGRAMMA:

NAAM

mia-2dmyocard-icaseries - Voer een ICA-analyse uit op een reeks 2D-afbeeldingen

KORTE INHOUD

mia-2dmyocard-icaseries -i [Opties]

PRODUCTBESCHRIJVING

mia-2dmyocard-icaseries Dit programma wordt gebruikt om een ​​ICA uit te voeren op een reeks hartspiercellen
perfusiebeelden gegeven in een segmentatieset om synthetische referenties te creëren
kan worden gebruikt voor bewegingscorrectie door beeldregistratie. Als het de bedoeling is om een ​​volledige run te maken
bewegingscompensatie dan is het beter om mia-2dmyoica-nonrigid uit te voeren, aangezien dit programma dat is
in wezen hetzelfde zonder de registratiebits.

OPTIES

Bestand-IO
-i --in-file=(invoer, vereist); snaar
invoer perfusie dataset

-r --referenties=(uitvoer); snaar
Bestandsnaambasis voor de referentieafbeeldingen. Beeldtype en nummeringsschema zijn
genomen uit de invoerafbeeldingen.

-c --save-cropped=(uitvoer); snaar
sla de bijgesneden set van de originele set op in dit bestand, de afbeeldingsbestanden zullen gebruiken
de stam van de naam als bestandsnaambasis

--save-feature=(uitvoer); snaar
sla de functieafbeeldingen op die resulteren uit de ICA en enkele tussenliggende afbeeldingen
gebruikt voor de RV-LV-segmentatie met de opgegeven bestandsnaam als basis voor PNG-bestanden.
Sla ook de coëfficiënten op van de aanvankelijke beste en de uiteindelijke IC-menging
Matrix.

Help & Info
-V --verbose=waarschuwing
uitgebreide output, print berichten van een bepaald niveau en hogere prioriteiten.
Ondersteunde prioriteiten vanaf het laagste niveau zijn:
info ‐ Berichten op laag niveau
opsporen ‐ Functie-aanroep traceren
mislukken ‐ Rapporteer testfouten
waarschuwing ‐ Waarschuwingen
fout ‐ Meld fouten
debug ‐ Uitvoer debuggen
Bericht ‐ Normale berichten
fataal ‐ Rapporteer alleen fatale fouten

--auteursrechten
copyrightinformatie afdrukken

-h-help
print deze hulp

-? --gebruik
een korte help afdrukken

--versie
print het versienummer en sluit af

ICA
-C --componenten=0
ICA-componenten 0 = automatische schatting ICA-componenten 0 = automatisch
schatting

--normaliseren
genormaliseerde IC's

--geen-gemiddeldestrip
haal het gemiddelde niet uit de mengcurven

-s --segschaal=1.4
segmenteer en schaal het bijsnijdvak rond het LV (0=geen segmentatie)segment en
schaal het bijsnijdvak rond de LV (0=geen segmentatie)

-k --overslaan=0
sla afbeeldingen aan het begin van de serie over, net zoals bij andere
modaliteiten sla afbeeldingen aan het begin van de serie over zoals bij andere
modaliteiten

-m --max-ica-iter=400
maximum aantal iteraties in ICAmaximaal aantal iteraties in ICA

-E --segmethode=functies
Segmentatie methode:
delta-piek ‐ verschil van de piekverbeteringsbeelden
functionaliteiten ‐ functie afbeeldingen
delta-functie ‐ verschil van de functie-afbeeldingen

In behandeling
--draden=-1
Maximaal aantal te gebruiken threads voor verwerking. Dit aantal moet lager zijn
of gelijk aan het aantal logische processorcores in de machine. (-1:
automatische schatting). Maximaal aantal te gebruiken threads voor verwerking, This
getal moet lager zijn dan of gelijk zijn aan het aantal logische processorkernen in
de machine. (-1: automatische schatting).

VOORBEELD

Evalueer de synthetische referenties van set segment.set en sla ze op in refXXXX.??? door
met behulp van vijf onafhankelijke componenten en het overslaan van twee afbeeldingen. Standaard een selectiekader
rond de LV worden gesegmenteerd en geschaald met 1.4 en de bijgesneden afbeeldingen worden opgeslagen
cropXXXX.??? en er wordt een segmentatieset cropped.set gemaakt. Het afbeeldingsbestandstype??? is
afgetrokken van de invoerafbeeldingen in segment.set.

mia-2dmyocard-icaseries -i segment.set -r ref -o ref -k 2 -C 5

AUTEUR(s)

Gert Wolny

COPYRIGHT

Op deze software rust copyright (c) 1999-2015 Leipzig, Duitsland en Madrid, Spanje. Het komt
met ABSOLUUT GEEN GARANTIE en u mag het herdistribueren onder de voorwaarden van de GNU
ALGEMENE PUBLIEKE LICENTIE Versie 3 (of later). Voer voor meer informatie het programma uit met de
optie '--copyright'.

Gebruik mia-2dmyocard-icaseries online met behulp van onworks.net-services