mia-3dgetslice - Online in de cloud

PROGRAMMA:

NAAM

mia-3dgetslice - Extraheer segmenten uit een 3D-afbeelding.

KORTE INHOUD

mia-3dgetslice -i -o [Opties]

PRODUCTBESCHRIJVING

mia-3dgetslice Dit programma wordt gebruikt om 2D-plakken uit een 3D-dataset te extraheren en op te slaan
in afzonderlijke bestanden. Uitvoerbestanden worden genummerd op basis van hun segmentindex.

OPTIES

-i --in-file=(invoer, vereist); io
invoer afbeelding(en) om te filteren Voor ondersteunde bestandstypes zie
PLUGINS: 3dimage/io

-o --out-file=(uitvoer, vereist); io
uitvoerafbeelding(en). Als getal != 1 dan wordt dit als basisnaam gebruikt en zou dat ook moeten gebeuren
worden zonder extensie gegeven, aangezien dit gebaseerd zal zijn op de optie '--type'.
Als getal=1 dan wordt deze exacte bestandsnaam gebruikt. Voor ondersteund bestand
typen zie PLUGINS:2dimage/io

-t --type=png
uitvoerbestandstype voor nummer != 1
ondersteunde waarden zijn:( bmp, datapool, dicom, ex, jpg, png, rauw,
tyfus, uitzicht, )

-s --begin=0
start segmentnummerstart segmentnummer

-n --getal=1
aantal plakjes (alles=0)aantal plakjes (alles=0)

--ncijfers=4
minimumaantal cijfers van de bestandsnaamnummers (indien n != 1)minimumaantal
aantal cijfers van de bestandsnaamnummers (als n != 1)

-d --dir=xy
snijrichting (xy=axiaal, xz=coronaal, yz=saggitaal)
xz - verkrijg xz (coronale) plak
yz - verkrijg yz (saggitale) slice
xy - verkrijg een xy (axiale) plak

Help & Info
-V --verbose=waarschuwing
uitgebreide output, print berichten van een bepaald niveau en hogere prioriteiten.
Ondersteunde prioriteiten vanaf het laagste niveau zijn:
info ‐ Berichten op laag niveau
opsporen ‐ Functie-aanroep traceren
mislukken ‐ Rapporteer testfouten
waarschuwing ‐ Waarschuwingen
fout ‐ Meld fouten
debug ‐ Uitvoer debuggen
Bericht ‐ Normale berichten
fataal ‐ Rapporteer alleen fatale fouten

--auteursrechten
copyrightinformatie afdrukken

-h-help
print deze hulp

-? --gebruik
een korte help afdrukken

--versie
print het versienummer en sluit af

In behandeling
--draden=-1
Maximaal aantal te gebruiken threads voor verwerking. Dit aantal moet lager zijn
of gelijk aan het aantal logische processorcores in de machine. (-1:
automatische schatting). Maximaal aantal te gebruiken threads voor verwerking, This
getal moet lager zijn dan of gelijk zijn aan het aantal logische processorkernen in
de machine. (-1: automatische schatting).

PLUG-INS: 2dbeeld/io

bmp BMP 2D-beeld input/output ondersteuning

Erkende bestandsextensies: .BMP, .bmp

Ondersteunde elementtypen:
binaire data, unsigned 8 bit, unsigned 16 bit

datapool Virtuele IO van en naar de interne datapool

Erkende bestandsextensies: .@

dicom 2D-beeld io voor DICOM

Herkende bestandsextensies: .DCM, .dcm

Ondersteunde elementtypen:
ondertekend 16 bit, niet ondertekend 16 bit

EXR een 2dimage io-plug-in voor OpenEXR-afbeeldingen

Erkende bestandsextensies: .EXR, .exr

Ondersteunde elementtypen:
niet-ondertekende 32 bit, drijvende komma 32 bit

jpg een 2dimage io-plug-in voor jpeg-grijswaardenafbeeldingen

Erkende bestandsextensies: .JPEG, .JPG, .jpeg, .jpg

Ondersteunde elementtypen:
niet-ondertekende 8 bit

png een 2dimage io-plug-in voor png-afbeeldingen

Erkende bestandsextensies: .PNG, .png

Ondersteunde elementtypen:
binaire data, unsigned 8 bit, unsigned 16 bit

rauw Ondersteuning voor RAW 2D-beelduitvoer

Herkende bestandsextensies: .RAW, .raw

Ondersteunde elementtypen:
binaire gegevens, ondertekend 8 bit, niet ondertekend 8 bit, ondertekend 16 bit, niet ondertekend 16 bit,
ondertekend 32 bit, unsigned 32 bit, floating point 32 bit, floating point 64
beetje

tif TIFF 2D-beeld invoer/uitvoer ondersteuning

Herkende bestandsextensies: .TIF, .TIFF, .tif, .tiff

Ondersteunde elementtypen:
binaire data, unsigned 8 bit, unsigned 16 bit, unsigned 32 bit

vergezicht een 2dimage io-plug-in voor vista-afbeeldingen

Erkende bestandsextensies: .V, .VISTA, .v, .vista

Ondersteunde elementtypen:
binaire gegevens, ondertekend 8 bit, niet ondertekend 8 bit, ondertekend 16 bit, niet ondertekend 16 bit,
ondertekend 32 bit, unsigned 32 bit, floating point 32 bit, floating point 64
beetje

PLUG-INS: 3dbeeld/io

analyseren Analyseer 7.5-afbeelding

Herkende bestandsextensies: .HDR, .hdr

Ondersteunde elementtypen:
niet-ondertekend 8 bit, ondertekend 16 bit, ondertekend 32 bit, drijvende komma 32 bit,
drijvende komma 64 bit

datapool Virtuele IO van en naar de interne datapool

Erkende bestandsextensies: .@

dicom Dicom-beeldserie als 3D

Herkende bestandsextensies: .DCM, .dcm

Ondersteunde elementtypen:
ondertekend 16 bit, niet ondertekend 16 bit

hdf5 HDF5 3D-beeld IO

Erkende bestandsextensies: .H5, .h5

Ondersteunde elementtypen:
binaire gegevens, ondertekend 8 bit, niet ondertekend 8 bit, ondertekend 16 bit, niet ondertekend 16 bit,
ondertekend 32 bit, niet ondertekend 32 bit, ondertekend 64 bit, niet ondertekend 64 bit, zwevend
punt 32 bit, drijvende komma 64 bit

inria INRIA-afbeelding

Erkende bestandsextensies: .INR, .inr

Ondersteunde elementtypen:
ondertekend 8 bit, niet ondertekend 8 bit, ondertekend 16 bit, niet ondertekend 16 bit, ondertekend 32
bit, niet-ondertekend 32 bit, drijvende komma 32 bit, drijvende komma 64 bit

mhd MetaIO 3D-beeld IO met behulp van de VTK-implementatie (experimenteel).

Erkende bestandsextensies: .MHA, .MHD, .mha, .mhd

Ondersteunde elementtypen:
ondertekend 8 bit, niet ondertekend 8 bit, ondertekend 16 bit, niet ondertekend 16 bit, ondertekend 32
bit, niet-ondertekend 32 bit, drijvende komma 32 bit, drijvende komma 64 bit

handig NIFTI-1 3D-beeld IO

Erkende bestandsextensies: .NII, .nii

Ondersteunde elementtypen:
ondertekend 8 bit, niet ondertekend 8 bit, ondertekend 16 bit, niet ondertekend 16 bit, ondertekend 32
bit, niet-ondertekende 32 bit, ondertekende 64 bit, niet-ondertekende 64 bit, drijvende komma 32
bit, drijvende komma 64 bit

vff VFF Zon-rasterformaat

Herkende bestandsextensies: .VFF, .vff

Ondersteunde elementtypen:
niet-ondertekend 8 bit, ondertekend 16 bit

vergezicht 3D-weergave

Erkende bestandsextensies: .V, .VISTA, .v, .vista

Ondersteunde elementtypen:
binaire gegevens, ondertekend 8 bit, niet ondertekend 8 bit, ondertekend 16 bit, niet ondertekend 16 bit,
ondertekend 32 bit, unsigned 32 bit, floating point 32 bit, floating point 64
beetje

vii 3D beeld VTK-XML in- en output (experimenteel).

Erkende bestandsextensies: .VTI, .vti

Ondersteunde elementtypen:
ondertekend 8 bit, niet ondertekend 8 bit, ondertekend 16 bit, niet ondertekend 16 bit, ondertekend 32
bit, niet-ondertekend 32 bit, drijvende komma 32 bit, drijvende komma 64 bit

vtk 3D VTK beeld legacy in- en output (experimenteel).

Erkende bestandsextensies: .VTK, .VTKIMAGE, .vtk, .vtkimage

Ondersteunde elementtypen:
binaire gegevens, ondertekend 8 bit, niet ondertekend 8 bit, ondertekend 16 bit, niet ondertekend 16 bit,
ondertekend 32 bit, unsigned 32 bit, floating point 32 bit, floating point 64
beetje

VOORBEELD

Bewaar 5 coronale plakjes, beginnend bij plak 120 coronalXXXX.png van image.v.

mia-3dgetslice -i afbeelding.v -o coronale -t png -n 5 -s 120

AUTEUR(s)

Gert Wolny

COPYRIGHT

Op deze software rust copyright (c) 1999-2015 Leipzig, Duitsland en Madrid, Spanje. Het komt
met ABSOLUUT GEEN GARANTIE en u mag het herdistribueren onder de voorwaarden van de GNU
ALGEMENE PUBLIEKE LICENTIE Versie 3 (of later). Voer voor meer informatie het programma uit met de
optie '--copyright'.

Gebruik mia-3dgetslice online met behulp van onworks.net-services