minccmp - Online in de cloud

PROGRAMMA:

NAAM

minccmp - vergelijk een of meer minc-bestanden met behulp van comparator-operators

KORTE INHOUD

minccmp [ ] [ ...]

PRODUCTBESCHRIJVING

minccmp berekent eenvoudige statistische maatregelen tussen twee minc-bestanden of meer door
het vergelijken van alle volgende bestanden met de eerste. De resultaten voor elk volgend bestand zijn dan
in orde teruggebracht. Standaard worden alle statistieken berekend. Als specifieke statistieken zijn
aangevraagd via een opdrachtregeloptie, worden alleen de gevraagde statistieken afgedrukt.

Een erg handige functie van dit programma is de mogelijkheid om de set voxels te beperken
opgenomen in de statistische berekening, hetzij door het bereik van opgenomen waarden te beperken
(-floor, -ceil of -range), of door een maskerbestand (-mask) met een beperkt bereik te gebruiken.

De vergelijkingsstatistieken die beschikbaar zijn in minccmp worden hieronder gegeven. Merk op dat twee van deze
(-xcorr en -zscore) komen zeer dicht in de buurt van wat wordt gebruikt in minctracc.

OPTIES

Houd er rekening mee dat opties in verkorte vorm kunnen worden opgegeven (zolang ze uniek zijn) en
kan overal op de opdrachtregel worden gegeven.

Algemeen opties

-klodder
Een bestaand bestand overschrijven.

-geen klomp
Overschrijf een bestaand bestand niet (standaard).

-debuggen Dump veel extra informatie (voor als de zaken in de war raken).

-uitgebreid
Print extra informatie uit (meer dan standaard).

-rustig Print alleen de gevraagde nummers uit

-max_buffer_grootte_in_kb grootte
Specificeer de maximale grootte van de interne buffers (in kbytes). Standaard is 4 MB.

-controleer_afmetingen
Controleer of alle invoerbestanden overeenkomende steekproeven hebben in werelddimensies (standaard).

-nocheck_afmetingen
Negeer eventuele verschillen in sampling van werelddimensies voor invoerbestanden.

Volume reeks opties

-verdieping Min
Een ondergrens voor gegevensbereiken die moeten worden opgenomen in statistische berekeningen.

-plafond max
Een bovengrens voor gegevensbereiken die moeten worden opgenomen in statistische berekeningen.

-bereik Min,max
Een onder- en bovengrens voor het gegevensbereik dat in de statistieken moet worden opgenomen.

-masker bestandsnaam.mnc
Naam van het bestand dat moet worden gebruikt voor het maskeren van gegevens in statistische berekeningen.

Basic statistiek

-allemaal Bereken alle statistische maatregelen. Dit is de standaardinstelling.

-sq Druk het verschil in som in het kwadraat af tussen twee invoerbestanden
SSQ = Som( (AB)^2 )

-rmse Druk de Root Mean Squared Error tussen twee invoerbestanden af
RMSE = sqrt( 1/n * Som((AB)^2))

-xcorr Druk de kruiscorrelatie tussen twee invoerbestanden af
XCORR = Som((A*B)^2) / (sqrt(Som(A^2)) * sqrt(Som(B^2))

-zscore
Print het z-score verschil tussen twee invoerbestanden
ZSCORE = Som( |((A - gemiddelde(A)) / stdev(A)) -
((B - gemiddelde(B)) / stdev(B))| ) / N

-gelijkenis
Bereken de verwarringsmatrix, ervan uitgaande dat de volumewaarden a vertegenwoordigen
discrete klasse van mogelijke waarden. De maximale labelwaarde is momenteel beperkt tot
tien (10). Drukt de Dice-gelijkenisstatistiek af, evenals specificiteit, gevoeligheid,
nauwkeurigheid en kappa voor elke klasse en voor de totale volumes.

Algemeen opties For allen commando's:

-Help Druk een samenvatting van de opdrachtregelopties af en sluit af.

-versie
Druk het versienummer van het programma af en sluit af.

Gebruik minccmp online met behulp van onworks.net-services