Dit is de Linux-app met de naam ARDEN die online in Linux moet worden uitgevoerd en waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als ARDEN.zip. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer online deze app met de naam ARDEN uit om gratis online in Linux te draaien met OnWorks.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start de OnWorks Linux online of Windows online emulator of MACOS online emulator vanaf deze website.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Linux-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie, installeer hem en voer hem uit.
ARDEN om online onder Linux te draaien
Ad
PRODUCTBESCHRIJVING
We introduceren ARDEN (Artificial Reference Driven Estimation of false positives in NGS data), een nieuwe benchmark die foutpercentages schat op basis van echte experimentele metingen en een aanvullend gegenereerd kunstmatig referentiegenoom. Het maakt de berekening van foutpercentages specifiek voor een dataset en de constructie van een ROC-curve mogelijk. Daardoor kan het worden gebruikt om parameters voor read mappers te optimaliseren, om read mappers voor een specifiek probleem te selecteren of ook om uitlijningen te filteren op basis van kwaliteitsschatting.Gebruikersinterface
Opdrachtregel
Programmeertaal
Python
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/arden/. Het is gehost in OnWorks, zodat het op de gemakkelijkste manier online kan worden uitgevoerd vanaf een van onze gratis besturingssystemen.