Dit is de Linux-app met de naam BiomeNet die online in Linux moet worden uitgevoerd en waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als BiomeNet.zip. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer deze app met de naam BiomeNet online uit om gratis online in Linux te draaien met OnWorks.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start de OnWorks Linux online of Windows online emulator of MACOS online emulator vanaf deze website.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Linux-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie, installeer hem en voer hem uit.
BiomeNet om online onder Linux te draaien
Ad
PRODUCTBESCHRIJVING
Metagenomics levert enorme aantallen microbiële sequenties op die een metabolische functie kunnen krijgen. Het gebruik van dergelijke gegevens om metabolische divergentie op gemeenschapsniveau af te leiden, wordt belemmerd door het ontbreken van een geschikt statistisch kader. Hier beschrijven we een nieuw hiërarchisch Bayesiaans model, genaamd BiomeNet (Bayesiaanse inferentie van metabole netwerken), voor het afleiden van differentiële prevalentie van metabole netwerken onder microbiële gemeenschappen. Om de structuur van metabole interacties op gemeenschapsniveau af te leiden, past BiomeNet een modelleringskader met gemengde leden toe op informatie over de overvloed aan enzymen. Het basisidee is dat de mengselcomponenten van het model (metabolische reacties, subnetwerken en netwerken) worden gedeeld door alle groepen (microbioommonsters), maar de mengselverhoudingen variëren van groep tot groep. Via dit raamwerk kan het model geneste structuren binnen de gegevens vastleggen. BiomeNet is uniek in het modelleren van elk metagenoommonster als een mengsel van complexe metabole systemen (metabosystemen).Toehoorders
Science / Research
Programmeertaal
C++, S/R
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/biomenet/. Het is gehost in OnWorks om op een gemakkelijkste manier online te kunnen worden uitgevoerd vanuit een van onze gratis besturingssystemen.