Dit is de Linux-app genaamd FIAP waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als FIAP.tar.gz. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer deze app met de naam FIAP gratis uit met OnWorks.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start de OnWorks Linux online of Windows online emulator of MACOS online emulator vanaf deze website.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Linux-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie, installeer hem en voer hem uit.
FIAP
Ad
PRODUCTBESCHRIJVING
FIAP (Fully Integrated Annotation Pipeline) is een snelle annotatiepijplijn voor bacteriële genoom-multithreading, geschreven in Perl, die genen detecteert die coderen voor eiwitten, tRNA's en rRNA's (5S, 16S en 23S). Met FIAP kunnen gebruikers ook een oneindig aantal aangepaste databases opnemen. Deze functie is uiterst waardevol omdat gebruikers hierdoor een persoonlijke ‘smaak’ aan de annotatie kunnen toevoegen en het proces voor een specifiek bacterieel genoom kunnen optimaliseren. FIAP kan enkele en meerdere sequenties annoteren, waardoor gebruikers in één stap bijvoorbeeld concept-genoomcontigs of verschillende genomen die in een multi-fasta-bestand zijn samengevoegd, kunnen annoteren.
FIAP werkt op alle UNIX-achtige besturingssystemen (getest op Ubuntu 14.04 LTS en Mac OS 10.9.4).
Toehoorders
Science / Research
Gebruikersinterface
Console/terminal
Programmeertaal
Perl
Categorieën
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/fiap/. Het is gehost in OnWorks zodat het op de eenvoudigste manier online kan worden uitgevoerd vanaf een van onze gratis besturingssystemen.
