Dit is de Linux-app met de naam High-Throughput Tabular Data Processor waarvan de nieuwste release kan worden gedownload als htdpinstaller.exe. Het kan online worden uitgevoerd in de gratis hostingprovider OnWorks voor werkstations.
Download en voer deze app met de naam High-Throughput Tabular Data Processor met OnWorks gratis online uit.
Volg deze instructies om deze app uit te voeren:
- 1. Download deze applicatie op uw pc.
- 2. Voer in onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX in met de gebruikersnaam die u wilt.
- 3. Upload deze applicatie in zo'n bestandsbeheerder.
- 4. Start de OnWorks Linux online of Windows online emulator of MACOS online emulator vanaf deze website.
- 5. Ga vanuit het OnWorks Linux-besturingssysteem dat u zojuist hebt gestart naar onze bestandsbeheerder https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX met de gewenste gebruikersnaam.
- 6. Download de applicatie, installeer hem en voer hem uit.
SCREENSHOTS
Ad
Gegevensverwerker met hoge doorvoer in tabelvorm
PRODUCTBESCHRIJVING
HIGH-THROUGHPUT TABULAR DATA PROCESSOR (HTDP) is een Java-toepassing die is bedoeld voor het vergemakkelijken van gegevensverkenning en -reductietaken in grote tekstbestanden die het resultaat zijn van high-throughput-technologieën, bijvoorbeeld massaal parallelle sequencing of microarrays. De software is geoptimaliseerd voor microarray en diepe parallelle sequencing-gegevens, maar kan alle door tekens gescheiden gegevenssets in tabelvorm accepteren. HTDP kan ook Variant Call Format (VCF)-bestanden importeren, verwerken en converteren ver. 4.0, 4.1 en 4.2 (http://samtools.github.io/hts-specs/VCFv4.2.pdf).
HTDP biedt snelle filterfunctionaliteit en kan gegevens verwerken die bestaan uit enkele of meerdere invoerbestanden.
Visum: Madanecki P, Bałut M, Buckley PG, Ochocka JR, Bartoszewski R, Crossman DK, et al. (2018) High-Throughput Tabular Data Processor – Platformonafhankelijke grafische tool voor het verwerken van grote datasets. PLoS EEN 13(2): e0192858. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0192858
Kenmerken
- werkt op alle door tekens gescheiden kolomgegevens (bijv. BED, GFF, GTF, WIG, VCF)
- voeg gegevensbestanden in tabelvorm verticaal en horizontaal samen
- voeg alle gegevensbestanden in tabelvorm samen met behulp van de genoomlocatie of gemeenschappelijke kolom(men)
- onbeperkte filter- en gegevensreductiemogelijkheden
- verschillende bestanden qua formaat en inhoud kunnen tegelijkertijd worden geanalyseerd
Programmeertaal
Java
Categorieën
Dit is een applicatie die ook kan worden opgehaald van https://sourceforge.net/projects/htdp/. Het is gehost in OnWorks, zodat het op de gemakkelijkste manier online kan worden uitgevoerd vanaf een van onze gratis besturingssystemen.
